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病原细菌溶藻弧菌和铜绿假单胞菌中致病相关系统的调控机制

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第1章 文献综述第13-30页
   ·海水养殖病原菌溶藻弧菌第13-14页
   ·溶藻弧菌的毒力因子和致病机理第14-23页
     ·胞外蛋白酶第14页
     ·Ⅵ型分泌系统第14-23页
       ·Ⅵ型分泌系统的结构第17-19页
       ·Ⅵ型分泌系统的表达调控第19-21页
       ·Ⅵ型分泌系统的交互通讯第21-23页
   ·群体感应系统第23-24页
   ·人类致病菌溶藻弧菌第24-26页
   ·铜绿假单胞菌中Fur介导的全局调控第26-27页
   ·本研究主要内容及意义第27-30页
第2章 群体感应系统和RpoN调控溶藻弧菌Ⅵ型分泌系统第30-51页
   ·前言第30-31页
   ·实验材料第31-34页
     ·菌株、质粒和培养条件第31页
     ·引物第31-34页
     ·主要分析生物学试剂盒仪器设备第34页
     ·蛋白和DNA分析软件第34页
   ·实验方法第34-39页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备及转化第34页
       ·感受态细胞制备第34页
       ·感受态细胞转化第34页
     ·框内无标记缺失突变株的构建第34-36页
     ·插入失活突变株的构建第36页
     ·回补菌株的构建第36-37页
     ·生长曲线测定第37页
     ·Western blotting蛋白印迹第37-38页
       ·全菌蛋白样品制备第37页
       ·上清中蛋白样品制备第37页
       ·蛋白印迹第37-38页
     ·实时荧光定量PCR第38页
     ·运动性分析第38页
     ·胞外蛋白酶活性分析第38-39页
   ·实验结果第39-47页
     ·溶藻弧菌Ⅵ型分泌系统基因簇鉴定第39-40页
     ·突变株的构建第40-41页
     ·hcp基因及其编码蛋白的信息学分析第41页
     ·Hcp1蛋白的生长依赖型表达第41-42页
     ·群体感应系统调控Hcp1的表达第42-43页
     ·RpoN((δ~(54))和VasH调控Hcp1的表达第43-45页
     ·LuxR、RpoN和VasH调控其他T6SS基因第45-46页
     ·VasH调控运动性及胞外蛋白酶的活性第46-47页
   ·讨论第47-49页
   ·本章小结第49-51页
第3章 Ⅵ型分泌系统调控病原相关表型第51-64页
   ·前言第51页
   ·实验材料第51-54页
     ·菌株、质粒和培养条件第51-52页
     ·引物第52-54页
     ·主要分子生物学试剂盒仪器设备第54页
   ·实验方法第54-56页
     ·扫描电镜样品制备第55页
     ·生物被膜形成分析第55页
     ·生物聚集第55页
     ·胞外蛋白酶活性分析第55-56页
     ·鱼体攻毒实验第56页
   ·实验结果第56-63页
     ·T6SS突变株的扫描电镜第56-57页
     ·T6SS影响溶藻弧菌的运动性第57页
     ·T6SS影响溶藻弧菌生物被膜形成及聚集第57页
     ·T6SS影响溶藻弧菌胞外蛋白酶的形成第57-59页
     ·T6SSVA1单个基因影响运动性、生物被膜和胞外蛋白酶第59-63页
       ·T6SSVA1单个基因突变株构建第59-61页
       ·T6SSVA1单个基因影响多表型第61-63页
   ·讨论第63页
   ·本章小结第63-64页
第4章 PppA/PpkA1调控T6SS、QS和c-di-GMP合成第64-84页
   ·前言第64页
   ·实验材料第64页
   ·实验方法第64-67页
     ·c-di-GMP定量分析第66-67页
     ·生物芯片分析第67页
   ·实验结果第67-81页
     ·PppA/PpkA1调控Hcp1的表达和分泌第67-69页
       ·△pppA、△ppkA1和pppA~+突变株的构建第67-68页
       ·PppA/PpkA1调控Hcp1的表达和分泌第68-69页
     ·PppA/PpkA1调控Asp的表达第69-71页
     ·PppA/PpkA1通过LuxR调控Asp的表达第71-72页
     ·PppA/Ppk1A调控多表型第72-73页
     ·PppA/PpkA1通过c-di-GMP调控多表型第73-75页
     ·PppA和PpkA1缺失株全基因组转录谱分析第75-81页
   ·讨论第81-83页
   ·本章小结第83-84页
第5章 腺苷通过激活Fur来调控铜绿假单胞菌的病原性第84-110页
   ·前言第84-85页
   ·实验材料第85-87页
     ·菌株、质粒和培养条件第85-86页
     ·引物第86页
     ·主要分子生物学试剂和仪器设备第86-87页
     ·分析软件第87页
   ·实验方法第87-91页
     ·生物被膜分析第87页
     ·总RNA提取和芯片分析第87页
     ·实时荧光定量PCR第87页
     ·爬动性和鼠李糖脂分析第87-88页
     ·毒力因子分析第88页
     ·秀丽隐杆线虫慢性杀伤分析第88页
     ·Fur蛋白的表达和纯化第88-89页
     ·电泳迁移分析第89-90页
     ·对接分析第90-91页
   ·实验结果第91-107页
     ·腺苷减少铜绿假单胞菌中生物被膜的形成第91-93页
     ·腺苷通过减少鼠李糖脂生成来减弱运动性第93-96页
     ·腺苷降低多种毒力因子的产生第96页
     ·腺苷降低铜绿假单胞菌对线虫的致病性第96页
     ·腺苷抑制摄铁相关的调节子第96-104页
     ·腺苷影响Fur蛋白结合铁摄取基因第104页
     ·腺苷与Fur蛋白结合位点预测第104-107页
   ·讨论第107-108页
   ·本章小结第108-110页
第6章 结论和创新点第110-113页
   ·主要结论第110-111页
   ·论文创新点第111-112页
   ·展望第112-113页
参考文献第113-126页
攻读博士学位期间研究成果第126-127页
致谢第127页

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