面向基因表达数据快速聚类的算法研究
摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 绪论 | 第9-15页 |
1.1 课题研究背景及目的意义 | 第9-12页 |
1.1.1 课题背景 | 第9-11页 |
1.1.2 课题目的和意义 | 第11-12页 |
1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
1.3 主要研究内容 | 第14页 |
1.4 论文组织结构 | 第14-15页 |
第2章 相关背景知识介绍 | 第15-23页 |
2.1 基于网格分组的密度有偏采样 | 第15-16页 |
2.2 主成分分析(PCA) | 第16-17页 |
2.3 K-均值聚类 | 第17-19页 |
2.4 聚类效果评判指标 | 第19-21页 |
2.5 基因表达数据背景知识介绍 | 第21-22页 |
2.5.1 基因表达数据文件格式说明 | 第21页 |
2.5.2 基因集富集分析 | 第21-22页 |
2.6 本章小结 | 第22-23页 |
第3章 基于子空间网格压缩的快速聚类 | 第23-38页 |
3.1 数据预处理 | 第23-24页 |
3.2 网格分组 | 第24-26页 |
3.3 边缘网格识别 | 第26-29页 |
3.4 四叉树索引结构 | 第29-30页 |
3.5 网格内数据压缩 | 第30-35页 |
3.5.1 压缩率的确定 | 第30-33页 |
3.5.2 Lanczos插值 | 第33-35页 |
3.6 K-均值聚类样本子集 | 第35页 |
3.7 后处理 | 第35-36页 |
3.8 基因表达数据聚类精度评估 | 第36-37页 |
3.9 本章小结 | 第37-38页 |
第4章 实验结果和分析 | 第38-51页 |
4.1 模拟数据集实验 | 第38-39页 |
4.2 拟兰芥基因表达数据集实验 | 第39-47页 |
4.2.1 数据清洗及预处理 | 第39-40页 |
4.2.2 实验结果对比 | 第40-47页 |
4.3 小白鼠基因表达数据集实验 | 第47-49页 |
4.4 实验结果分析 | 第49-50页 |
4.5 本章小结 | 第50-51页 |
结论 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-58页 |
致谢 | 第58页 |