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基于分子标记对化州柚及其近缘品系的分类鉴别研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
缩略词表(Abbreviation)第9-14页
引言第14-16页
第1章 文献研究第16-23页
    1.1 化橘红基原植物的概况第16-17页
        1.1.1 化橘红的用药历史沿革第16页
        1.1.2 化橘红的质量研究第16-17页
    1.2 化橘红的鉴别研究第17-18页
        1.2.1 毛橘红与光橘红的鉴别研究第17页
        1.2.2 毛橘红的品系鉴别研究第17-18页
    1.3 分子标记的研究进展第18-21页
        1.3.1 DNA条形码标记第19页
        1.3.2 SCoT分子标记第19-20页
        1.3.3 SRAP分子标记第20页
        1.3.4 SCAR标记第20-21页
        1.3.5 分子标记技术在化橘红种质资源研究中的应用第21页
    1.4 小结第21-23页
第2章 化州柚及其近缘品系的DNA条形码研究第23-31页
    2.1 材料与试剂第23-24页
        2.1.1 实验材料第23-24页
        2.1.2 实验仪器和试剂第24页
    2.2 实验方法第24-25页
        2.2.1 DNA提取及检测第24-25页
        2.2.2 PCR扩增第25页
        2.2.3 电泳检测及测序第25页
        2.2.4 数据处理第25页
    2.3 结果与分析第25-29页
        2.3.1 总DNA提取质量第25-26页
        2.3.2 PCR扩增结果第26-27页
        2.3.3 序列分析第27-28页
        2.3.4 ITS2序列的聚类分析第28页
        2.3.5 psbA-trnH序列的聚类分析第28页
        2.3.6 ITS2结合psbA-trnH序列的聚类分析第28-29页
    2.4 小结与讨论第29-31页
第3章 化州柚及其近缘品系的SCOT分子标记研究第31-42页
    3.1 材料与试剂第31页
        3.1.1 实验材料第31页
        3.1.2 仪器和试剂第31页
    3.2 实验方法第31-33页
        3.2.1 总DNA提取与检测第31页
        3.2.2 SCoT-PCR反应体系正交设计第31-32页
        3.2.3 SCoT-PCR反应体系的单因素优化第32页
        3.2.4 PCR扩增及电泳检测第32页
        3.2.5 引物筛选及退火温度优化第32-33页
        3.2.6 数据分析第33页
    3.3 结果与分析第33-40页
        3.3.1 DNA提取结果第33页
        3.3.2 SCoT-PCR正交设计结果第33-35页
        3.3.3 SCoT-PCR反应体系的单因素优化第35-37页
        3.3.4 引物筛选及退火温度优化第37-38页
        3.3.5 SCoT标记的多态性分析第38-39页
        3.3.6 SCoT标记的聚类分析第39-40页
    3.4 小结第40-42页
第4章 化州柚及其近缘品系的SRAP标记研究第42-54页
    4.1 材料与试剂第42页
        4.1.1 材料第42页
        4.1.2 仪器和试剂第42页
    4.2 实验方法第42-43页
        4.2.1 总DNA提取与检测第42页
        4.2.2 SCoT-PCR反应体系正交设计第42页
        4.2.3 PCR扩增及电泳检测第42-43页
        4.2.4 引物筛选及退火温度优化第43页
        4.2.5 SRAP多态引物筛选及退火温度优化第43页
        4.2.6 数据分析第43页
    4.3 结果与分析第43-52页
        4.3.1 DNA提取结果第43页
        4.3.2 SRAP-PCR正交设计结果第43-45页
        4.3.3 SRAP-PCR反应体系的单因素优化第45-47页
        4.3.4 引物筛选第47-48页
        4.3.5 SRAP多态性引物筛选及退火温度优化第48-49页
        4.3.6 SRAP标记的多态性分析第49-50页
        4.3.7 SRAP标记的遗传相似性分析第50-51页
        4.3.8 SRAP标记的聚类分析第51页
        4.3.9 SCoT标记结合SRAP标记的聚类分析第51-52页
        4.3.10 SCoT、SRAP、SCoT+SRAP标记的相关性分析第52页
    4.4 小结与分析第52-54页
第5章 化州柚及其近缘品系的SCAR标记研究第54-60页
    5.1 材料和仪器第54页
        5.1.1 材料第54页
        5.1.2 仪器和试剂第54页
    5.2 实验方法第54-55页
        5.2.1 特异性条带筛选第54页
        5.2.2 特异性条带的回收、克隆及测序第54-55页
        5.2.3 SCAR引物的设计第55页
        5.2.4 SCAR引物的验证第55页
    5.3 结果与分析第55-58页
        5.3.1 特异性条带筛选第55-57页
        5.3.2 特异性条带的回收第57页
        5.3.3 SCAR引物的验证第57-58页
    5.4 小结第58-60页
第6章 总结与讨论第60-65页
    6.1 总结第60-61页
    6.2 讨论第61-63页
        6.2.1 化州柚及其近缘品系的鉴别第61页
        6.2.2 不同品系化州柚的分类和鉴别第61-62页
        6.2.3 四种标记在化州柚及其近缘品系植物中的研究情况第62-63页
        6.2.4 SCAR标记的转化第63页
    6.3 本文的不足之处及展望第63-65页
参考文献第65-69页
附录第69-76页
在校期间发表论文情况第76-77页
致谢第77-79页
附件第79页

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