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基于环境污水监测的札如病毒分子流行病学特征初步分析

摘要第8-12页
ABSTRACT第12-17页
英文缩略词说明第18-19页
前言第19-33页
    1 研究背景第19-30页
        1.1 札如病毒相关的分子生物学研究进展第19-23页
        1.2 札如病毒相关的人类疾病研究进展第23-26页
        1.3 札如病毒监测研究进展第26-30页
    2 研究目的与意义第30-32页
        2.1 本研究的目的第30-31页
        2.2 本研究的意义第31-32页
    3 本研究的技术路线第32-33页
材料与方法第33-51页
    1 实验材料第33-36页
        1.1 标本来源第33页
        1.2 主要试剂与耗材第33-35页
        1.3 主要仪器设备第35-36页
        1.4 主要软件第36页
    2 实验方法第36-48页
        2.1 环境污水标本采集与浓缩第36-39页
        2.2 核酸提取、基因扩增及序列测定第39-48页
    3 札如病毒VP1部分基因序列的分析第48-49页
        3.1 序列整理与型别鉴定第48页
        3.2 序列的同源性分析第48页
        3.3 序列的系统进化分析第48-49页
        3.4 序列的重组分析第49页
    4 质量控制第49-51页
        4.1 实验室操作中的质量控制第49页
        4.2 其他相关步骤质量控制第49-51页
结果第51-82页
    1 环境污水标本中检出SaV基因型的地理、时间分布第51-59页
        1.1 三市污水标本中SaV基因型检出概况第51-53页
        1.2 济南市污水标本中检出SaV基因型的时间分布第53-55页
        1.3 临沂市污水标本中检出SaV基因型的时间分布第55-57页
        1.4 烟台市污水标本中检出SaV基因型的时间分布第57-59页
        1.5 污水标本中主要基因型在寒冷/温暖季节的检出差异第59页
    2 环境污水标本中SaV序列的同源性分析第59-66页
        2.1 污水标本中SaV非重组基因型序列的同源性分析第60-62页
        2.2 污水标本中SaV两片段重组序列的同源性分析第62-65页
        2.3 污水标本中SaV三片段重组序列的同源性分析第65-66页
    3 环境污水标本中SaV序列的系统进化分析第66-77页
        3.1 污水标本中常见基因型代表序列的系统进化分析第66-71页
        3.2 污水标本中稀少基因型代表序列的系统进化分析第71-73页
        3.3 基因群内两片段重组序列的分段系统进化分析第73-76页
        3.4 基因群内三片段重组序列的分段系统进化分析第76-77页
    4 环境污水标本中重组基因型代表序列的重组分析第77-82页
        4.1 GⅠ.1+GⅠ.2重组序列的相似曲线分析第77页
        4.2 GⅠ.2+GⅠ.1重组序列的相似曲线分析第77-78页
        4.3 GⅠ.1+GⅠ.6重组序列的相似曲线分析第78-79页
        4.4 GⅠ.6+GⅠ.1重组序列的相似曲线分析第79页
        4.5 GⅠ.2+GⅠ.6重组序列的相似曲线分析第79-80页
        4.6 GⅠ.6+GⅠ.2重组序列的相似曲线分析第80页
        4.7 GⅠ.2+GⅠ.1+GⅠ.2重组序列的相似曲线分析第80-82页
讨论第82-92页
本研究的主要先进性和不足第92-93页
结论第93-94页
附录、附图、附表第94-97页
    附表1第94-97页
参考文献第97-111页
致谢第111-112页
攻读学位期间发表的学术论文目录第112-113页
学位论文评阅及答辩情况第113页

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