| 中文摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 英文缩略词 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-23页 |
| 1 阳虚体质的研究概述 | 第12-13页 |
| 1.1 阳虚质体质特征概述 | 第12页 |
| 1.2 阳虚质的代谢特征 | 第12-13页 |
| 2 人体肠道菌群结构 | 第13-14页 |
| 3 肠道菌群个体化差异研究背景 | 第14-15页 |
| 4 中医体质相关疾病与肠道微生态 | 第15-17页 |
| 4.1 痰湿体质相关疾病与肠道微生态 | 第15-16页 |
| 4.2 过敏体质相关疾病与肠道微生态 | 第16-17页 |
| 5 研究肠道菌群的微生物分子生物学技术 | 第17-18页 |
| 5.1 指纹图谱分析技术 | 第17页 |
| 5.2 基于16S rRNA基因的测序技术 | 第17-18页 |
| 参考文献 | 第18-23页 |
| 第二部分 肠道微生态与体质相关的理论研究 | 第23-29页 |
| 1 四个基本原理的微观阐释 | 第24-25页 |
| 1.1 肠道微生态的“生命过程论” | 第24页 |
| 1.2 肠道微生态的“形神构成论” | 第24页 |
| 1.3 肠道微生态的“禀赋遗传论” | 第24-25页 |
| 1.4 肠道微生态的“环境制约论” | 第25页 |
| 2 三个关键科学问题的微观阐释 | 第25-26页 |
| 2.1 肠道菌群的个体差异性——“体质可分论” | 第25页 |
| 2.2 肠道菌群与疾病相关——“体病相关论” | 第25-26页 |
| 2.3 肠道微生态调节——“体质可调论” | 第26页 |
| 3 展望 | 第26-27页 |
| 参考文献 | 第27-29页 |
| 第三部分 阳虚质肠道菌群高通量测序初步探索 | 第29-53页 |
| 1 研究方法 | 第29-30页 |
| 1.1 研究对象来源及分组 | 第29页 |
| 1.2 判定标准 | 第29-30页 |
| 1.3 纳入标准 | 第30页 |
| 1.4 排除标准 | 第30页 |
| 1.5 筛选结果 | 第30页 |
| 2 实验方法 | 第30-33页 |
| 2.1 粪便样品采集 | 第30-31页 |
| 2.2 主要仪器与试剂 | 第31页 |
| 2.3 PCR扩增与纯化 | 第31页 |
| 2.4 粪便样品预处理及细菌DNA提取 | 第31-32页 |
| 2.4.1 粪便样品预处理 | 第31页 |
| 2.4.2 粪便样本细菌总DNA提取与纯化 | 第31-32页 |
| 2.5 荧光定量 | 第32页 |
| 2.6 Miseq文库构建 | 第32页 |
| 2.7 Miseq测序 | 第32页 |
| 2.8 高通量序列的生物信息学处理 | 第32-33页 |
| 2.8.1 测序数据统计及优化 | 第32-33页 |
| 2.8.2 OTU聚类 | 第33页 |
| 2.8.3 分类学分析 | 第33页 |
| 2.9 数据的统计分析及图表绘制 | 第33页 |
| 3 实验结果 | 第33-50页 |
| 3.1 肠道菌群的多样性分析 | 第33-42页 |
| 3.1.1 序列统计 | 第33-34页 |
| 3.1.2 稀释性曲线(Rarefaction curve) | 第34-35页 |
| 3.1.3 Shannon-Wiener曲线 | 第35页 |
| 3.1.4 Rank-Abundance曲线 | 第35-36页 |
| 3.1.5 OTU分布VENN图 | 第36页 |
| 3.1.6 多样性指数分析 | 第36-41页 |
| 3.1.7 多样品相似度树状图 | 第41-42页 |
| 3.2 肠道菌群的群落结构分析 | 第42-44页 |
| 3.2.1 样品聚类树与柱状图组合分析 | 第42-43页 |
| 3.2.2 属水平的群落结构组分图 | 第43-44页 |
| 3.3 阳虚质组与平和质组肠道菌群结构比较分析 | 第44-47页 |
| 3.3.1 阳虚质与平和质肠道菌群门水平的分布 | 第44页 |
| 3.3.2 阳虚质与平和质肠道菌群纲水平的分布 | 第44-45页 |
| 3.3.3 阳虚质与平和质肠道菌群目水平的分布 | 第45页 |
| 3.3.4 阳虚质与平和质肠道菌群科水平的分布 | 第45-46页 |
| 3.3.5 阳虚质与平和质肠道菌群属水平的分布 | 第46-47页 |
| 3.4 Metastat组间显著性差异分析 | 第47-48页 |
| 3.5 对数据的统计学处理与分析 | 第48-50页 |
| 3.5.1 主坐标分析(PCoA) | 第48-49页 |
| 3.5.2 数据的非参数wilcoxon检验 | 第49-50页 |
| 4 讨论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 个人简历 | 第54页 |