酵母基因组减数分裂重组的生物信息学分析
| 摘 要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 目 录 | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| ·生物信息学 | 第10-13页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第10-11页 |
| ·生物信息学的定义 | 第11页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第11-13页 |
| ·基因重组 | 第13-15页 |
| ·基因重组的概念 | 第13页 |
| ·重组的意义以及突变和重组 | 第13页 |
| ·重组的分类 | 第13-14页 |
| ·同源重组 | 第14页 |
| ·同源重组的基本概念和分类 | 第14页 |
| ·同源重组的步骤 | 第14页 |
| ·有丝分裂重组 | 第14-15页 |
| ·本课题的任务及主要研究任务 | 第15-17页 |
| ·课题任务 | 第15页 |
| ·主要研究成果 | 第15-16页 |
| ·论文结构 | 第16-17页 |
| 第二章 基因组序列统计特征分析 | 第17-27页 |
| ·序列统计特征分析方法概要 | 第17页 |
| ·几种常用的序列统计特征 | 第17-22页 |
| ·寡核苷酸含量 | 第17-18页 |
| ·密码子使用偏性 | 第18-22页 |
| ·遗传密码 | 第18-19页 |
| ·同义密码子使用模式 | 第19页 |
| ·密码子使用偏性的生物基础 | 第19-20页 |
| ·密码子使用偏性研究的意义 | 第20页 |
| ·密码子使用偏性的量化 | 第20-22页 |
| ·分析密码子使用偏性的统计方法 | 第22页 |
| ·氨基酸组分 | 第22页 |
| ·几种常用的统计方法 | 第22-27页 |
| ·相关性分析 | 第22-24页 |
| ·聚类分析 | 第24-25页 |
| ·因子分析 | 第25-27页 |
| 第三章 PERL在生物信息学中的应用 | 第27-32页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·Perl在生物信息学应用中的突出优势 | 第27-28页 |
| ·编程容易 | 第27页 |
| ·程序完成迅速 | 第27页 |
| ·可移植性好、执行速度快、维护性好 | 第27-28页 |
| ·与本文相关的Perl的使用 | 第28-32页 |
| ·安装 | 第28页 |
| ·运行 | 第28页 |
| ·相关语法 | 第28-32页 |
| ·文件操作 | 第29页 |
| ·序列处理 | 第29页 |
| ·正则表达式 | 第29-32页 |
| 第四章 酵母减数分裂重组分析 | 第32-47页 |
| ·酵母减数分裂重组热点和冷点的数据获取 | 第32-34页 |
| ·酵母减数分裂重组热点和冷点的定位 | 第32-33页 |
| ·数据的来源和数据格式 | 第33-34页 |
| ·热点和冷点的序列特征分析 | 第34-40页 |
| ·数据 | 第34-36页 |
| ·结果 | 第36-40页 |
| ·重组热点和冷点中的GC含量和GC3S | 第36页 |
| ·重组频率与基因密码子使用的关系 | 第36-40页 |
| ·酵母全基因组的重组率分析 | 第40-47页 |
| ·数据 | 第40页 |
| ·结果 | 第40-47页 |
| ·全基因组密码子使用偏性 | 第40-44页 |
| ·相关分析 | 第44-45页 |
| ·氨基酸组分 | 第45-46页 |
| ·双联碱基相对丰度 | 第46-47页 |
| 第五章 基于重组分析的假说 | 第47-51页 |
| ·Hill－Robertson效应 | 第47页 |
| ·基因转换的GC偏性效应 | 第47-51页 |
| ·基本概念 | 第47-48页 |
| ·基因转换偏性的机制 | 第48页 |
| ·基因组进化中的基因转换偏性的一些证据 | 第48-50页 |
| ·基因转换偏性和减数分裂重组 | 第50-51页 |
| 第六章 总结与展望 | 第51-53页 |
| ·工作总结 | 第51-52页 |
| ·展望 | 第52-53页 |
| 致 谢 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 附录一 | 第57-58页 |
