| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 前言 | 第10-23页 |
| ·木薯植物学特性 | 第10-11页 |
| ·木薯的开发利用 | 第11-13页 |
| ·国内对木薯的研究 | 第13-14页 |
| ·木薯国外的研究进展 | 第14-17页 |
| ·表达序列标签的研究进展 | 第17-20页 |
| ·cDNA微阵列的研究进展 | 第20-22页 |
| ·本研究的目的 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-37页 |
| ·培养基和主要试剂 | 第23-24页 |
| ·木薯材料的采集 | 第24页 |
| ·RNA抽提 | 第24页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第24-26页 |
| ·Poly(A~+)mRNA的分离 | 第24-25页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第25页 |
| ·cDNA双链的合成和纯化 | 第25页 |
| ·PCR产物的酶切 | 第25页 |
| ·酶切PCR产物(cDNA)的分级和纯化 | 第25-26页 |
| ·载体的酶切和纯化 | 第26页 |
| ·cDNA和载体的连接 | 第26页 |
| ·连接产物的转化 | 第26页 |
| ·cDNA文库的鉴定 | 第26页 |
| ·质粒提取 | 第26-27页 |
| ·细菌培养 | 第26-27页 |
| ·质粒抽提与纯化 | 第27页 |
| ·cDNA序列测定 | 第27-28页 |
| ·EST序列的生物信息学分析 | 第28-30页 |
| ·EST序列处理的硬件环境和软件信息 | 第28-30页 |
| ·cDNA阵列探针的准备 | 第30-32页 |
| ·主要试剂 | 第30-31页 |
| ·木薯材料 | 第31页 |
| ·cDNA阵列制备 | 第31-32页 |
| ·用于cDNA阵列制备的克隆 | 第31页 |
| ·cDNA克隆的PCR扩增与质量控制 | 第31页 |
| ·PCR产物纯化和点样前处理 | 第31页 |
| ·cDNA阵列制备 | 第31-32页 |
| ·cDNA阵列探针的准备 | 第32页 |
| ·cDNA阵列杂交和数据提取 | 第32-37页 |
| ·预杂交和杂交 | 第32-33页 |
| ·洗膜 | 第33页 |
| ·cDNA阵列杂交数据提取和分析 | 第33-34页 |
| ·CyberT检验方法 | 第34-35页 |
| ·K—mean聚类分析 | 第35-37页 |
| 第三章 结果与分析 | 第37-74页 |
| ·RNA提取和cDNA合成 | 第37-38页 |
| ·大规模提取的质粒 | 第38页 |
| ·cDNA文库的质量鉴定 | 第38-39页 |
| ·EST序列生物信息学分析 | 第39-46页 |
| ·基本统计分析 | 第39-40页 |
| ·功能注释 | 第40-41页 |
| ·高丰度表达基因 | 第41-45页 |
| ·功能分类 | 第45-46页 |
| ·块根各发育时期基因表达谱研究 | 第46-74页 |
| ·杂交信号分析 | 第46-48页 |
| ·不同时期相同组织、不同组织相同时期的基因表达差异 | 第48-51页 |
| ·块根形成期块根、块根膨大期块根、工艺成熟期块根与苗期根相比的差异表达基因的变化 | 第51-53页 |
| ·特异差异表达基因的功能分析 | 第53-56页 |
| ·差异表达基因的功能分析 | 第56-65页 |
| ·块根差异基因表达谱分析 | 第65-68页 |
| ·木薯膨大期各组织特异差异基因 | 第68-74页 |
| ·叶的特异差异基因功能分析 | 第68页 |
| ·茎特异差异表达基因功能分析 | 第68-69页 |
| ·根的特异差异表达基因功能分析 | 第69-74页 |
| 第四章 结论 | 第74-77页 |
| 参考文献 | 第77-84页 |
| 附录 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第86页 |