摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
引言 | 第13-19页 |
0.1 胆固醇与 24-脱氢胆固醇还原酶 | 第13-15页 |
0.1.1 胆固醇的合成与调控 | 第13页 |
0.1.2 胆固醇代谢异常与动脉粥样硬化 | 第13-14页 |
0.1.3 降胆固醇药物的研发现状 | 第14-15页 |
0.1.4 24-脱氢胆固醇还原酶 | 第15页 |
0.2 虚拟筛选与老药新用 | 第15-18页 |
0.2.1 虚拟筛选基本原理及其优势 | 第15-16页 |
0.2.2 老药新用 | 第16-17页 |
0.2.3 药物小分子数据库 | 第17-18页 |
0.3 分子对接与动力学模拟 | 第18页 |
0.4 研究目的与意义 | 第18-19页 |
第1章 从现有药物小分子数据库中虚拟筛选获得新型DHCR24抑制剂候选小分子 | 第19-30页 |
1.1 前言 | 第19-21页 |
1.1.1 SignalP 4.1 Server | 第19页 |
1.1.2 I-TASSER | 第19页 |
1.1.3 AutoDock 4, Auto Dock vina和MGLTools 1.5.6 | 第19-20页 |
1.1.4 Openbabel 2.3 | 第20页 |
1.1.5 PyMOL | 第20页 |
1.1.6 Chemspider | 第20页 |
1.1.7 UniProt(Universal Protein Resource) | 第20页 |
1.1.8 DrugBank version5.0 | 第20-21页 |
1.2 实验材料: | 第21页 |
1.2.1 软件: | 第21页 |
1.2.2 服务器: | 第21页 |
1.2.3 数据库: | 第21页 |
1.3 实验方法 | 第21-23页 |
1.3.1 DHCR24蛋白三维结构的构建 | 第21-22页 |
1.3.2 底物Desmosterol及辅酶FAD的获得 | 第22页 |
1.3.3 分子对接及活性口袋的确定 | 第22页 |
1.3.4 药物小分子数据库的处理 | 第22-23页 |
1.3.5 虚拟筛选 | 第23页 |
1.3.6 精确对接及初步筛选 | 第23页 |
1.4 结果与讨论 | 第23-29页 |
1.4.1DHCR24最佳模型打分 | 第23-24页 |
1.4.2 对接结果及结合口袋的确定 | 第24-25页 |
1.4.3 筛选结果 | 第25-29页 |
1.5 结论 | 第29-30页 |
第2章 高效液相色谱法对候选药物细胞水平降胆固醇药效的初步确认 | 第30-39页 |
2.1 前言 | 第30页 |
2.2 实验材料 | 第30-31页 |
2.2.1 生化试剂及耗材 | 第30-31页 |
2.2.2 主要仪器设备 | 第31页 |
2.3 实验方法 | 第31-34页 |
2.3.1 HepG2(人肝癌细胞)细胞的复苏,传代,冻存 | 第31-32页 |
2.3.2 加药浓度的确定 | 第32-33页 |
2.3.3 细胞总脂质的提取 | 第33-34页 |
2.3.4 高效液相检测细胞内胆固醇的含量 | 第34页 |
2.4 结果与讨论 | 第34-38页 |
2.4.1 细胞加药浓度的确定 | 第34-35页 |
2.4.2 高效液相条件的确定 | 第35-36页 |
2.4.3 标准曲线的绘制 | 第36-37页 |
2.4.4 细胞中胆固醇含量的测定结果 | 第37-38页 |
2.5 小结 | 第38-39页 |
第3章 细胞胆固醇荧光染色法(非律平)检验候选DHCR24抑制剂的降胆固醇效果 | 第39-43页 |
3.1 前言 | 第39页 |
3.2 实验材料 | 第39-40页 |
3.2.1 实验耗材 | 第39-40页 |
3.2.2 主要设备仪器 | 第40页 |
3.3 实验方法 | 第40-41页 |
3.3.1 HepG2细胞非律平染色 | 第40页 |
3.3.2 激光共聚焦显微镜观察 | 第40-41页 |
3.3.3 灰度值计算及统计学分析 | 第41页 |
3.4 结果 | 第41-42页 |
3.5 讨论 | 第42-43页 |
第4章 分子动力学模拟研究候选药物对DHCR24活性抑制的机制 | 第43-50页 |
4.1 前言 | 第43-44页 |
4.1.1 NAMD 2.9 和VMD | 第43页 |
4.1.2 Ligplot | 第43页 |
4.1.3 Amber14 | 第43-44页 |
4.2 实验材料 | 第44页 |
4.2.1 软件 | 第44页 |
4.3 实验方法 | 第44-45页 |
4.4 结果与讨论 | 第45-48页 |
4.4.1 RMSD均方根偏差分析 | 第45-46页 |
4.4.2 五种复合物中底物和酶结合自由能分析 | 第46-47页 |
4.4.3 DHCR24与底物链甾醇和候选药物OND1及OND4具体结合方式分析 | 第47-48页 |
4.5 结论 | 第48-50页 |
第5章 结果与展望 | 第50-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-56页 |
攻读学位期间发表学术论文及参加科研情况 | 第56-57页 |