| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-23页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第9-14页 |
| 1.2 与本课题有关的国内外研究状况 | 第14-21页 |
| 1.2.1 DNA序列比对算法的发展 | 第18-20页 |
| 1.2.2 RNA序列比对算法的发展 | 第20-21页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第21-22页 |
| 1.4 本文的章节结构 | 第22-23页 |
| 第2章 RNA序列的生物学特征以及研究方法 | 第23-32页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 RNA生物特性分析 | 第23-27页 |
| 2.2.1 基因表达 | 第23-24页 |
| 2.2.2 mRNA的转录 | 第24-26页 |
| 2.2.3 mRNA的修饰 | 第26-27页 |
| 2.3 RNA序列的研究方法 | 第27-31页 |
| 2.3.1 现有的比对软件分析 | 第27-30页 |
| 2.3.2 现有的RNA序列分析软件分析 | 第30-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 RNA序列比对分析算法设计和实现 | 第32-57页 |
| 3.1 前言 | 第32-33页 |
| 3.2 比对分析算法总体架构 | 第33-51页 |
| 3.2.1 长序列切割系统模块的实现 | 第35-37页 |
| 3.2.2 短序列比对子系统的比对实现 | 第37-51页 |
| 3.3 三代RNA序列比对分析系统测试 | 第51-56页 |
| 3.3.1 三代RNA序列测试的数据格式数据格式表如下 | 第51-52页 |
| 3.3.2 操作与使用 | 第52-53页 |
| 3.3.3 测试 | 第53-56页 |
| 3.4 本章小结 | 第56-57页 |
| 第4章 三代RNA序列剪接分析算法 | 第57-69页 |
| 4.1 前言 | 第57-58页 |
| 4.2 三代RNA测序序列剪接分析系统 | 第58-68页 |
| 4.2.1 建立短序列比对记录结构数组 | 第58-59页 |
| 4.2.2 长序列填充和比对算法 | 第59-66页 |
| 4.2.3 三代RNA测序序列的可变剪接分析 | 第66-68页 |
| 4.2.4 得到可变剪接序列 | 第68页 |
| 4.3 本章小结 | 第68-69页 |
| 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 个人简历 | 第76页 |