| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第14-34页 |
| 1.1 食管癌基础研究 | 第14-19页 |
| 1.1.1 食管癌的流行病学特征 | 第14页 |
| 1.1.2 食管癌发病因素的研究 | 第14-15页 |
| 1.1.3 食管癌家族聚集性 | 第15-16页 |
| 1.1.4 食管癌移民高发易感性 | 第16-17页 |
| 1.1.5 食管癌遗传易感性 | 第17-19页 |
| 1.2 生物信息学、生物信息数据库及生物信息数据库的查询与搜索 | 第19-22页 |
| 1.2.1 生物信息学 | 第19-21页 |
| 1.2.2 生物信息数据库 | 第21页 |
| 1.2.3 生物信息数据库的查询与搜索 | 第21-22页 |
| 1.3 单核苷酸多态性研究进展 | 第22-24页 |
| 1.3.1 SNP 与疾病易感性 | 第22页 |
| 1.3.2 SNP 的检测技术 | 第22-23页 |
| 1.3.3 SNP 数据库的利用 | 第23-24页 |
| 1.4 组蛋白三甲基脱甲基酶（KDM4C）基因研究进展 | 第24-26页 |
| 1.4.1 KDM4C 基因及其产物的结构与功能 | 第25页 |
| 1.4.2 KDM4C 与肿瘤形成的关系 | 第25-26页 |
| 1.5 基质金属蛋白酶(MMPs)研究进展 | 第26-33页 |
| 1.5.1 基质金属蛋白酶的分类 | 第26-28页 |
| 1.5.2 MMPs 的结构和功能 | 第28-29页 |
| 1.5.3 MMPs 与食管癌的研究进展 | 第29-30页 |
| 1.5.4 基质金属蛋白酶3(MMP3)研究进展 | 第30-33页 |
| 1.6 本研究的内容、目的及意义 | 第33-34页 |
| 1.6.1 本研究的主要内容 | 第33页 |
| 1.6.2 本研究的目的和意义 | 第33-34页 |
| 第2章 食管癌易感基因的收集和筛查 | 第34-47页 |
| 2.1 引言 | 第34页 |
| 2.2 食管癌易感基因的收集和整理 | 第34-37页 |
| 2.3 食管癌易感基因的筛查 | 第37-47页 |
| 2.3.1 相关基因exon 上SNP 位点的确定 | 第38页 |
| 2.3.2 SNP 序列及酶切位点的查找 | 第38-47页 |
| 第3章 食管癌易感基因的生物信息学分析 | 第47-58页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 KDM4C（GASC1）的生物信息学分析 | 第48-51页 |
| 3.2.1 KDM4C（GASC1）的生物信息学分析 | 第48-50页 |
| 3.2.2 KDM4C 第19 外显子A19893Trp 的生物信息学分析 | 第50-51页 |
| 3.3 MMP3 的生物信息学分析 | 第51-58页 |
| 3.3.1 MMP3 的生物信息学分析 | 第51-53页 |
| 3.3.2 mmp3 第2 外显子Ly545Glu SNP 的生物信息学分析 | 第53-55页 |
| 3.3.3 mmp3 第 5 外显子 Arg248Trp SNP 的生物信息学分析 | 第55页 |
| 3.3.4 引物设计及非特异性检验 | 第55-58页 |
| 第4章 Chelex100 法提取全血基因组DNA 方法的建立 | 第58-65页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 材料与试剂 | 第58-60页 |
| 4.2.1 材料与试剂 | 第58-59页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第59-60页 |
| 4.3 结果与分析 | 第60-64页 |
| 4.3.1 PCR 的最佳退火温度 | 第60-61页 |
| 4.3.2 制备DNA 模板的血样用量优选 | 第61页 |
| 4.3.3 制备DNA 模板的5% Chelex-100 用量优选 | 第61-62页 |
| 4.3.4 制备 DNA 模板的水浴温度优选 | 第62页 |
| 4.3.5 制备DNA 模板的56℃水浴时间优选 | 第62页 |
| 4.3.6 制备DNA 模板的100℃沸水浴时间优选 | 第62-63页 |
| 4.3.7 PCR 产物酶切分析的琼脂糖凝胶电泳结果 | 第63-64页 |
| 4.4 讨论 | 第64-65页 |
| 第5章 血凝块基因组DNA 提取方法的建立 | 第65-71页 |
| 5.1 引言 | 第65页 |
| 5.2 材料、试剂与设备 | 第65-66页 |
| 5.2.1 材料 | 第65页 |
| 5.2.2 试剂 | 第65-66页 |
| 5.2.3 主要仪器设备 | 第66页 |
| 5.3 实验方法 | 第66-67页 |
| 5.3.1 血凝块的预处理 | 第66页 |
| 5.3.2 蛋白酶K 法提取基因组DNA | 第66页 |
| 5.3.3 碘化钾法提取基因组DNA | 第66-67页 |
| 5.3.4 DNA 浓度测定 | 第67页 |
| 5.3.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第67页 |
| 5.3.6 DNA 体外扩增 | 第67页 |
| 5.4 结果与分析 | 第67-68页 |
| 5.4.1 DNA 浓度测定结果 | 第67页 |
| 5.4.2 琼脂糖凝胶电泳结果 | 第67-68页 |
| 5.4.3 PCR 产物电泳结果 | 第68页 |
| 5.5 讨论 | 第68-71页 |
| 第6章 DNA 聚丙烯酰胺凝胶银染方法的建立 | 第71-78页 |
| 6.1 引言 | 第71-72页 |
| 6.2 材料、试剂与设备 | 第72-73页 |
| 6.2.1 材料 | 第72页 |
| 6.2.2 试剂 | 第72页 |
| 6.2.3 主要仪器设备 | 第72-73页 |
| 6.3 实验方法 | 第73-74页 |
| 6.3.1 PCR 产物酶切 | 第73页 |
| 6.3.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第73页 |
| 6.3.3 上样和电泳 | 第73-74页 |
| 6.3.4 聚丙烯酰胺凝胶银染方法 | 第74页 |
| 6.4 结果 | 第74-76页 |
| 6.4.1 非变性聚丙烯酰胺凝胶浓度的确定 | 第74-75页 |
| 6.4.2 8%非变性聚丙烯酰胺凝胶对标本的筛查 | 第75-76页 |
| 6.5 讨论 | 第76-78页 |
| 第7章 KDM4C 基因 Arg893Trp 和 MMP3 基因 Arg248Trp 与食管鳞癌遗传易感的关联分析 | 第78-81页 |
| 7.1 引言 | 第78页 |
| 7.2 材料与方法 | 第78-79页 |
| 7.2.1 材料 | 第78页 |
| 7.2.2 方法 | 第78-79页 |
| 7.3 结果与分析 | 第79页 |
| 7.4 讨论 | 第79-81页 |
| 第8章 MMP3 基因 Lys45Glu 单核苷酸多态性与食管鳞癌遗传易感性的关联分析 | 第81-89页 |
| 8.1 引言 | 第81-82页 |
| 8.2 材料与方法 | 第82页 |
| 8.2.1 材料 | 第82页 |
| 8.2.2 方法 | 第82页 |
| 8.3 结果与分析 | 第82-85页 |
| 8.3.1 基因分型的相关数据统计 | 第82-85页 |
| 8.4 讨论 | 第85-89页 |
| 参考文献 | 第89-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 附录一 在读期间发表的论文、参与的科研课题 | 第101页 |
