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紫云英参与共生固氮的结瘤素基因的分离与鉴定

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略语表第10-11页
1.前言—文献综述第11-44页
   ·共生固氮第11-34页
     ·豆科植物与根瘤菌的共生结瘤固氮第11-14页
     ·豆科植物结瘤的遗传学和功能基因组学研究第14-22页
       ·植物突变体的研究揭示了结瘤早期信号传导和固氮的分子基础第14-18页
       ·功能基因组学的研究揭示了共生双方的代谢交换第18-22页
     ·共生结瘤信号传导分子第22-31页
       ·激素类第22-30页
       ·多肽第30-31页
     ·百脉根(Lotus japonicus,Lj)和苜蓿的(Medicago truncatula,Mt)的基因组学研究第31-34页
       ·Mt的基因组测序第31-32页
       ·Lj的基因组测序第32页
       ·Lj和Mt的重复序列第32-33页
       ·和其它豆科植物基因组之间的比较第33页
       ·Mt与Lj基因组之间的整合第33-34页
   ·mRNA基础上的差异基因分离方法第34-42页
     ·mRNA差异显示法(mRNA differential display,DDRT-PCR)第34-35页
     ·代表性差异分析(Representational difference analysis,RDA)第35-37页
     ·抑制差减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)第37-39页
     ·基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)第39-40页
     ·基因鉴定集成法(Integrated procedure for gene identification,IPGI)第40-41页
     ·微阵列技术(Microarray)第41-42页
   ·研究目的和意义第42-44页
2.材料和方法第44-61页
   ·材料第44-46页
     ·植物材料第44页
     ·转化菌株第44页
     ·营养液与培养基配方第44-45页
     ·常用贮存液和缓冲液配方第45-46页
     ·主要分子生物学试剂第46页
   ·方法第46-61页
     ·紫云英总DNA、RNA的提取及mRNA的分离制备第46-48页
       ·总DNA的提取第46-47页
       ·总RNA的提取与纯化第47页
       ·mRNA的分离纯化第47-48页
     ·抑制差减杂交第48-51页
       ·单链cDNA的合成第48-49页
       ·双链cDNA的合成、纯化和浓缩第49页
       ·酶切消化第49-50页
       ·接头连接第50页
       ·两次差减杂交第50-51页
       ·两次PCR扩增第51页
     ·差减cDNA文库的构建第51页
     ·差示筛选第51-52页
     ·SMART cDNA的合成第52-53页
     ·Virtual Northern blotting第53-54页
       ·毛细管法转膜第53-54页
       ·探针制备及杂交第54页
     ·cDNA末端快速扩增法(RACE)钓取目的基因的全长cDNA第54-58页
       ·基因特异性引物(GSP)设计第56-57页
       ·RACE-Ready cDNA的合成第57页
       ·Touchdown PCR扩增cDNA末端(RACE)第57-58页
       ·RACE产物的克隆测序及目的基因全长cDNA的获取第58页
     ·RT-PCR第58-60页
     ·序列分析第60页
     ·统计分析第60-61页
3.结果与分析第61-82页
   ·抑制差减杂交结果分析第61-62页
     ·接头连接及其效率检测第61页
     ·两次PCR扩增结果分析第61-62页
   ·差减cDNA文库的构建第62-63页
   ·差示筛选第63-66页
     ·插入片段的扩增第63-64页
     ·斑点杂交的结果第64-65页
     ·核苷酸序列测定与同源性分析第65-66页
   ·Virtual Northern blotting结果分析第66-67页
   ·目的基因全长cDNA的克隆及其序列分析第67-77页
     ·编码CCPs(cysteine cluster proteins)同源多肽的基因第69-71页
     ·两个编码植物脂类转运蛋白(lipid transfer proteins,LTPs)同源物的基因第71-74页
     ·一个编码Usp(universal stress protein family)同源蛋白的基因第74-77页
   ·基因表达分析第77-82页
4.讨论第82-88页
   ·CCP类蛋白质与植物的防御蛋白家族第82-83页
   ·两个被首次报道的与根瘤形成有关的LTP类基因第83-85页
   ·为什么有如此多的抗微生物类蛋白质在根瘤形成中被涉及第85页
   ·AsD243与植物中的细菌Usp家族同源基因第85-88页
参考文献第88-105页
致谢第105-106页
论文发表情况第106页

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