DBP降解菌DNB-S1转录组学研究及功能基因的筛选
| 摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-20页 |
| ·转录组学概述 | 第11-14页 |
| ·转录组与转录组学 | 第11页 |
| ·转录组学研究的基本方法 | 第11-12页 |
| ·第二代测序平台 | 第12-14页 |
| ·细菌转录组研究现状 | 第14页 |
| ·DBP降解菌功能基因相关研究 | 第14-18页 |
| ·DBP及其危害 | 第14-16页 |
| ·DBP的生物降解 | 第16-17页 |
| ·DBP降解菌功能基因研究 | 第17-18页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第18页 |
| ·研究的目的意义 | 第18-19页 |
| ·技术路线 | 第19页 |
| ·课题来源 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-28页 |
| ·材料 | 第20-21页 |
| ·供试菌株与培养基 | 第20页 |
| ·主要试剂 | 第20页 |
| ·主要仪器 | 第20-21页 |
| ·试验方法 | 第21-26页 |
| ·培养菌株 | 第21页 |
| ·上机测序 | 第21-22页 |
| ·序列拼接与组装 | 第22-23页 |
| ·基因的功能注释和COG分类 | 第23-25页 |
| ·Unigene表达差异分析 | 第25-26页 |
| ·差异Unigene的GO和Pathway分析 | 第26页 |
| ·qPCR | 第26-28页 |
| 3 实验结果 | 第28-43页 |
| ·产量统计与组装结果分析 | 第28页 |
| ·Unigene的功能注释结果与分析 | 第28-30页 |
| ·Unigene的功能注释 | 第28-29页 |
| ·预测蛋白注释 | 第29页 |
| ·COG | 第29-30页 |
| ·Unigene的GO分类 | 第30-31页 |
| ·Unigene的代谢通路分析 | 第31页 |
| ·Unigene的表达差异分析 | 第31-34页 |
| ·GO功能分析 | 第32-34页 |
| ·Pathway富集分析 | 第34页 |
| ·功能基因的预测 | 第34-42页 |
| ·转录调控因子 | 第34-36页 |
| ·趋化蛋白 | 第36-38页 |
| ·降解基因及代谢路径 | 第38-41页 |
| ·其它功能基因 | 第41-42页 |
| ·定量验证测序结果 | 第42-43页 |
| 4 讨论 | 第43-48页 |
| ·转录组测序实验的实验设计 | 第43页 |
| ·基因注释结果和差异表达基因分析 | 第43-44页 |
| ·功能基因预测分析 | 第44-47页 |
| ·转录调控因子 | 第44-45页 |
| ·趋化蛋白 | 第45页 |
| ·降解基因及代谢路径分析 | 第45-46页 |
| ·降解DBP功能基因 | 第46-47页 |
| ·功能基因的验证 | 第47-48页 |
| 5.结论 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-59页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第59页 |
