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猪粪堆肥中微生物变化规律及芽孢杆菌分离与鉴定

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第11-22页
   ·我国畜牧业排放粪污对环境污染现状第11-13页
     ·我国畜牧业粪污排放的恶劣程度第11-12页
     ·粪污对大气的污染第12页
     ·粪污对水体的污染第12页
     ·粪污放对土壤的污染第12-13页
   ·堆肥技术处理畜牧业粪污的方法和原理第13-18页
     ·畜禽粪污的特点第13-14页
     ·堆肥技术概念第14页
     ·畜禽粪污好氧堆肥的技术原理第14-15页
     ·堆肥中的微生物过程第15-16页
     ·研究堆肥微生物的分子生物学技术第16-17页
     ·DGGE的原理第17-18页
   ·芽孢杆菌的研究进展第18-22页
     ·芽孢杆菌属第18-20页
     ·16S rRNA方法鉴定菌种的原理与应用第20-22页
第二章 研究目的和意义第22-24页
第三章 材料和方法第24-48页
   ·试验材料第24-28页
     ·主要试剂及药品第24页
     ·缓冲液和常用试剂的配置第24-26页
     ·主要培养基第26-27页
     ·主要设备仪器第27-28页
   ·试验方法第28-48页
     ·条剁式自然堆肥系统第28页
     ·堆肥指标的测定第28-33页
     ·堆肥不同温期样品的采集第33页
     ·样品中微生物的分离和计数第33-34页
     ·样品中微生物总DNA的提取和纯化第34-35页
       ·粗提DNA第34-35页
       ·DNA的纯化第35页
     ·基因组DNA检测第35-36页
       ·基因组DNA质量浓度检测第35-36页
       ·基因组DNA的琼脂糖凝胶检测第36页
     ·细菌V3区PCR扩增和琼脂糖检测第36-37页
     ·DGGE凝胶电泳第37-41页
       ·制作水平变性胶第37-40页
       ·DGGE电泳第40-41页
       ·DGGE染色第41页
       ·凝胶成像第41页
     ·DGGE分析第41-43页
       ·Quantity One软件包分析第41页
       ·显著条带回收测序分析第41-43页
     ·芽孢杆菌的分离和纯化培养第43-44页
     ·芽孢杆菌的16S rRNA鉴定第44-45页
       ·芽孢杆菌染色体DNA的提取和纯化第44页
       ·PCR扩增和琼脂糖电泳第44-45页
     ·芽孢杆菌的传统鉴定第45-47页
       ·芽孢杆菌的形态观察第45页
       ·芽孢杆菌的芽孢观察第45页
       ·芽孢杆菌的生理生化鉴定第45-47页
     ·芽孢杆菌的功能检测第47-48页
第四章 试验结果第48-67页
   ·堆肥结果和指标的测定值第48-52页
     ·堆体的表观形态第48页
     ·堆体的温度变化第48-49页
     ·堆体的pH值变化第49-50页
     ·堆体的C/N值变化第50-51页
     ·堆体的其它元素变化第51-52页
   ·微生物的传统培养第52-53页
   ·微生物基因组DNA第53-55页
     ·基因组DNA含量浓度检测第53页
     ·基因组DNA的琼脂糖检测第53-55页
   ·DGGE分析堆肥微生物变化规律第55-60页
     ·细菌V3区扩增片段第55页
     ·细菌V3区DGGE电泳图第55-56页
     ·软件分析DGGE图谱第56-60页
     ·割胶回收条带测序分析第60页
   ·芽孢杆菌的分离和鉴定第60-67页
     ·芽孢杆菌的分离第60-62页
     ·芽孢杆菌的鉴定第62-67页
       ·菌落形态鉴定第62-63页
       ·生理生化鉴定第63页
       ·细菌16S rRNA鉴定第63-65页
       ·菌株功能的初步探讨第65-67页
第五章 讨论与分析第67-74页
   ·不同因素对堆肥微生物的影响第67-69页
     ·温度的影响第67页
     ·C/N值的影响第67-68页
     ·含水率的影响第68页
     ·pH值的影响第68-69页
   ·堆肥中总DNA的提取第69页
   ·堆肥微生物的变化规律第69-72页
   ·芽孢杆菌的分离和鉴定第72-73页
   ·芽孢杆菌的功能探讨第73-74页
第六章 小结第74-75页
   ·本研究所取得的成果及创新第74页
   ·下一步值得研究的工作第74-75页
参考文献第75-81页
附录 (获得的芽孢杆菌16S RRNA基因序列)第81-85页
致谢第85页

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