摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
个人简介 | 第10-11页 |
致谢 | 第11-23页 |
第一章 文献综述 Literature reviews | 第23-39页 |
一、小RNA的种类 The types of small RNA | 第23-24页 |
二、植物miRNA的发现 The discovery of plant miRNA | 第24页 |
三、植物miRNA的生物合成及其特点 Biogenesis and characteristics | 第24-27页 |
(一) MiRNA初级转录本的形成 Biogenesis of primary transcripts | 第24-25页 |
(二) MiRNA的加工运输 Processing and transportation | 第25-26页 |
(三) MiRNA沉默复合体的形成 The formation of miRNA induced silencing complex | 第26-27页 |
四、植物miRNA的作用机制 Functional mechanism | 第27-28页 |
五、植物miRNA的生物学功能 Biological function | 第28-32页 |
(一) MiRNA参与调控植物的生长发育 Regulating the plant growth and development | 第28页 |
(二) MiRNA参与植物的生物和非生物胁迫响应 Response to biotic and abiotic stress | 第28-32页 |
六、高通量测序在miRNAs及其靶基因研究中的应用 High-throughput sequencing in the research ofmiRNAs and target genes. | 第32-33页 |
(一) MiRNA的研究方法 Methods of miRNAs identification | 第32页 |
(二) 靶基因的研究方法 Methods of miRNAs' target genes identification | 第32-33页 |
七、小麦基因芯片及其数据利用 Utilization of wheat microarray data | 第33-35页 |
八、小麦miRNA的研究进展 Research progress of wheat miRNA | 第35-39页 |
第二章 小麦开花期穗部microRNAs及其靶基因的鉴定与分析Identification and analysis of miRNAs and their targets in wheat spikes | 第39-67页 |
引言 Introduction | 第39-41页 |
材料和方法 Materials and methods | 第41-45页 |
一、植物材料 Plant materials | 第41页 |
二、RNA的提取,小RNA文库的构建 RNA extraction, small RNA library construction | 第41页 |
三、小麦miRNAs的鉴定 Identification of wheat miRNAs | 第41-42页 |
四、小麦miRNAs靶基因的鉴定 Identification of wheat miRNAs' target genes | 第42页 |
五、小麦miRNAs靶基因表达分析 Expression analysis of miRNAs' target genes | 第42-43页 |
六、MiRNAs和靶基因的表达 RT-PCR of miRNAs and target genes | 第43-45页 |
结果与分析Results | 第45-63页 |
一、小RNA文库序列特征分析 Analysis of small RNA libraries'sequences | 第45-48页 |
二、MicroRNAs的鉴定Identication of wheat miRNAs | 第48-55页 |
(一) 已知miRNAs的鉴定 Identification of known miRNAs | 第48-50页 |
(二) 新miRNAs的鉴定Identification of novel miRNAs | 第50-51页 |
(三) MiRNAs及其前体序列分析Analysis of miRNAs and their precursor sequences | 第51-55页 |
三、MicroRNAs靶基因的鉴定 Identification of microRNAs' target genes | 第55-63页 |
(一) 利用降解组序列鉴定小麦miRNAs靶基因Identification of microRNAs' target genes using degradome sequences | 第55-57页 |
(二) 靶基因的表达 Expression of miRNAs' target genes | 第57-60页 |
(三) 靶基因的功能分类Functional classification of target genes | 第60-62页 |
(四) MiRNAs及其靶基因的调控网络Regulatory networks of miRNAs and their target genes | 第62-63页 |
讨论 Discussion | 第63-67页 |
第三章 小麦穗部响应禾谷镰刀菌侵染的microRNAs的鉴定Identification of MicroRNAs responsed to Fusariumgraminearum infection in wheat spikes | 第67-79页 |
引言Introduction | 第67-68页 |
材料和方法Materials and methods | 第68-69页 |
一、植物材料Plant materials | 第68页 |
二、RNA的提取,小RNA文库的构建RNA extraction, small RNA library construction | 第68页 |
三、MiRNAs表达数据分析 MiRNAs' expression analysis | 第68页 |
四、QRT-PCR表达分析 MiRNAs and target genes' QRT-PCR analysis | 第68-69页 |
结果与分析Results | 第69-76页 |
一、响应禾谷镰刀菌侵染miRNAs的鉴定Identification of MicroRNAs with Fusarium graminearum infection | 第69-74页 |
二 靶基因的鉴定 Identification of miRNAs' targets | 第74-76页 |
讨论 Discussion | 第76-79页 |
参考文献Reference | 第79-93页 |
全文总结 Summary | 第93-95页 |
发表论文Paper piblication | 第95-97页 |
附件Appendix | 第97-151页 |