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染色质免疫共沉淀技术解析转录调控蛋白Hac1在蛋白分泌调控中的功能

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第12-22页
    1.1 丝状真菌蛋白分泌第12-14页
        1.1.1 内质网第13页
        1.1.2 高尔基体第13页
        1.1.3 囊泡转运第13-14页
    1.2 丝状真菌的未折叠蛋白响应第14-16页
    1.3 Hac1基因第16页
    1.4 染色质免疫共沉淀技术第16-20页
        1.4.1 ChIP的原理和步骤第17-18页
        1.4.2 ChIP-Seq测序分析第18-20页
    1.5 研究的目标意义第20页
    1.6 研究内容第20页
    1.7 技术路线第20-22页
第二章 DTT诱发UPR响应时间点的确定第22-32页
    2.1 试验材料第22-23页
        2.1.1 菌株第22页
        2.1.2 培养基第22页
        2.1.3 主要溶液、试剂第22-23页
        2.1.4 仪器设备第23页
    2.2 试验方法第23-27页
        2.2.1 菌丝体及发酵液的制备第23-24页
        2.2.2 蛋白浓度测定第24-25页
        2.2.3 基因转录水平检测第25-27页
    2.3 结果分析第27-31页
        2.3.1 蛋白浓度测定第27-29页
        2.3.2 加DTT后斜卧青霉基因组总RNA的提取第29页
        2.3.3 实时荧光定量PCR检测bipA和pdiA的表达量第29-31页
    2.4 结论与讨论第31-32页
第三章 斜卧青霉染色质免疫共沉淀超声波破碎方法的建立第32-40页
    3.1 试验材料第32-33页
        3.1.1 菌株第32页
        3.1.2 培养基第32页
        3.1.3 试剂及仪器第32-33页
    3.2 试验方法第33-34页
        3.2.1 菌丝体制备第33页
        3.2.2 甲醛交联第33页
        3.2.3 DNA超声波破碎第33页
        3.2.4 解交联染色体的检验第33-34页
    3.3 结果与分析第34-38页
        3.3.1 最佳交联时间的确定第34-35页
        3.3.2 最佳菌悬液浓度的确定第35-36页
        3.3.3 染色质免疫共沉淀超声条件的确定第36-38页
    3.4 结论与讨论第38-40页
第四章 斜卧青霉染色质免疫共沉淀及测序分析第40-53页
    4.1 试验材料第40页
        4.1.1 菌株第40页
        4.1.2 试剂及仪器第40页
    4.2 试验方法第40-43页
        4.2.1 菌丝体的制备方法同 3.2.1第40页
        4.2.2 甲醛交联方法同 3.2.2第40页
        4.2.3 DNA超声波破碎方法同 3.2.3第40页
        4.2.4 染色质免疫共沉淀第40-41页
        4.2.5 解交联第41页
        4.2.6 DNA纯化及检测第41页
        4.2.7 RAPD-PCR扩增靶基因结合序列第41-42页
        4.2.8 染色质免疫共沉淀样品测序及数据分析第42-43页
    4.3 试验结果第43-51页
        4.3.1 染色质免疫共沉淀及DNA纯化检测第43页
        4.3.2 RAPD-PCR扩增靶基因结合序列第43-44页
        4.3.3 染色质免疫共沉淀测序数据分析第44-51页
    4.4 结论与讨论第51-53页
第五章 Hac1靶基因3379敲除菌株的构建第53-64页
    5.1 试验材料第53-54页
        5.1.1 菌株和质粒第53页
        5.1.2 培养基第53-54页
        5.1.3 常用缓冲液、试剂第54页
    5.2 试验方法第54-57页
        5.2.1 敲除盒的构建第54-55页
        5.2.2 原生质体的制备及转化第55-56页
        5.2.3 转化子的染色体基因组的提取第56页
        5.2.4 敲除子筛选第56页
        5.2.5 蛋白浓度及酶活测定第56-57页
    5.3 结果分析第57-63页
        5.3.1 敲除载体的构建第57-59页
        5.3.2 原生质体的转化和敲除子的鉴定第59-60页
        5.3.3 敲除子3379与出发菌株 114-2 的形态学比较第60-61页
        5.3.4 敲除菌株3379的蛋白浓度及酶活测定第61-63页
    5.4 结论与讨论第63-64页
第六章 主要结论第64-66页
    6.1 主要结论第64-65页
    6.2 研究不足第65页
    6.3 研究展望第65-66页
参考文献第66-71页
致谢第71-72页
作者简介第72页

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