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环境因素调控鼠疫耶尔森氏菌基因表达的比较转录谱学研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-8页
缩略语第8-9页
前言第9-23页
 1.鼠疫危害严重第9-10页
 2.鼠疫菌生物学特性、传播和致病过程第10-12页
 3.鼠疫菌基因表达的环境因素调控研究概况第12-14页
 4.DNA芯片转录谱技术在微生物基因调控研究中的应用第14-18页
 5.本研究的目的和立题依据第18-22页
 参考文献第22-23页
第一章 温度调控鼠疫菌全局基因表达的研究第23-64页
 1.前言第23页
 2.材料与方法第23-32页
     ·实验菌株第23-24页
     ·细菌培养第24页
     ·DNA芯片转录谱分析的实验设计第24-27页
     ·DNA芯片转录谱分析的实验方案第27-32页
 3.结果与讨论第32-44页
     ·生长温度(26/37℃)转换刺激元第32-37页
     ·热休克刺激元第37-40页
     ·冷休克刺激元第40-44页
 温度(26/37℃)刺激元的芯片分析结果(表1-8)第44-53页
 热休克刺激元的DNA芯片分析结果(表1-9)第53-55页
 热休克刺激元的DNA芯片分析结果(表1-10)第55-58页
 冷休克刺激元的DNA芯片分析结果(表1-11)第58-61页
 参考文献第61-64页
第二章 鼠疫菌高盐高渗刺激元和OmpR调控元的研究第64-82页
 1.前言第64页
 2.材料与方法第64-67页
     ·ΔompR突变菌株的构建第64-66页
     ·ΔompR突变株的表型实验第66页
     ·刺激元和OmpR调控元分析第66-67页
 3.结果与讨论第67-78页
     ·高盐高渗刺激元第67-75页
     ·ΔompR突变株的表型结果分析第75页
     ·OmpR调控元第75-78页
 表2-4 OmpR调控元的DNA芯片分析结果(表2-4)第78-81页
 参考文献第81-82页
第三章 鼠疫菌H_2O_2刺激元和OxyR调控元的研究第82-98页
 1.前言第82页
 2.材料与方法第82-84页
 3.结果与讨论第84-90页
     ·H_2O_2刺激元第84-85页
     ·OxyR的序列和遗传组成分析第85-87页
     ·OxyR调控元第87-90页
 H_2O_2刺激元的DNA芯片分析结果(表3-2)第90-92页
 OxyR调控元的DNA芯片分析结果(表3-3)第92-96页
 参考文献第96-98页
第四章 鼠疫菌低镁刺激元和PhoP调控元的研究第98-119页
 1.前言第98页
 2.材料与方法第98-100页
     ·ΔphoP突变菌株的构建第98-99页
     ·低镁刺激元分析第99页
     ·PhoP调控元分析第99-100页
     ·PhoP结合位点的生物信息学分析第100页
 3.结果与讨论第100-112页
 鼠疫菌PhoP调节基因上游结合位点预测(表4-4)第112-117页
 参考文献第117-119页
第五章 DNA芯片数据的定量PCR验证第119-126页
 1.前言第119页
 2.材料与方法第119-122页
 3.结果与讨论第122-125页
 参考文献第125-126页
第六章 多个转录谱数据的综合分析第126-156页
 1.前言第126页
 2.已知或可能的毒力基因(簇)转录的多因素调节第126-131页
 3.多个条件DNA芯片转录谱的聚类分析第131-138页
 4.预测可能的操纵子第138-146页
 鼠疫菌毒力相关基因的温度调节(表6-1)第146-147页
 本研究预测的鼠疫菌操纵子(表6-2)第147-153页
 参考文献第153-156页
综述第156-163页
致谢第163-164页
发表的文章第164页

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