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小麦开花期穗部miRNAs及其靶基因的鉴定与分析

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
个人简介第10-11页
致谢第11-23页
第一章 文献综述 Literature reviews第23-39页
    一、小RNA的种类 The types of small RNA第23-24页
    二、植物miRNA的发现 The discovery of plant miRNA第24页
    三、植物miRNA的生物合成及其特点 Biogenesis and characteristics第24-27页
        (一) MiRNA初级转录本的形成 Biogenesis of primary transcripts第24-25页
        (二) MiRNA的加工运输 Processing and transportation第25-26页
        (三) MiRNA沉默复合体的形成 The formation of miRNA induced silencing complex第26-27页
    四、植物miRNA的作用机制 Functional mechanism第27-28页
    五、植物miRNA的生物学功能 Biological function第28-32页
        (一) MiRNA参与调控植物的生长发育 Regulating the plant growth and development第28页
        (二) MiRNA参与植物的生物和非生物胁迫响应 Response to biotic and abiotic stress第28-32页
    六、高通量测序在miRNAs及其靶基因研究中的应用 High-throughput sequencing in the research ofmiRNAs and target genes.第32-33页
        (一) MiRNA的研究方法 Methods of miRNAs identification第32页
        (二) 靶基因的研究方法 Methods of miRNAs' target genes identification第32-33页
    七、小麦基因芯片及其数据利用 Utilization of wheat microarray data第33-35页
    八、小麦miRNA的研究进展 Research progress of wheat miRNA第35-39页
第二章 小麦开花期穗部microRNAs及其靶基因的鉴定与分析Identification and analysis of miRNAs and their targets in wheat spikes第39-67页
    引言 Introduction第39-41页
    材料和方法 Materials and methods第41-45页
        一、植物材料 Plant materials第41页
        二、RNA的提取,小RNA文库的构建 RNA extraction, small RNA library construction第41页
        三、小麦miRNAs的鉴定 Identification of wheat miRNAs第41-42页
        四、小麦miRNAs靶基因的鉴定 Identification of wheat miRNAs' target genes第42页
        五、小麦miRNAs靶基因表达分析 Expression analysis of miRNAs' target genes第42-43页
        六、MiRNAs和靶基因的表达 RT-PCR of miRNAs and target genes第43-45页
    结果与分析Results第45-63页
        一、小RNA文库序列特征分析 Analysis of small RNA libraries'sequences第45-48页
        二、MicroRNAs的鉴定Identication of wheat miRNAs第48-55页
            (一) 已知miRNAs的鉴定 Identification of known miRNAs第48-50页
            (二) 新miRNAs的鉴定Identification of novel miRNAs第50-51页
            (三) MiRNAs及其前体序列分析Analysis of miRNAs and their precursor sequences第51-55页
        三、MicroRNAs靶基因的鉴定 Identification of microRNAs' target genes第55-63页
            (一) 利用降解组序列鉴定小麦miRNAs靶基因Identification of microRNAs' target genes using degradome sequences第55-57页
            (二) 靶基因的表达 Expression of miRNAs' target genes第57-60页
            (三) 靶基因的功能分类Functional classification of target genes第60-62页
            (四) MiRNAs及其靶基因的调控网络Regulatory networks of miRNAs and their target genes第62-63页
    讨论 Discussion第63-67页
第三章 小麦穗部响应禾谷镰刀菌侵染的microRNAs的鉴定Identification of MicroRNAs responsed to Fusariumgraminearum infection in wheat spikes第67-79页
    引言Introduction第67-68页
    材料和方法Materials and methods第68-69页
        一、植物材料Plant materials第68页
        二、RNA的提取,小RNA文库的构建RNA extraction, small RNA library construction第68页
        三、MiRNAs表达数据分析 MiRNAs' expression analysis第68页
        四、QRT-PCR表达分析 MiRNAs and target genes' QRT-PCR analysis第68-69页
    结果与分析Results第69-76页
        一、响应禾谷镰刀菌侵染miRNAs的鉴定Identification of MicroRNAs with Fusarium graminearum infection第69-74页
        二 靶基因的鉴定 Identification of miRNAs' targets第74-76页
    讨论 Discussion第76-79页
参考文献Reference第79-93页
全文总结 Summary第93-95页
发表论文Paper piblication第95-97页
附件Appendix第97-151页

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