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中国原产华东葡萄抗白粉病基因cDNA文库构建及其EST序列分析

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-17页
第一章 研究进展及本研究目的第17-37页
   ·研究进展第17-35页
     ·全长cDNA克隆策略第17-23页
       ·cDNA文库大量测序技术第17-21页
   1.l.1.2 cDNA末端快速扩增法(RACE)第21页
       ·硅片克隆第21-22页
       ·判断全长cDNA序列的一般标准第22-23页
     ·植物功能基因组学研究第23-27页
       ·植物表达序列标签第23-24页
       ·植物基因功能研究第24-27页
         ·基因表达的系统分析((sAGE)第24页
         ·cDNA芯片与寡核苷酸芯片第24-25页
         ·蛋白质组研究第25页
         ·应用反向遗传学研究植物基因功能第25-26页
         ·生物信息学及其应用第26-27页
     ·植物抗病性研究进展第27-34页
       ·植物抗病性的表现第27-28页
       ·植物抗病的分子机制第28-29页
       ·植物抗病性的遗传基础第29-34页
         ·植物抗病基因第29-32页
         ·植物防卫基因第32-34页
     ·葡萄抗白粉病简况第34-35页
       ·葡萄白粉病的起源和分布第34页
       ·葡萄属植物抗白粉病的分子生物学研究第34-35页
   ·研究目的和意义第35-37页
第二章 田间人工接种葡萄白粉病病原菌诱导中国原产华东葡萄“白河-35-1”株系早期叶片cDNA文库构建第37-48页
   ·材料与试剂第37-38页
     ·材料与处理第37页
     ·cDNA文库构建主要试剂第37-38页
   ·方法第38-45页
     ·总RNA的提取与检测第38页
     ·总RNA的纯化和检测第38-39页
     ·DNA文库构建及检测第39-45页
   ·结果第45-46页
     ·cDNA文库构建样品总RNA浓度和质量检测结果第45页
     ·cDNA的合成第45-46页
   ·讨论第46-48页
     ·构建的cDNA文库的评价第46-47页
     ·未扩增cDNA文库的滴度与重组率第47-48页
第三章 田间人工接种葡萄白粉病原菌诱导中国原产华东葡萄“白河-35-1”株系早期叶片cDNA文库EST序列分析第48-64页
   ·材料第48页
   ·方法第48-50页
     ·制备cDNA文库测序平板第48页
     ·克隆形式的转换第48页
     ·碱裂解法小量提取质粒第48-49页
     ·重组质粒Sfi1酶切鉴定及测序第49页
     ·EST序列分析方法第49-50页
       ·测序结果的初步分析第49-50页
       ·Blastn和Blastx分析方法第50页
   ·结果第50-52页
     ·转化效率第50-51页
     ·序列的产生第51页
     ·Blastn的分析结果第51页
     ·Blastx的分析结果第51-52页
   ·讨论第52-64页
     ·植物基因功能第52页
     ·抗病防卫反应基因作用的研究第52-59页
       ·几丁质酶第52-53页
       ·细胞色素P450第53-54页
       ·多酚氧化酶第54-55页
       ·苯丙氨酸解氨酶和4-香豆酸辅酶A连接酶第55-59页
     ·金属硫蛋白第59-60页
     ·抗病信号传导途径第60-64页
第四章 中国原产华东葡萄抗白粉病泛素结合酶蛋白基因全长cDNA序列分析第64-73页
   ·材料和方法第65-66页
     ·材料第65页
     ·方法第65-66页
       ·泛素结合酶基因的克隆和测序方法第65-66页
       ·利用NCBI网址中的ORF finder、Blastn和Blastx软件对泛素结合酶基因进行序列分析和同源性比较分析第66页
       ·利用简单模块构架搜索工具对泛素结合酶基因所编码的蛋白一级序列进行功能结构域分析第66页
       ·利用DNASTAR软件对泛素结合酶基因所编码的蛋白质分子量和等电点以及该蛋白序列多重对齐分析和进化关系的分析第66页
   ·结果与分析第66-71页
     ·VpUBC克隆及序列分析第66-68页
     ·Blast nr和Blastx分析结果第68页
     ·不同生物泛素结合酶氨基酸序列同源性分析和同源性分类分析第68-71页
   ·讨论第71-73页
     ·VpUBC蛋白UBCc结构域的功能第71页
     ·植物蛋白泛素化与抗病性的关系第71-73页
第五章 中国原产华东葡萄抗白粉病环化酶基因全长cDNA序列分析及原核表达第73-83页
   ·材料第73页
     ·cDNA文库材料第73页
     ·植物材料第73页
   ·方法第73-76页
     ·cDNA片段克隆、测序和分析方法第73页
       ·环化酶基因的克隆和测序方法第73页
       ·利用NCBI网址中的ORF finder、Blastn和Blastx软件对环化酶基因进行序列分析和同源性比较分析第73页
   5 2.1.3 利用简单模块构架搜索工具环化酶基因所编码的蛋白一级序列进行功能结构域分析第73页
       ·利用DNASTAR软件对环化酶基因所编码的蛋白质分子量和等电点分析第73页
     ·目的基因的克隆及原核表达第73-76页
       ·目的基因cDNA全长序列的PCR扩增第73页
       ·目的基因cDNA片段的回收和克隆第73-74页
         ·目的基因cDNA片段的回收方法第73页
         ·回收片段与克隆载体(pGEM-T-easy)的连接反应方法第73-74页
         ·大肠杆菌感受态细胞的制备与连接产物的转化方法第74页
         ·重组质粒的筛选与鉴定方法第74页
         ·重组质粒的酶切鉴定第74页
       ·原核表达载体构建第74-75页
         ·目标片段的回收第74页
         ·目的基因与pGEX-4T-1载体的连接及转化第74-75页
         ·重组原核表达载体酶切鉴定第75页
       ·葡萄环化酶基因在大肠杆菌中的诱导融合表达第75-76页
   ·结果分析第76-81页
     ·VpCyclase克隆及序列分析第76-78页
     ·Blastnr和Blastx结果分析第78-79页
     ·中国原产华东葡萄环化酶基因的PCR扩增第79页
     ·葡萄环化酶基因的克隆和测序第79页
     ·葡萄环化酶基因原核表达载体的构建第79-80页
     ·葡萄环化酶基因在大肠杆菌中的诱导融和表达第80-81页
   ·讨论第81-83页
     ·葡萄环化酶基因功能的研究第81-82页
     ·葡萄环化酶基因的原核表达的研究第82-83页
第六章 中国原产华东葡萄抗白粉病病程相关蛋白基因全长cDNA序列分析第83-102页
   ·材料第84页
     ·cDNA文库材料第84页
     ·植物材料第84页
   ·方法第84-88页
     ·cDNA片段克隆、测序和分析方法第84页
       ·病程相关蛋白基因的克隆和测序方法第84页
       ·利用NCBI网址中的ORF finder、Blastn和Blastx软件对病程相关蛋白基因进行序列分析和同源性比较分析第84页
       ·利用简单模块构架搜索工具对病程相关蛋白基因所编码的蛋白一级序列进行功能结构域分析第84页
       ·利用DNASTAR软件对病程相关蛋白基因所编码的蛋白质分子量和等电点以及该蛋白序列多重对齐分析和进化分类分析第84页
     ·中国原产华东葡萄株系“白河-35-1”、“广西-1”和毛葡萄株系“泰山-12”基因组DNA片段克隆、测序方法第84-88页
       ·葡萄基因组DNA提取方法第84页
       ·目的基因DNA全长序列的PCR扩增第84-85页
         ·引物的设计与合成第84-85页
         ·PCR反应体系第85页
         ·PCR扩增程序第85页
       ·目的基因DNA片段的回收和克隆第85-88页
         ·目的基因 DNA片段的回收第85页
         ·回收片段与克隆载体(pGEM-T-easy)的连接反应第85-86页
         ·大肠杆菌感受态细胞的制备与连接产物的转化第86-87页
         ·重组质粒的筛选与鉴定第87页
         ·重组质粒的酶切鉴定第87-88页
   ·结果与分析第88-99页
     ·VpPR10克隆及序列分析第88-89页
     ·同源性比较分析第89-90页
     ·葡萄属植物不同种PR10基因的克隆、测序及核酸序列分析第90-95页
     ·葡萄属植物不同种PR10基因DNA序列外显子同源性分析第95页
     ·葡萄属植物不同种PR10基因推导的氨基酸序列同源性分析第95-99页
   ·讨论第99-102页
     ·植物VpPR10蛋白BetV1结构域第99-100页
     ·植物PR10蛋白功能第100-102页
第七章 结论第102-105页
参考文献第105-121页
附表3-1第121-127页
附表3-2第127-130页
附件1第130-132页
附件2第132-155页
英文缩略词第155-158页
致谢第158-159页
作者简介第159-160页

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