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牛Meg9基因的序列预测与分析、可变剪切体的表达及印记状态研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 引言第9-19页
    1.1 基因组印记的发现第9页
    1.2 印记基因的特征第9-10页
    1.3 印记基因的调控模式第10-13页
        1.3.1 DNA 甲基化第10-11页
        1.3.2 组蛋白修饰第11页
        1.3.3 X 染色体失活第11-12页
        1.3.4 MicroRNA第12-13页
    1.4 基因组印记的生物学意义第13-14页
        1.4.1 印记异常与遗传疾病第13页
        1.4.2 基因组印记与动物体细胞核移植第13-14页
        1.4.3 印记基因与家畜遗传育种第14页
    1.5 印记基因的鉴定第14-15页
    1.6 研究基因第15-19页
        1.6.1 Dlk1-Dio3 印记区域研究现状第15-16页
        1.6.2 Dlk1-Dio3 印记区域的 microRNA 簇第16-17页
        1.6.3 Meg9 基因研究现状第17页
        1.6.4 研究内容及意义第17-19页
2 材料与方法第19-28页
    2.1 实验材料第19-21页
        2.1.1 牛组织样品第19页
        2.1.2 主要试剂、试剂盒第19页
        2.1.3 主要仪器和设备第19-20页
        2.1.4 试剂配制第20-21页
        2.1.5 生物信息学网站和分析软件第21页
    2.2 实验方法第21-23页
        2.2.1 牛组织 RNA 的提取第21-22页
        2.2.2 牛组织 RNA 的纯化第22-23页
        2.2.3 反转录合成 cDNA第23页
        2.2.4 牛 Meg9 基因 cDNA 序列的获得第23页
    2.3 牛 Meg9 基因可变剪切表达及结构分析第23-24页
        2.3.1 GAPDH 和目的基因引物设计第23-24页
        2.3.2 牛 Meg9 基因可变剪切表达第24页
    2.4 牛 Meg9 基因 SNP 位点寻找第24-27页
        2.4.1 牛基因组 DNA 的提取第24-25页
        2.4.2 基因组 DNA 的琼脂糖检测第25页
        2.4.3 基因组 DNA 的纯度检测第25页
        2.4.4 引物设计及 PCR 扩增第25-26页
        2.4.5 PCR 产物纯化与回收第26页
        2.4.6 DNA 测序确定杂合子第26-27页
    2.5 牛 Meg9 基因等位基因特异性表达第27-28页
3 结果与分析第28-36页
    3.1 总 RNA 的提取质量第28页
    3.2 牛 Meg9 基因序列预测及结构分析第28-29页
    3.3 Meg9 基因结构及可变剪切分析第29-30页
    3.4 牛 Meg9 基因序列分析第30-33页
        3.4.1 牛 Meg9 基因和其他物种的同源性及进化树分析第30页
        3.4.2 牛 Meg9 基因潜在的启动子区预测及转录因子结合位点预测第30-31页
        3.4.3 牛 Meg9 基因开放阅读框的预测第31-32页
        3.4.4 牛 Meg9 基因启动子及内含子上 CpG 岛预测第32-33页
        3.4.5 Meg9 基因启动子及内含子上重复元件分析第33页
    3.5 Meg9 基因的可变剪切表达第33-34页
    3.6 Meg9 基因的 SNP 位点确定第34-35页
    3.7 牛 Meg9 基因的印记状态分析第35-36页
4 讨论第36-38页
    4.1 牛 Meg9 基因的结构可变剪切分析第36页
    4.2 牛 Meg9 基因组织特异性分析第36页
    4.3 牛 Meg9 基因的印记状态分析第36-38页
5 结论第38-39页
参考文献第39-44页
在读期间发表的论文第44-45页
简历第45-46页
致谢第46-47页

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