用时滞微分方程模型重构基因调控网络
| 提要 | 第1-7页 |
| 第1章 绪论 | 第7-12页 |
| ·研究背景 | 第7页 |
| ·基因调控网络介绍 | 第7-9页 |
| ·基因调控网络研究的历史和现状 | 第9-10页 |
| ·基因调控网络研究的重要性 | 第10-11页 |
| ·基因调控网络研究的关键点和技术难题 | 第11页 |
| ·本文主要工作 | 第11-12页 |
| 第2章 基因数据预处理 | 第12-28页 |
| ·数据的形式及其形式转化 | 第12-16页 |
| ·基因表达谱 | 第12-15页 |
| ·基因调控网络数据及其他形式数据 | 第15-16页 |
| ·聚类分析 | 第16-27页 |
| ·常用聚类方法 | 第17-19页 |
| ·本文所用聚类方法及其创新 | 第19-27页 |
| ·多数据源融合 | 第27-28页 |
| ·数据源融合的概念和意义 | 第27页 |
| ·本文所用的数据源融合技术 | 第27-28页 |
| 第3章 基因调控网络的构建 | 第28-43页 |
| ·基因调控网络概述及常见方法 | 第28-33页 |
| ·布尔网络模型 | 第28-30页 |
| ·贝叶斯网络模型 | 第30-32页 |
| ·神经网络模型 | 第32页 |
| ·微分方程模型 | 第32-33页 |
| ·本文的创新方法 | 第33-39页 |
| ·数据形式的奇异值分解 | 第34-35页 |
| ·微分方程形式变形及网络的构建 | 第35-37页 |
| ·选择策略下的网络优化 | 第37-39页 |
| ·数据实验及网络构建 | 第39-43页 |
| ·有pathway 结果数据图的算法验证 | 第39-42页 |
| ·无pathway 结果数据图的算法验证 | 第42-43页 |
| 第4章 网络拓扑结构分析 | 第43-50页 |
| ·网络的基本特性 | 第43-44页 |
| ·本文对于基因调控网络拓扑结构的研究 | 第44-47页 |
| ·拓扑结构研究的结果验证 | 第47-50页 |
| 第5章 结论与展望 | 第50-52页 |
| ·工作总结 | 第50-51页 |
| ·系统生物学与基因调控网络的展望 | 第51-52页 |
| ·系统生物学发展与展望 | 第51页 |
| ·基因调控网络发展与展望 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 攻读硕士期间发表的论文和参与的项目 | 第58-59页 |
| 摘要 | 第59-62页 |
| ABSTRACT | 第62-64页 |
