| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 前言 | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-22页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-12页 |
| 1.2 甲硫氨酸输入体蛋白体系 | 第12-16页 |
| 1.2.1 甲硫氨酸输入体蛋白的结构组成 | 第12-15页 |
| 1.2.2 甲硫氨酸输入体蛋白的生理功能 | 第15-16页 |
| 1.3 ABC运载体家族的底物转运机制 | 第16-18页 |
| 1.4 本论文研究内容 | 第18-20页 |
| 参考文献 | 第20-22页 |
| 第二章 分子动力学模拟理论与方法 | 第22-35页 |
| 2.1 分子动力学模拟在蛋白质研究领域的应用 | 第22-23页 |
| 2.2 分子动力学算法 | 第23-30页 |
| 2.2.1 积分算法概况 | 第23-25页 |
| 2.2.2 恒温恒压算法 | 第25-28页 |
| 2.2.3 分子力场 | 第28-30页 |
| 2.3 分子动力学模拟的一般步骤 | 第30-33页 |
| 2.3.1 初始结构的准备 | 第31页 |
| 2.3.2 能量优化 | 第31-32页 |
| 2.3.3 动力学计算 | 第32页 |
| 2.3.4 轨迹分析 | 第32-33页 |
| 参考文献 | 第33-35页 |
| 第三章 甲硫氨酸输入体MetNI转运抑制机理研究 | 第35-70页 |
| 3.1 引言 | 第35-38页 |
| 3.2 计算方法与模型 | 第38-39页 |
| 3.2.1 初始结构的准备 | 第38页 |
| 3.2.2 常规分子动力学模拟 | 第38-39页 |
| 3.3 计算结果 | 第39-69页 |
| 3.3.1 甲硫氨酸结合对结合位点局部造成的影响 | 第40-47页 |
| 3.3.2 甲硫氨酸结合对NBD-聚界面的变构调节效应 | 第47-56页 |
| 3.3.3 甲硫氨酸变构效应的分子机制 | 第56-69页 |
| 参考文献 | 第69-70页 |
| 第四章 结论与展望 | 第70-72页 |
| 作者简介 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |