| 提要 | 第1-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-11页 |
| ·生物信息学的发展概况 | 第7-8页 |
| ·计算机在生物信息中作用 | 第8页 |
| ·课题研究意义 | 第8-9页 |
| ·本文主要工作 | 第9-11页 |
| 第二章 相关生物学背景 | 第11-19页 |
| ·miRNA 简介 | 第11-13页 |
| ·siRNA 简介 | 第13-15页 |
| ·病毒 | 第15-16页 |
| ·基因表达调控网络 | 第16-18页 |
| ·相关生物信息数据库 | 第18-19页 |
| 第三章 miRNA 与siRNA | 第19-28页 |
| ·miRNA 与siRNA 的区别与联系 | 第19-22页 |
| ·研究方法 | 第22-27页 |
| ·miRNA 靶位识别原理 | 第22-24页 |
| ·实验数据获取、筛选及处理 | 第24-26页 |
| ·相同motif 的小RNA 靶位分析 | 第26-27页 |
| ·实验小结 | 第27-28页 |
| 第四章 miRNA 与病毒 | 第28-42页 |
| ·miRNA 与病毒的联系 | 第28-29页 |
| ·BLAST | 第29-31页 |
| ·BLAST 算法基础 | 第29页 |
| ·BLAST 搜索策略 | 第29-30页 |
| ·BLAST 本地化实现方法 | 第30-31页 |
| ·实验方法和步骤 | 第31-42页 |
| ·靶位标记方法 | 第31-33页 |
| ·实例数据统计 | 第33-35页 |
| ·统计结果分析 | 第35-36页 |
| ·miRNA 与病毒做BLAST 比对 | 第36-41页 |
| ·实验结果分析 | 第41-42页 |
| 第五章 siRNA 与病毒 | 第42-50页 |
| ·siRNA 与病毒的联系 | 第42-43页 |
| ·实验方法和步骤 | 第43-47页 |
| ·靶位标记 | 第43-45页 |
| ·siRNA 与病毒进行BLAST 比对 | 第45-47页 |
| ·启动子 | 第47-48页 |
| ·启动子简介 | 第47-48页 |
| ·siRNA-病毒BLAST 靶位与病毒启动子距离标注 | 第48页 |
| ·实验小结 | 第48-50页 |
| 第六章 同族病毒 | 第50-55页 |
| ·序列多重比对 | 第50-52页 |
| ·同族病毒比对分析 | 第52-54页 |
| ·miRNA、siRNA 与病毒 | 第54-55页 |
| 第七章 总结与展望 | 第55-57页 |
| ·工作总结 | 第55-56页 |
| ·工作展望 | 第56-57页 |
| 附件一 Oncogene 相关siRNA 靶位匹配的miRNA | 第57-59页 |
| 附件二 Tumor suppressor gene 相关siRNA 靶位匹配的miRNA | 第59-61页 |
| 附件三与seed region 顺式同序的miRNA 统计直方图 | 第61-65页 |
| 附件四人类疱疹病毒与Oncogene 相关siRNA BLAST 比对结果 | 第65-74页 |
| 附件五siRNA-病毒BLAST 靶位与病毒启动子距离标注(HSV-1 | 第74-79页 |
| 参考文献 | 第79-83页 |
| 摘要 | 第83-87页 |
| Abstract | 第87-90页 |
| 致谢 | 第90页 |
