雪兔线粒体全基因组结构、遗传多样性及其系统进化分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| ·引言 | 第9-12页 |
| ·动物线粒体基因组结构特点 | 第9-10页 |
| ·兔属动物的研究现状 | 第10-11页 |
| ·系统发育分析简介 | 第11-12页 |
| ·雪兔研究现状 | 第12-15页 |
| ·目的和意义 | 第15-16页 |
| 2 雪兔线粒体全基因组分析 | 第16-39页 |
| ·实验材料 | 第16-17页 |
| ·主要实验试剂 | 第16-17页 |
| ·主要实验设备 | 第17页 |
| ·实验方法 | 第17-24页 |
| ·总DNA的提取与检测 | 第17-19页 |
| ·PCR扩增及其产物的检测和回收 | 第19-21页 |
| ·回收产物的克隆及测序 | 第21-24页 |
| ·数据处理 | 第24页 |
| ·结果与分析 | 第24-38页 |
| ·DNA提取检测结果 | 第24页 |
| ·线粒体DNA分段扩增结果 | 第24-25页 |
| ·克隆结果 | 第25-26页 |
| ·雪兔线粒体基因组基本构成 | 第26-29页 |
| ·基因间隔区与基因重叠区 | 第29页 |
| ·蛋白质编码基因及密码子使用 | 第29页 |
| ·蛋白质编码基因氨基酸组成 | 第29-30页 |
| ·tRNA二级结构 | 第30-33页 |
| ·线粒体基因组控制区特征 | 第33-34页 |
| ·雪兔变异分析 | 第34-35页 |
| ·雪兔PCGs和rRNA碱基多样性分析 | 第35页 |
| ·不同地区雪兔线粒体全基因组成的差异 | 第35-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 3 雪兔遗传多样性分析 | 第39-49页 |
| ·实验材料 | 第39页 |
| ·主要实验试剂 | 第39页 |
| ·主要实验设备 | 第39页 |
| ·实验方法 | 第39-40页 |
| ·总DNA的提取 | 第39页 |
| ·PCR扩增及其产物的检测和回收 | 第39页 |
| ·数据处理 | 第39-40页 |
| ·实验结果与分析 | 第40-48页 |
| ·DNA提取检测和扩增结果 | 第40页 |
| ·不同地区雪兔D-loop区遗传多样性分析 | 第40-41页 |
| ·种群遗传结构分析 | 第41-45页 |
| ·7个不同地区雪兔线粒体全基因组的遗传关系 | 第45-47页 |
| ·种群历史动态 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 4 兔属动物系统进化分析 | 第49-54页 |
| ·实验材料 | 第49页 |
| ·实验方法 | 第49-50页 |
| ·数据处理分析 | 第49-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-53页 |
| ·进化分析 | 第50页 |
| ·兔属动物进化分析 | 第50-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 5 讨论 | 第54-60页 |
| ·线粒体基因组的排列模式 | 第54页 |
| ·蛋白质基因结构 | 第54页 |
| ·tRNA二级结构 | 第54-55页 |
| ·控制区结构 | 第55页 |
| ·遗传多样性与分化 | 第55-56页 |
| ·种群历史动态 | 第56页 |
| ·进化分析 | 第56-57页 |
| ·基因渐渗分析 | 第57-60页 |
| 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |