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草鱼生长相关SNPs的筛选和群体的遗传结构分析

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 文献综述第12-25页
 前言第12页
   ·草鱼的遗传多样性的研究概况第12-18页
     ·形态学标记水平第13页
     ·蛋白标记水平第13-14页
       ·同工酶技术在草鱼遗传结构上的研究进展第13-14页
     ·DNA 分子标记水平第14-18页
       ·RFLP 技术在草鱼遗传结构上的研究进展第14-15页
       ·SSR 技术在草鱼遗传结构上的研究第15-16页
       ·RAPD 技术在草鱼遗传结构上的研究第16-17页
       ·SRAP 的分子标记技术在草鱼遗传结构上的研究第17-18页
   ·单核苷酸多态性的研究进展第18-23页
     ·单核苷酸多态性 DNA 标记第18-23页
       ·SNP 的定义及特点第18-19页
       ·SNPs 在水生动物遗传多样性的研究应用第19-21页
       ·SNP 用于生长性状的关联分析的研究第21-23页
   ·本研究的意义及技术路线第23-25页
     ·目的与意义第23页
     ·技术路线第23-25页
       ·草鱼生长相关的 SNP 标记的筛选第23-24页
       ·草鱼群体的遗传多样性分析第24-25页
第二章 草鱼醛缩酶B基因部分序列的SNP多态性及其与生长性状的关联分析第25-37页
   ·材料与方法第25-28页
     ·样品来源第25-26页
     ·主要试剂和材料第26页
     ·引物设计第26-27页
     ·SNP 位点的筛选第27页
     ·SNP 位点的分型第27页
     ·数据统计分析第27-28页
   ·结果与分析第28-35页
     ·醛缩酶 B 基因部分序列的扩增第28页
     ·醛缩酶 B 基因部分序列的 SNP 位点的获得和分析第28-29页
     ·醛缩酶 B 基因3个 SNP 位点在草鱼群体中的多态性分析第29-30页
     ·草鱼醛缩酶 B 基因3个 SNP 位点的多态性与草鱼生长性状关联分析第30-35页
   ·讨论第35-37页
第三章 草鱼羧肽酶 A1 基因部分片段的 SNP 多态性及其与生长性状的关联分析第37-46页
   ·材料与方法第37-40页
     ·实验材料第37-38页
     ·草鱼基因组 DNA 的提取第38页
     ·引物设计第38页
     ·PCR 扩增和 SNP 位点的筛选第38-39页
     ·SNP 位点的分型第39-40页
     ·数据统计分析第40页
   ·结果与分析第40-44页
     ·羧肽酶 A1 基因序列的扩增第40页
     ·羧肽酶 A1 基因部分序列的突变位点的获得和密码子的分析第40-41页
     ·羧肽酶 A1 基因的2个 SNP 位点在草鱼群体中的分布第41-42页
     ·草鱼羧肽酶 A1 基因 SNP 位点与草鱼生长性状关联分析第42-44页
   ·讨论第44-46页
第四章 草鱼 SNP 位点的筛选和六个群体的遗传结构分析第46-57页
   ·材料与方法第46-49页
     ·实验材料第46-47页
     ·实验方法第47-49页
       ·草鱼基因组 DNA 的提取第47页
       ·引物设计第47-48页
       ·PCR 扩增和 SNP 位点的筛选第48页
       ·SNP 位点的分型第48页
       ·数据统计与分析第48-49页
   ·结果与分析第49-55页
     ·三个基因部分序列的扩增第49页
     ·突变位点的获得和密码子的分析第49-50页
     ·SNP 位点的群体结构和遗传多样性分析第50-55页
       ·SNP 位点的基因型分布第50-52页
       ·遗传多样性分析与哈代-温伯格平衡第52-54页
       ·群体间的遗传结构分析第54-55页
   ·讨论第55-57页
全文总结第57-58页
参考文献第58-65页
致谢第65-66页
附录 1 中英文对照缩略词表(Abbreviations)第66-68页
附录 2 攻读硕士学位期间发表的论文第68页
 攻读硕士期间发表文章如下第68页

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