| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 英文缩略词 | 第7-12页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-32页 |
| 1.1 百合属系统发育研究进展 | 第14-23页 |
| 1.1.1 百合属的起源 | 第14-17页 |
| 1.1.2 百合属植物分子系统发育学 | 第17-23页 |
| 1.2 叶绿体基因组 | 第23-30页 |
| 1.2.1 叶绿体基因组的结构 | 第23-24页 |
| 1.2.2 叶绿体基因组测序技术的研究进展 | 第24-25页 |
| 1.2.3 叶绿体基因组的在百合科中的研究进展 | 第25-30页 |
| 1.3 研究的目的及意义 | 第30-32页 |
| 1.3.1 本研究的目的及意义 | 第30-31页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第31-32页 |
| 第二章 百合属叶绿体基因组比较分析 | 第32-71页 |
| 2.1 材料和方法 | 第32-41页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第32-35页 |
| 2.1.2 提取基因组总DNA | 第35页 |
| 2.1.3 基因组DNA鸟枪法文库制备 | 第35-38页 |
| 2.1.4 百合的叶绿体基因组的拼接和注释 | 第38页 |
| 2.1.5 百合属叶绿体基因组基本结构分析 | 第38-39页 |
| 2.1.6 密码子偏好性分析 | 第39页 |
| 2.1.7 SSR分析 | 第39页 |
| 2.1.8 百合属叶绿体基因组分子标记开发和序列多态性分析 | 第39页 |
| 2.1.9 系统发育树构建 | 第39-41页 |
| 2.2 结果 | 第41-66页 |
| 2.2.1 测序、拼接及注释结果 | 第41-45页 |
| 2.2.2 百合属叶绿体基因组的基本特征 | 第45-48页 |
| 2.2.3 密码子偏好性 | 第48-51页 |
| 2.2.4 SSR分析 | 第51-53页 |
| 2.2.5 序列多态性分析 | 第53-56页 |
| 2.2.6 高分辨率标记的开发 | 第56-57页 |
| 2.2.7 系统发育树构建 | 第57-66页 |
| 2.3 讨论 | 第66-71页 |
| 2.3.1 百合属叶绿体基因组的结构和大小比较 | 第66页 |
| 2.3.2 百合属叶绿体基因组的注释 | 第66-67页 |
| 2.3.3 百合属叶绿体基因组的密码子偏好性 | 第67-68页 |
| 2.3.4 SSR位点和序列分化分析 | 第68页 |
| 2.3.5 百合属高分辨率标记的开发 | 第68-69页 |
| 2.3.6 基于叶绿体基因组百合属系统发育分析 | 第69-71页 |
| 结论 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-88页 |
| 作者简介 | 第88-90页 |
| 致谢 | 第90页 |