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纤维堆囊菌遗传操作体系建立及其在埃博霉素生物合成改造中的应用

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-18页
符号说明及缩写词第18-21页
第一章 文献综述第21-44页
   ·粘细菌简介第21-27页
     ·粘细菌的典型特征及分类第21-24页
     ·粘细菌产生的次级代谢产物第24-27页
   ·纤维堆囊菌的特征第27-36页
     ·纤维堆囊菌的基本性质第27-29页
     ·纤维堆囊菌生长的细胞密度依赖性第29页
     ·纤维堆囊菌产生的次级代谢产物第29-30页
     ·聚酮类天然产物及其生物合成特征第30-33页
     ·埃博霉素生物学研究第33-36页
   ·纤维堆囊菌的遗传学研究第36-42页
     ·细菌接合转移第37-39页
     ·自然转化第39-40页
     ·纤维堆囊菌遗传操作体系第40-42页
   ·本文工作开展思路及研究内容第42-44页
第二章 纤维堆囊菌接合转移体系建立第44-86页
   ·实验材料与仪器试剂第45-49页
     ·菌株及质粒第45页
     ·主要培养基第45-46页
     ·主要实验试剂第46-48页
     ·主要仪器设备与耗材第48-49页
     ·数据库及分析软件第49页
   ·实验方法第49-68页
     ·纤维堆囊菌菌体培养第49-50页
     ·诱动接合转移载体构建第50-62页
       ·基因组DNA提取及部分消化第50-51页
       ·目的片段PCR扩增及后处理第51-54页
       ·质粒载体的酶切及连接转化第54-56页
       ·载体构建流程图第56-62页
     ·纤维堆囊菌与大肠杆菌间的接合转移第62-63页
       ·纤维堆囊菌与大肠杆菌间接合转移条件摸索第62页
       ·改进的抗生素添加接合转移方法第62-63页
     ·纤维堆囊菌接合子PCR验证及Slot bolt杂交验证第63-66页
     ·大肠杆菌间的接合转移第66-68页
   ·实验结果与讨论第68-84页
     ·纤维堆囊菌菌株性质第68-71页
     ·诱动接合转移载体pCMT61的构建第71-75页
       ·质粒pT19的构建第71-73页
       ·质粒pCC11的构建第73-74页
       ·质粒pCCMT61的构建第74-75页
     ·So0157-2抗生素添加接合转移方法建立第75-76页
     ·So0157-2接合子验证第76-78页
     ·同源片段大小对接合转移效率的影响第78-79页
     ·不同纤维堆囊菌接合转移效率比较第79-81页
     ·抗生素对大肠杆菌间接合转移效率的影响第81-84页
   ·本章小结第84-86页
第三章 纤维堆囊菌自然转化现象的发现及初步探索第86-98页
   ·实验材料第86-88页
     ·菌株及质粒第86-87页
     ·培养基及试剂第87页
     ·主要仪器设备与耗材第87-88页
   ·实验方法第88-91页
     ·纤维堆囊菌菌株培养第88页
     ·纤维堆囊菌自然转化实验第88页
     ·纤维堆囊菌自然感受态形成时间确定第88-89页
     ·转化子的PCR扩增验证第89页
     ·转化子的荧光原位杂交验证第89-90页
     ·纤维堆囊菌So0003-3自然转化条件分析第90-91页
     ·纤维堆囊菌So0003-3子实体CaCl_2转化第91页
   ·实验结果与讨论第91-97页
     ·纤维堆囊菌So0003-3形态观察第91-92页
     ·纤维堆囊菌So0003-3自然转化的发现及转化子验证第92-94页
     ·纤维堆囊菌自然感受态形成时间确定第94-95页
     ·纤维堆囊菌So0003-3自然转化的条件分析第95-96页
     ·转化方法在纤维堆囊菌中的改进以及初步应用第96-97页
   ·本章小结第97-98页
第四章 纤维堆囊菌中埃博霉素生物合成改造及代谢调控改造第98-138页
   ·实验材料第99-101页
     ·菌株及质粒第99-100页
     ·培养基及试剂第100页
     ·实验仪器第100页
     ·软件工具及数据库第100-101页
   ·实验方法第101-112页
     ·埃博霉素生物合成改造载体的构建第101-108页
       ·引物设计与产物扩增第101-103页
       ·PCR产物平末端化第103页
       ·粘粒cosmid6大量提取及质粒酶切测序第103-104页
       ·载体构建流程图第104-108页
     ·纤维堆囊菌So0157-2接合转移及接合子筛选第108-109页
     ·纤维堆囊菌接合子保存及纯化第109-110页
     ·纤维堆囊菌固体平板发酵第110页
     ·发酵产物HPLC及LC-MS检测分析第110-112页
   ·实验结果与讨论第112-137页
     ·MT结构域位点失活载体pCMC34的构建第112-114页
     ·KR7结构域位点失活载体pCDM7的构建第114-115页
     ·一次同源重组突变子发酵产物的HPLC及MS分析第115-124页
     ·二次同源重组突变子发酵产物HPLC及MS分析第124-127页
     ·埃博霉素碳骨架缩小初步探索第127-131页
     ·埃博霉素代谢调控改造第131-137页
   ·本章小结第137-138页
总结与展望第138-140页
附录第140-144页
参考文献第144-154页
致谢第154-155页
攻读学位期间发表的学术论文第155-156页
学位论文评阅及答辩情况表第156-157页
英文论文一第157-175页
英文论文二第175-194页

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