| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·研究体系微管蛋白(MT)介绍 | 第10-12页 |
| ·微管蛋白的分类 | 第10页 |
| ·微管蛋白的结构 | 第10-12页 |
| ·微管蛋白结构及其相关性质研究简介 | 第12页 |
| ·分子模拟技术介绍 | 第12-14页 |
| ·分子模拟技术简介 | 第12-13页 |
| ·分子动力学(MD)方法在蛋白质模拟中的应用与发展 | 第13-14页 |
| ·本论文涉及到的研究内容、研究目的和研究意义 | 第14-16页 |
| ·研究方法和内容 | 第14页 |
| ·研究目的 | 第14-15页 |
| ·研究意义 | 第15-16页 |
| 2 理论计算方法简介 | 第16-30页 |
| ·分子力学(Molecular Mechani cs,MM) | 第16-22页 |
| ·分子力场(Force Field) | 第16-21页 |
| ·分子力学基本原理和优化算法 | 第21-22页 |
| ·分子动力学(Molecular D ynamics,MD) | 第22-30页 |
| ·分子动力学基本原理和积分方法 | 第22-25页 |
| ·分子动力学模拟细节 | 第25-28页 |
| ·分子动力学轨迹分析方法 | 第28-30页 |
| 3 常温下微管蛋白构象转变及其动态过程的研究 | 第30-43页 |
| ·引言 | 第30页 |
| ·计算方法与实验体系 | 第30-33页 |
| ·实验体系 | 第31-32页 |
| ·计算方法 | 第32页 |
| ·结果分析方法 | 第32-33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-41页 |
| ·微管蛋白Pro(300)和Sol(300)的整体结构特征 | 第33-36页 |
| ·单独肽链Pep~i(300)的构象特征 | 第36-38页 |
| ·肽链Pep~p(300)的构象特征 | 第38-40页 |
| ·肽链Pep~s(300)的构象特征 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 4 微管蛋白变性机制的研究 | 第43-55页 |
| ·引言 | 第43页 |
| ·计算方法与实验体系 | 第43-44页 |
| ·实验体系 | 第43页 |
| ·计算方法 | 第43-44页 |
| ·结果与讨论 | 第44-53页 |
| ·微管蛋白在不同环境条件下整体结构特征 | 第44-47页 |
| ·肽链Pep~p的构象特征 | 第47-49页 |
| ·肽链Pep~s的构象特征 | 第49-53页 |
| ·构象的热力学性质 | 第53页 |
| ·本章小结 | 第53-55页 |
| 5 微管蛋白活性肽链构象及其折叠方式的研究 | 第55-66页 |
| ·引言 | 第55页 |
| ·计算方法和实验体系 | 第55-56页 |
| ·实验体系 | 第55-56页 |
| ·计算方法 | 第56页 |
| ·结果分析方法 | 第56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-65页 |
| ·不同肽链模型的折叠路径 | 第56-59页 |
| ·不同肽链的构象特征 | 第59-62页 |
| ·活性肽链(Ap~(15-25))在不同模拟体系中的构象特征 | 第62-65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| 结论 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 附录 | 第78-79页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
