| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| 1 鱼类体色概述 | 第11-15页 |
| 1.1 鱼类色素细胞 | 第11-13页 |
| 1.2 黑色素合成通路 | 第13页 |
| 1.3 影响鱼类体色形成的因素 | 第13-15页 |
| 2 基因组学分析中的基因型鉴定方法 | 第15-18页 |
| 2.1 全基因组关联分析 | 第16页 |
| 2.2 RNA-Seq测序技术 | 第16-17页 |
| 2.3 BSA混池测序方法 | 第17-18页 |
| 3 本研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 基于SNP分型芯片和BSA技术解析黄河鲤红色突变家系的遗传机制 | 第19-29页 |
| 1 材料和方法 | 第19-21页 |
| 1.1 样品采集以及DNA提取 | 第19-20页 |
| 1.2 SNP分型 | 第20页 |
| 1.3 测序数据分析 | 第20-21页 |
| 2 结果 | 第21-25页 |
| 2.1 SNP分型结果 | 第21-22页 |
| 2.2 BSA分析结果 | 第22-25页 |
| 2.2.1 测序数据比对结果 | 第22-23页 |
| 2.2.2 两群体内差异SNP分析 | 第23-25页 |
| 3 讨论 | 第25-29页 |
| 第三章 白化俄罗斯鲟(A.GUELDENSTAEDTII)的比较转录组学研究 | 第29-41页 |
| 1 材料和方法 | 第29-31页 |
| 1.1 RNA提取 | 第29页 |
| 1.2 转录组组装和注释 | 第29-30页 |
| 1.3 差异基因表达分析 | 第30页 |
| 1.4 实时PCR荧光定量表达分析 | 第30-31页 |
| 2 结果 | 第31-36页 |
| 2.1 转录组组装和注释 | 第31-33页 |
| 2.2 鉴别和验证差异基因表达 | 第33-35页 |
| 2.3 GO富集和通路分析 | 第35-36页 |
| 3 讨论 | 第36-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-51页 |
| 附录一 | 第51-52页 |
| 附录二 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 硕士在读期间发表论文情况 | 第54页 |