| 致谢 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-32页 |
| 1.1 分枝杆菌 | 第14-18页 |
| 1.1.1 分枝杆菌属简介 | 第14页 |
| 1.1.2 结核分枝杆菌和海分枝杆菌的感染过程 | 第14-18页 |
| 1.2 基因的转录调控 | 第18-31页 |
| 1.2.1 转录循环 | 第18页 |
| 1.2.2 RNA聚合酶 | 第18-21页 |
| 1.2.3 转录调控因子 | 第21-31页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第31页 |
| 1.4 本研究的主要内容 | 第31-32页 |
| 第二章 结核分枝杆菌转录调控蛋白的系统分析 | 第32-43页 |
| 2.1 引言 | 第32-33页 |
| 2.2 实验材料和方法 | 第33-37页 |
| 2.2.1 菌株和质粒 | 第33-34页 |
| 2.2.2 引物信息 | 第34页 |
| 2.2.3 质粒构建 | 第34页 |
| 2.2.4 大肠杆菌背景菌株的构建 | 第34-35页 |
| 2.2.5 半乳糖苷酶酶活测定 | 第35-36页 |
| 2.2.6 大肠杆菌RNA提取和半定量PCR分析 | 第36页 |
| 2.2.7 细菌双杂交分析 | 第36-37页 |
| 2.3 实验结果 | 第37-41页 |
| 2.3.1 调控蛋白分析系统的构建 | 第37-38页 |
| 2.3.2 结核分枝杆菌调控蛋白的系统分析 | 第38-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 结核分枝杆菌Wbl家族蛋白与SigA的相互作用分析 | 第43-62页 |
| 3.1 引言 | 第43-44页 |
| 3.2 实验材料和方法 | 第44-49页 |
| 3.2.1 菌株和质粒 | 第44-46页 |
| 3.2.2 引物信息 | 第46页 |
| 3.2.3 蛋白共纯化 | 第46页 |
| 3.2.4 细菌双杂交分析 | 第46-47页 |
| 3.2.5 分枝杆菌蛋白互补分析 | 第47页 |
| 3.2.6 蛋白质免疫印迹（western blot）检测 | 第47-48页 |
| 3.2.7 耻垢分枝杆菌电转感受态的制备 | 第48页 |
| 3.2.8 分枝杆菌的电击转化 | 第48-49页 |
| 3.3 实验结果 | 第49-59页 |
| 3.3.1 Mtb中Wbl蛋白与 σ~A的相互作用分析 | 第49-50页 |
| 3.3.2 Wbl家族蛋白与 σ~A的相互作用方式存在差异 | 第50-51页 |
| 3.3.3 WhiB3蛋白与 σ 因子相互作用分析 | 第51-52页 |
| 3.3.4 WhiB3蛋白在 σ~A上相互作用位点的分析 | 第52-55页 |
| 3.3.5 WhiB3蛋白与 σ~A相互作用位点的分析 | 第55-59页 |
| 3.3.6 WhiB1-WhiB7与 σ~A相互作用位点的保守性分析 | 第59页 |
| 3.4 讨论 | 第59-62页 |
| 第四章 WhiB3生理功能研究 | 第62-80页 |
| 4.1 引言 | 第62-63页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第63-68页 |
| 4.2.1 菌株和质粒 | 第63-64页 |
| 4.2.2 引物信息 | 第64页 |
| 4.2.3 耻垢分枝杆菌的菌体形态观察 | 第64页 |
| 4.2.4 构建分枝杆菌突变体 | 第64-65页 |
| 4.2.5 分枝杆菌总DNA模板制备 | 第65-66页 |
| 4.2.6 分枝杆菌中总RNA的提取 | 第66页 |
| 4.2.7 总RNA的反转录和cDNA的实时荧光定量PCR（qRT-PCR） | 第66-67页 |
| 4.2.8 生长曲线测定 | 第67-68页 |
| 4.3 实验结果 | 第68-77页 |
| 4.3.1 生长稳定期和缺氧激活MswhiB3的转录 | 第68页 |
| 4.3.2 在Ms中过表达MtbWhiB3影响生长 | 第68-69页 |
| 4.3.3 在Ms WT和MsΔwhiB3中诱导过表达MtbWhiB3影响生长 | 第69-71页 |
| 4.3.4 σA与WhiB3的相互作用参与MtbWhiB3的过表达调控 | 第71-72页 |
| 4.3.5 MtbWhiB3过表达产生调控假象 | 第72-73页 |
| 4.3.6 MmWhiB3影响Mm的表型 | 第73-75页 |
| 4.3.7 MmWhiB3调控Ⅰ型多酮化合物合成相关基因的转录 | 第75-77页 |
| 4.4 讨论 | 第77-80页 |
| 第五章 酸性环境下whiB3转录激活调控机制研究 | 第80-94页 |
| 5.1 引言 | 第80-81页 |
| 5.2 实验材料和方法 | 第81-84页 |
| 5.2.1 菌株和质粒 | 第81-82页 |
| 5.2.2 引物信息 | 第82页 |
| 5.2.3 凝胶阻滞实验（EMSA） | 第82-83页 |
| 5.2.4 酸性条件处理分枝杆菌 | 第83页 |
| 5.2.5 分枝杆菌突变体的构建 | 第83页 |
| 5.2.6 分枝杆菌总DNA模板制备 | 第83页 |
| 5.2.7 分枝杆菌总RNA提取，反转录及qRT-PCR | 第83-84页 |
| 5.3 实验结果 | 第84-92页 |
| 5.3.1 MtbPho P直接结合MtbwhiB3p和MmwhiB3p | 第84-86页 |
| 5.3.2 低pH条件下Pho P调控whiB3转录表达 | 第86-88页 |
| 5.3.3 Pho P对whiB3转录调控需要磷酸化 | 第88-89页 |
| 5.3.4 MmPho R调控MmwhiB3转录表达 | 第89-91页 |
| 5.3.5 MmPho R调控MmwhiB3转录表达需要磷酸化的过程 | 第91-92页 |
| 5.4 讨论 | 第92-94页 |
| 第六章 总结与展望 | 第94-98页 |
| 参考文献 | 第98-110页 |
| 附录A 本论文所用到的引物信息 | 第110-130页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第130页 |
