| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-25页 |
| 1.1 大豆重要农艺性状遗传研究进展 | 第17-20页 |
| 1.1.1 大豆遗传图谱构建 | 第18页 |
| 1.1.2 株型性状（株高、主茎节数及分枝数）改良研究进展 | 第18-19页 |
| 1.1.3 产量及其构成因子遗传研究进展 | 第19页 |
| 1.1.4 品质性状遗传研究进展 | 第19-20页 |
| 1.2 全基因组关联分析在大豆遗传育种中的应用 | 第20-23页 |
| 1.2.1 连锁不平衡的概念及衡量 | 第20页 |
| 1.2.2 影响连锁不平衡的因素 | 第20-21页 |
| 1.2.3 关联分析的方法与策略 | 第21页 |
| 1.2.4 关联分析在大豆遗传研究中的应用 | 第21-22页 |
| 1.2.5 关联分析应用展望 | 第22-23页 |
| 1.3 大豆骨干亲本十胜长叶在大豆育种改良中的应用 | 第23-24页 |
| 1.4 本研究的内容、目的和意义 | 第24页 |
| 1.5 研究技术路线 | 第24-25页 |
| 第二章 大豆农艺性状的表型分析 | 第25-56页 |
| 2.1 材料和方法 | 第25-26页 |
| 2.1.1 研究材料 | 第25页 |
| 2.1.2 方法 | 第25-26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-54页 |
| 2.2.1 农艺性状表型联合方差分析 | 第26-28页 |
| 2.2.2 农艺性状相关分析 | 第28-29页 |
| 2.2.3 主成分分析 | 第29-31页 |
| 2.2.4 品种的主成分得分及综合评价 | 第31-38页 |
| 2.2.5 品种的稳定性分析 | 第38-52页 |
| 2.2.6 品种的聚类分析 | 第52-54页 |
| 2.3 讨论 | 第54-56页 |
| 第三章 大豆农艺性状的关联分析 | 第56-81页 |
| 3.1 材料和方法 | 第56-57页 |
| 3.1.1 DNA提取 | 第56页 |
| 3.1.2 SNP分型 | 第56页 |
| 3.1.3 群体的遗传多样性分析 | 第56-57页 |
| 3.1.4 群体结构及亲缘关系分析 | 第57页 |
| 3.1.5 群体连锁不平衡分析 | 第57页 |
| 3.1.6 群体单倍型分析 | 第57页 |
| 3.1.7 全基因组关联分析 | 第57页 |
| 3.2 结果与分析 | 第57-72页 |
| 3.2.1 遗传多样性 | 第57-60页 |
| 3.2.2 群体结构和遗传关系分析 | 第60-61页 |
| 3.2.3 全基因组的连锁不平衡分析 | 第61-63页 |
| 3.2.4 全基因组关联分析 | 第63-72页 |
| 3.3 主成分全基因组关联分析 | 第72-73页 |
| 3.4 单倍型关联分析 | 第73-76页 |
| 3.4.1 与农艺性状显著关联单倍型 | 第73-75页 |
| 3.4.2 关联单倍型与关联SNP位点之间的关系 | 第75-76页 |
| 3.5 讨论 | 第76-81页 |
| 3.5.1 群体遗传多样性及亲缘关系对关联分析结果的影响 | 第76-77页 |
| 3.5.2 群体结构对关联分析的影响 | 第77页 |
| 3.5.3 群体LD水平对关联结果的影响 | 第77-78页 |
| 3.5.4 关联分析解析力 | 第78-79页 |
| 3.5.5 两密度环境稳定关联位点 | 第79页 |
| 3.5.6 性状相关的遗传基础 | 第79-81页 |
| 第四章 十胜长叶在分子水平对衍生品种的贡献 | 第81-89页 |
| 4.1 材料与方法 | 第81页 |
| 4.2 结果与分析 | 第81-87页 |
| 4.2.1 含多个优异等位变异品种的筛选 | 第81-83页 |
| 4.2.2 十胜长叶位点对衍生品种的贡献 | 第83-87页 |
| 4.3 讨论 | 第87-89页 |
| 第五章 全文结论 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-102页 |
| 附录 | 第102-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 作者简介 | 第132页 |
