摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
缩略语表 | 第9-10页 |
1 绪论 | 第10-17页 |
1.1 课题研究的背景及意义 | 第10-12页 |
1.1.1 蛋白质超二级结构研究的背景及意义 | 第10-11页 |
1.1.2 恶性疟原虫线粒体蛋白研究的背景及意义 | 第11-12页 |
1.2 5类简单蛋白质超二级结构和β-发夹模体的简介 | 第12-13页 |
1.3 国内外研究现状 | 第13-15页 |
1.3.1 蛋白质超二级结构的研究现状 | 第13-14页 |
1.3.2 恶性疟原虫线粒体蛋白的研究现状 | 第14-15页 |
1.4 论文主要工作成果 | 第15页 |
1.5 论文组织安排 | 第15-17页 |
2 理论预测 | 第17-21页 |
2.1 统计分布 | 第17页 |
2.2 预测算法 | 第17-19页 |
2.2.1 二次判别法(QDA) | 第17-18页 |
2.2.2 支持向量机算法(SVM) | 第18页 |
2.2.3 随机森林算法(RF) | 第18-19页 |
2.3 算法的检验与评价 | 第19-21页 |
3 蛋白质超二级结构的预测 | 第21-31页 |
3.1 数据集的构建 | 第21-22页 |
3.1.1 5类简单蛋白质超二级结构数据集的构建 | 第21-22页 |
3.1.2 β-发夹模体数据集的构建 | 第22页 |
3.2 特征参量的提取 | 第22页 |
3.2.1 化学位移信息参量(CS_S) | 第22页 |
3.2.2 20种氨基酸组份信息参量(AAC) | 第22页 |
3.3 5类简单蛋白质超二级结构的预测 | 第22-26页 |
3.3.1 二次判别法对5类简单蛋白质超二级结构的预测 | 第24-25页 |
3.3.2 支持向量机对5类简单蛋白质超二级结构的预测 | 第25-26页 |
3.3.3 结论 | 第26页 |
3.4 β-发夹模体的预测 | 第26-31页 |
3.4.1 二次判别法对β-发夹模体的预测 | 第28-29页 |
3.4.2 支持向量机对β-发夹模体的预测 | 第29页 |
3.4.3 随机森林对β-发夹模体的预测 | 第29页 |
3.4.4 结论 | 第29-31页 |
4 疟原虫线粒体蛋白的预测 | 第31-35页 |
4.1 数据集的构建 | 第31页 |
4.2 特征参量的提取 | 第31-32页 |
4.2.1 蛋白质3种二级结构组份信息参量(PSS) | 第31页 |
4.2.2 20种氨基酸组份信息参量(AAC) | 第31页 |
4.2.3 400种二肽组份信息参量(DC) | 第31-32页 |
4.3 疟原虫线粒体蛋白的预测 | 第32-35页 |
4.3.1 支持向量机对疟原虫线粒体蛋白的预测 | 第32-34页 |
4.3.2 结论 | 第34-35页 |
5 总结与展望 | 第35-38页 |
5.1 总结 | 第35-36页 |
5.1.1 蛋白质超二级结构总结 | 第35页 |
5.1.2 疟原虫线粒体蛋白总结 | 第35-36页 |
5.2 展望 | 第36-38页 |
5.2.1 蛋白质超二级结构展望 | 第36页 |
5.2.2 疟原虫线粒体蛋白展望 | 第36-38页 |
致谢 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-48页 |
作者简介 | 第48页 |