| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-22页 |
| ·研究意义 | 第9-10页 |
| ·生物信息学研究现状 | 第10-15页 |
| ·生物信息学的产生与发展 | 第10-12页 |
| ·生物信息学的研究目标与内容 | 第12-14页 |
| ·线粒体 DNA 研究现状 | 第14-15页 |
| ·序列分析的研究进展 | 第15-19页 |
| ·序列分析算法 | 第15-17页 |
| ·国内外序列分析软件介绍与特点比较 | 第17-19页 |
| ·生物信息学编程语言 | 第19-20页 |
| ·编程语言的发展 | 第19页 |
| ·常用生物信息学编程语言及其特点 | 第19-20页 |
| ·论文的内容和组织结构 | 第20-22页 |
| 第二章 线粒体 DNA 序列本地数据库的构建 | 第22-31页 |
| ·生物信息学数据库介绍 | 第22-25页 |
| ·生物信息学数据库现状 | 第22-24页 |
| ·网络序列数据库服务 | 第24-25页 |
| ·国内序列数据库的发展 | 第25页 |
| ·存在的问题 | 第25页 |
| ·线粒体DNA 本地数据库的设计 | 第25-30页 |
| ·设计原则 | 第25-27页 |
| ·体系结构 | 第27-28页 |
| ·本地库序列的整合 | 第28页 |
| ·库文件优化 | 第28-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 本地 BLAST 实现与线粒体 DNA 序列可视化 | 第31-43页 |
| ·BLAST 算法 | 第31-33页 |
| ·BLAST 算法简介 | 第31-32页 |
| ·BLAST 核心算法 | 第32-33页 |
| ·查询序列本地BLAST 实现 | 第33-37页 |
| ·创建格式化的本地数据库文件 | 第33-35页 |
| ·本地 BLAST 接口程序设计 | 第35-37页 |
| ·线粒体DNA 功能域划分与可视化的实现 | 第37-42页 |
| ·获取序列数据与功能域的划分标准 | 第37-39页 |
| ·查询序列功能域的划分与着色 | 第39-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 实例测试 | 第43-52页 |
| ·测试程序介绍 | 第43-47页 |
| ·用户界面 | 第43-45页 |
| ·MitoEditor 的基本功能 | 第45-47页 |
| ·程序特点 | 第47页 |
| ·实验设计 | 第47-52页 |
| ·基本思路 | 第47页 |
| ·查询序列选取 | 第47-48页 |
| ·实验步骤 | 第48-50页 |
| ·实验结果分析 | 第50-52页 |
| 第五章 总结 | 第52-54页 |
| ·研究工作总结 | 第52页 |
| ·不足与进一步的工作 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第58页 |