| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-30页 |
| 1 玉米纹枯病简介 | 第12-15页 |
| ·玉米纹枯病病原菌 | 第12页 |
| ·玉米纹枯病病原菌的生物学特征 | 第12页 |
| ·玉米纹枯病病原菌侵染过程 | 第12-13页 |
| ·玉米纹枯病抗性遗传研究 | 第13-14页 |
| ·玉米纹枯病抗病机制研究 | 第14-15页 |
| 2 抗性差异基因表达研究 | 第15-19页 |
| ·SAGE技术的原理与发展 | 第16-18页 |
| ·DeepSAGE(DGE)技术在植物中的研究进展 | 第18-19页 |
| 3 植物抗病相关miRNA研究进展 | 第19-27页 |
| ·植物病原菌互作miRNA研究进展 | 第19-24页 |
| ·植物miR393研究 | 第24-27页 |
| 4 本研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 5 试验技术路线 | 第28-30页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第30-48页 |
| 1 试验材料 | 第30-31页 |
| ·供试材料 | 第30页 |
| ·主要仪器设备 | 第30页 |
| ·主要试剂 | 第30-31页 |
| 2 试验方法 | 第31-48页 |
| ·材料处理 | 第31页 |
| ·总RNA及小RNA的制备 | 第31-34页 |
| ·数字基因表达谱筛选玉米纹枯病胁迫的差异表达基因 | 第34-48页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第48-77页 |
| 1. 纹枯病胁迫条件下玉米叶鞘的表型变化及电镜结果分析 | 第48-49页 |
| 2. 总RNA提取质量分析 | 第49-50页 |
| 3. 数字基因表达谱(DGE)测序结果分析 | 第50-77页 |
| ·测序质量评估 | 第50-51页 |
| ·测序饱和度分析 | 第51-52页 |
| ·测序3’,5’偏好性统计分析 | 第52页 |
| ·实验重复性分析 | 第52页 |
| ·Clean tag拷贝数分布分析 | 第52-53页 |
| ·DGE标签与玉米参考基因组数据库的比对 | 第53-54页 |
| ·基因表达分析及测序结果验证 | 第54-56页 |
| ·玉米抗病差异表达转录因子分析及qRT-PCR验证 | 第56-65页 |
| ·玉米抗纹枯病胁迫响应功能蛋白分析 | 第65-70页 |
| ·Gene Ontology功能显著性分析 | 第70-71页 |
| ·抗纹枯病差异表达基因的pathway显著性富集分析 | 第71-77页 |
| 第四部分 讨论 | 第77-92页 |
| 1. 玉米纹枯病胁迫后测序样本及取样时间点的选择 | 第77页 |
| 2. 数字基因表达谱(DGE)技术在本研究中的应用 | 第77-90页 |
| ·表达基因比对到参考玉米基因组上的数据分析 | 第78页 |
| ·基因表达分布分析 | 第78-81页 |
| ·GO功能显著性富集 | 第81页 |
| ·Pathway显著性富集 | 第81页 |
| ·差异表达转录因子(TFs)基因在纹枯病胁迫下参与信号转导 | 第81-83页 |
| ·植物病原菌胁迫相关miRNA靶基因调控模式研究 | 第83-90页 |
| 3. 下一步研究设想 | 第90-92页 |
| 第五部分 结论 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文及参与项目 | 第108-109页 |
