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结核分枝杆菌Cas2(Rv2816c)在胁迫应答及胞内存活中的作用与分子机理

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第1章 综述第13-21页
    1.1 引言第13页
    1.2 CRISPR概述第13页
    1.3 CRISPR/Cas系统结构组成第13-14页
    1.4 CRISPR/Cas系统的主要类型第14页
    1.5 CRISPR/Cas系统的功能第14-16页
        1.5.1 适应阶段第15页
        1.5.2 表达第15页
        1.5.3 干扰第15-16页
    1.6 CRISPR/Cas系统的应用第16页
        1.6.1 Cas蛋白被用于基因组编辑第16页
        1.6.2 Cas蛋白应用于转录调控第16页
    1.7 CRISR与噬菌体的共进化第16-17页
    1.8 CRISPR/Cas关于基因调控的研究第17-19页
        1.8.1 调控病原菌毒力第17-18页
        1.8.2 反义CRISPR RNA的调控作用第18页
        1.8.3 基因调控可能的机制第18-19页
    1.9 结核分枝杆菌中的CRISPR第19页
    1.10 展望第19-21页
第2章 前言第21-23页
第3章 实验材料和方法第23-37页
    3.1 实验材料第23-26页
        3.1.1 菌株、质粒和细胞第23页
        3.1.2 主要试剂和材料第23-24页
        3.1.3 培养基及主要试剂的配置第24-25页
        3.1.4 主要仪器和设备第25-26页
    3.2 实验方法第26-37页
        3.2.1 结核分枝杆菌H37Rv基因组的提取:CTAB法第26页
        3.2.2 结核分枝杆菌Rv2816c基因PCR引物的设计与合成第26页
        3.2.3 结核分枝杆菌Rv2816c基因扩增第26页
        3.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化(热激法)第26-27页
        3.2.5 Rv2816c基因的TA克隆第27页
        3.2.6 pALACE-Rv2816c穿梭载体构建第27-28页
        3.2.7 耻垢分枝杆菌感受态的制备及电转化第28-29页
        3.2.8 重组质粒在耻垢分枝杆菌中的表达及验证第29-30页
        3.2.9 菌落形态观察第30页
        3.2.10 生长曲线的测定第30页
        3.2.11 滑动实验第30页
        3.2.12 耻垢分枝杆菌生物膜培养方法第30页
        3.2.13 耻垢分枝杆菌脂肪酸分析第30-31页
        3.2.14 氧化压力的耐受性检测第31页
        3.2.15 SDS耐受性检测第31页
        3.2.16 酸耐受性检测第31-32页
        3.2.17 Trizol法提取耻垢分枝杆菌总RNA第32页
        3.2.18 Rv2816c对相关基因转录水平的影响第32-34页
        3.2.19 耻垢分枝杆菌侵染巨噬细胞后存活率检测第34-35页
        3.2.20 巨噬细胞被重组耻垢分枝杆菌侵染后总RNA的提取第35页
        3.2.21 定量RT-PCR检测M semgmatis-pALACE-Rv2816c侵染THP-1巨噬细胞后相关细胞因子转录水平第35-37页
第4章 结果与分析第37-51页
    4.1 Cas2在致病分枝杆菌中是保守蛋白第37页
    4.2 Rv2816c基因的PCR扩增及鉴定第37-38页
    4.3 构建M. smegmatis-pALACE-Rv2816c重组耻垢分枝杆菌第38-39页
    4.4 Rv2816c基因在重组耻垢分枝杆菌中表达第39页
    4.5 过表达Rv2816c基因使耻垢分枝杆菌的生长速度加快第39-40页
    4.6 Rv2816c基因的过表达使耻垢分枝杆菌单菌落形态发生改变第40页
    4.7 重组分枝杆菌的滑动能力降低第40-41页
    4.8 过表达Rv2816c基因影响耻垢分枝杆菌生物膜的形成第41-42页
    4.9 过表达Rv2816c基因对耻垢分枝杆菌中的脂质成分无太大影响第42页
    4.10 过表达Rv2816c基因使耻垢分枝杆菌对SDS敏感第42-43页
    4.11 过表达Rv2816c基因使耻垢分枝杆菌对氧化压力更敏感第43-44页
    4.12 M. smegmatis-pALACE-Rv2816c对压力条件的敏感由Sigma因子介导第44-45页
    4.13 过表达Rv2816c基因使耻垢分枝杆菌对氧氟沙星和诺氟沙星敏感且是由活性氧介导的第45-46页
    4.14 过表达Rv2816c基因使耻垢分枝杆菌对酸性条件敏感第46-47页
    4.15 过表达Rv2816c基因降低耻垢分枝杆菌在巨噬细胞中的存活率第47-48页
    4.16 Rv2816c基因的表达降低了耻垢分枝杆菌诱导的THP-1细胞因子的分泌第48-51页
第5章 结论与展望第51-53页
    5.1 实验结论与分析第51-52页
    5.2 展望第52-53页
参考文献第53-61页
致谢第61-63页
在学校期间所发表的文章第63页

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