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亲水结构修饰的聚氨酯材料与凝血因子FIX的Calcium-binding EGF-like Domain相互作用的分子动力学模拟

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第10-26页
    1.1 生物医用材料的研究近况第10-11页
    1.2 生物材料的生物相容性第11-15页
        1.2.1 凝血过程与凝血机理第11-13页
        1.2.2 血液相容性材料的发展第13-15页
    1.3 生物医用材料的表面亲水性与血液相容性的关系第15-19页
        1.3.1 水在生物材料表面与蛋白质之间的桥梁作用第15-16页
        1.3.2 生物材料表面的亲水性与生物相容性关系的理论探索第16-19页
        1.3.3 近几年亲水性材料表面与血液相容性关系的研究进展第19页
    1.4 分子动力学计算机模拟第19-23页
        1.4.1 分子模拟方法第20页
        1.4.2 分子动力学模拟的步骤第20-22页
        1.4.3 蛋白质—材料表面相互作用体系的分子动力学模拟研究第22-23页
        1.4.4 未来发展趋势第23页
    1.5 Calcium-bindi ng EGF-like Domian第23-24页
    1.6 本文研究思路第24-25页
    注第25-26页
第二章 阴离子型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用的分子动力学模拟研究第26-49页
    2.1 分子动力学(MD)模拟的工作条件第26-27页
    2.2 凝血因子IX的cbEGF-like Domain预处理及空间取向的选择第27-28页
    2.3 隐性溶剂环境和显性环境下阴离子型亲水性结构修饰的PU表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用体系的分子动力学对比研究第28-39页
        2.3.1 隐性溶剂环境和显性溶剂环境下分子动力学模型的建立第29-31页
            2.3.1.1 不同阴离子亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面模型构建第29页
            2.3.1.2 两种溶剂环境下凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料表面相互作用体系模型的构建第29-31页
        2.3.2 两种环境下体系分子动力学模拟的实施步骤第31-32页
        2.3.3 两种溶剂环境下分子动力学模拟结果分析与讨论第32-39页
            2.3.3.1 均方根偏移分析第32-35页
            2.3.3.2 二面角形变第35-37页
            2.3.3.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第37-39页
    2.4 阴离子型亲水性结构AAS修饰的聚氨酯材料接枝率的影响第39-44页
        2.4.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第39-44页
            2.4.1.1 均方根偏移分析第39-41页
            2.4.1.2 二面角形变分布第41-42页
            2.4.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第42-43页
            2.4.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第43-44页
    2.5 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与不同接枝链长AAS修饰的聚氨酯材料表面相互作用的分子动力学模拟研究第44-47页
        2.5.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第44-47页
            2.5.1.1 均方根偏移分析第44-45页
            2.5.1.2 二面角形变分布第45-46页
            2.5.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第46-47页
            2.5.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第47页
    2.6 本章小结第47-49页
第三章 阳离子型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用的分子动力学模拟研究第49-66页
    3.1 分子动力学(MD)模拟的工作条件第49页
    3.2 目标蛋白片段的选择与预处理第49页
    3.3 隐性溶剂环境和显性环境下阳离子型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用体系的分子动力学模拟第49-56页
        3.3.1 隐性、显性两种溶剂环境下分子动力学模型的建立第49-51页
            3.3.1.1 不同阳离子亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面模型构建第49-50页
            3.3.1.2 构建凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料表面相互作用体系模型第50-51页
        3.3.2 隐性、显性溶剂环境下体系分子动力学模拟的实施步骤第51页
        3.3.3 隐性、显性溶剂环境下分子动力学模拟结果分析与讨论第51-56页
            3.3.3.1 均方根偏移分析第51-53页
            3.3.3.2 二面角形变第53-55页
            3.3.3.3 凝血因子IX的cbEGF-Iike Domain与材料的相互作用能第55-56页
    3.4 阳离子型亲水性结构DAC修饰的聚氨酯材料接枝率的影响第56-61页
        3.4.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第57-61页
            3.4.1.1 均方根偏移分析第57-58页
            3.4.1.2 二面角形变分布第58-60页
            3.4.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第60-61页
            3.4.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第61页
    3.5 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与不同接枝链长DAC修饰的聚氨酯材料表面相互作用的分子动力学模拟研究第61-64页
        3.5.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第62-64页
            3.5.1.1 均方根偏移分析第62-63页
            3.5.1.2 二面角形变分布第63页
            3.5.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第63-64页
            3.5.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第64页
    3.6 本章小结第64-66页
第四章 两性离子型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用的分子动力学模拟研究第66-83页
    4.1 分子动力学(MD)模拟的工作条件第66页
    4.2 目标蛋白片段的选择与预处理第66页
    4.3 隐性、显性溶剂环境下两性离子型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面与凝血因子IX的cbEGF-like Domain相互作用体系的分子动力学模拟第66-73页
        4.3.1 隐性、显性两种溶剂环境下分子动力学模型的建立第66-68页
            4.3.1.1 不同两性离子亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面模型构建第66-67页
            4.3.1.2 构建凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料表面相互作用体系模型第67-68页
        4.3.2 隐性、显性溶剂环境下体系分子动力学模拟的实施步骤第68页
        4.3.3 隐性、显性溶剂环境下分子动力学模拟结果分析与讨论第68-73页
            4.3.3.1 均方根偏移分析第68-70页
            4.3.3.2 二面角形变第70-72页
            4.3.3.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第72-73页
    4.4 两性离子型亲水性结构DMAPS修饰的聚氨酯材料接枝率的影响第73-78页
        4.4.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第74-78页
            4.4.1.1 均方根偏移分析第74-75页
            4.4.1.2 二面角形变分布第75-76页
            4.4.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第76-77页
            4.4.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第77-78页
    4.5 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与不同接枝链长DMAPS修饰的聚氨酯材料表面相互作用的分子动力学模拟研究第78-81页
        4.5.1 分子动力学模拟结果分析与讨论第78-81页
            4.5.1.1 均方根偏移分析第78-79页
            4.5.1.2 二面角形变分布第79-80页
            4.5.1.3 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料的相互作用能第80-81页
            4.5.1.4 凝血因子IX的cbEGF-like Domain与材料相互作用体系分子间氢键分析第81页
    4.6 本章小结第81-83页
第五章 结论与展望第83-86页
参考文献第86-96页
在读期间发表的学术论文及研究成果第96-97页
致谢第97页

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