| 致谢 | 第6-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1. 文献综述 | 第14-25页 |
| 1.1 希瓦氏菌 | 第14-15页 |
| 1.2 细菌中硝酸/亚硝酸还原系统的研究 | 第15-23页 |
| 1.2.1 模式菌株E. coli中硝酸/亚硝酸还原的途径及其调控机制 | 第17-20页 |
| 1.2.2 希瓦氏菌S. oneidensis中硝酸/亚硝酸还原的研究现状 | 第20-22页 |
| 1.2.3 有氧条件下细菌进行硝酸/亚硝酸呼吸的研究现状 | 第22-23页 |
| 1.3 本研究的背景、内容及意义 | 第23-25页 |
| 2. Shewanella oneidensis利用硝酸/亚硝酸进行呼吸的适合的培养方法 | 第25-36页 |
| 2.1 材料 | 第26页 |
| 2.1.1 菌株和试剂 | 第26页 |
| 2.2 方法 | 第26-29页 |
| 2.2.1 微生物连续培养 | 第26-27页 |
| 2.2.2 微生物分批培养 | 第27页 |
| 2.2.3 硝酸/亚硝酸浓度的测定 | 第27-28页 |
| 2.2.4 基因突变株ΔcymA、ΔnapA和ΔnrfA及其回补菌株的构建 | 第28-29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-34页 |
| 2.3.1 恒化器(控制型连续培养)培养条件下S. oneidensis利用硝酸/亚硝酸的生长情况 | 第29-31页 |
| 2.3.2 非控制型分批培养条件下S. oneidensis利用硝酸/亚硝酸的生长情况 | 第31-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34-36页 |
| 3. 二元系统NarP-NarQ对S. oneidensis硝酸/亚硝酸呼吸的调控 | 第36-56页 |
| 3.1 材料 | 第37-38页 |
| 3.1.1 菌株和试剂 | 第37-38页 |
| 3.2 方法 | 第38-43页 |
| 3.2.1 β-半乳糖苷酶活性测定 | 第38页 |
| 3.2.2 定量RT-PCR(qRT-PCR)分析 | 第38-39页 |
| 3.2.3 蛋白免疫印迹实验 | 第39页 |
| 3.2.4 蛋白位点特异性突变 | 第39-40页 |
| 3.2.5 克隆、表达和纯化蛋白NarP、NarP(D57N)、NarQ51-585以及SO1860 | 第40-41页 |
| 3.2.6 体外蛋白的磷酸化以及磷酸化转移检测 | 第41-42页 |
| 3.2.7 凝胶电泳迁移率实验中(EMSA-Electrophoretic Motility Shift Assay) | 第42页 |
| 3.2.8 基因突变株△narP和△sol860及其回补菌株的构建 | 第42页 |
| 3.2.9 硝酸和亚硝酸浓度检测 | 第42-43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-54页 |
| 3.3.1 有氧条件下,NapA仅被硝酸诱导得以转录表达而NrfA既能被硝酸又能被亚硝酸诱导得以转录表达 | 第43-45页 |
| 3.3.2 S.oneidensis拥有一个NarP-NarQ二元系统 | 第45-49页 |
| 3.3.3 S.oneidensis的DNA-结合调节因子NarP第57位的天冬氨酸的磷酸化对NarP的活性至关重要 | 第49-51页 |
| 3.3.4 S. oneidensis二元系统NarP-NarQ对NRF的调控要紧于其对NAP的调控 | 第51-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-56页 |
| 4. 全局调控因子Crp激活二元系统NarP-NarQ的表达,同时也直接调控NRF和NAP | 第56-65页 |
| 4.1 材料 | 第56-57页 |
| 4.1.1 菌株和试剂 | 第56-57页 |
| 4.2 方法 | 第57-58页 |
| 4.2.1 qRT-PCR | 第57页 |
| 4.2.2 蛋白免疫印迹 | 第57页 |
| 4.2.3 硝酸/亚硝酸浓度测定 | 第57-58页 |
| 4.3 结果与分析 | 第58-63页 |
| 4.3.1 全局调控因子ArcA在S.oneidensis硝酸/亚硝酸呼吸中的作用 | 第58页 |
| 4.3.2 全局调控因子Crp和Fnr对硝酸/亚硝酸的应答性 | 第58-60页 |
| 4.3.3 全局调控因子Crp和Fnr在S oneidensis硝酸/亚硝酸呼吸中的作用 | 第60-63页 |
| 4.4 讨论 | 第63-65页 |
| 5 论文总结 | 第65-67页 |
| 5.1 主要研究结论 | 第65页 |
| 5.2 创新之处 | 第65-66页 |
| 5.3 不足与展望 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-83页 |
| 附：作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第83页 |
