摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
缩略词表 | 第12-13页 |
第一章 绪论 | 第13-29页 |
1.1 植物细胞壁多糖的结构及合成酶系 | 第13-17页 |
1.1.1 纤维素的结构及合成酶系 | 第14-15页 |
1.1.2 半纤维素的结构及合成酶系 | 第15-16页 |
1.1.3 果胶的结构及合成酶系 | 第16-17页 |
1.2 植物细胞壁多糖的降解酶系 | 第17-20页 |
1.2.1 纤维素降解酶系 | 第17页 |
1.2.2 半纤维素降解酶系 | 第17-19页 |
1.2.3 果胶降解酶系 | 第19-20页 |
1.3 糖苷水解酶活性架构 | 第20-22页 |
1.3.1 活性架构对底物特异性的影响 | 第20-21页 |
1.3.2 活性架构对酶活力的影响 | 第21-22页 |
1.4 糖苷水解酶GH5家族结构及亚家族分类 | 第22-27页 |
1.4.1 GH5家族(β/α)_8结构 | 第23-24页 |
1.4.2 GH5家族催化机制 | 第24-26页 |
1.4.3 GH5家族亚家族分类与底物特异性 | 第26-27页 |
1.5 立题依据 | 第27-29页 |
第二章 GH5主要亚家族结构生物信息学分析 | 第29-43页 |
2.1 材料与方法 | 第29-32页 |
2.1.1 主要软件 | 第29页 |
2.1.2 主要仪器设备 | 第29页 |
2.1.3 GH5主要亚家族分子进化树的构建 | 第29页 |
2.1.4 GH5主要亚家族蛋白序列比对图谱的构建 | 第29-30页 |
2.1.5 GH5主要亚家族的结构比对 | 第30页 |
2.1.6 GH5主要亚家族构象动态分析 | 第30-31页 |
2.1.7 GH5主要亚家族活性中心序列谱的绘制 | 第31-32页 |
2.2 结果与讨论 | 第32-40页 |
2.2.1 GH5主要亚家族分子进化分析 | 第32-33页 |
2.2.2 GH5主要亚家族蛋白序列比对 | 第33-35页 |
2.2.3 GH5主要亚家族结构分析 | 第35-36页 |
2.2.4 GH5主要亚家族构象动态分析 | 第36-39页 |
2.2.5 GH5主要亚家族活性中心序列谱分析 | 第39-40页 |
2.3 本章小结 | 第40-43页 |
第三章 GH5_2与GH5_8底物特异性差异分析 | 第43-69页 |
3.1 材料与方法 | 第43-49页 |
3.1.1 菌株和质粒 | 第43页 |
3.1.2 主要药品和试剂 | 第43-44页 |
3.1.3 主要缓冲液 | 第44-45页 |
3.1.4 培养基 | 第45页 |
3.1.5 主要仪器设备 | 第45页 |
3.1.6 TfCel5A和TfMan5A的异源表达与纯化 | 第45-47页 |
3.1.7 TfCel5A和TfMan5A最适pH与最适温度的测定 | 第47页 |
3.1.8 TfCel5A和TfMan5A酶活与催化动力学常数的测定 | 第47-48页 |
3.1.9 不同多糖降解产物谱测定与分析 | 第48页 |
3.1.10 高侧链取代度半乳甘露寡糖的鉴定 | 第48页 |
3.1.11 GH5_2和GH5_8亚家族酶底物特异性差异分析 | 第48-49页 |
3.2 结果与讨论 | 第49-67页 |
3.2.1 TfCel5A和TfMan5A的异源表达及生化性质测定 | 第49-50页 |
3.2.2 TfCel5A和TfMan5A的酶活和底物特异性测定 | 第50-53页 |
3.2.3 TfMan5A活性架构对高侧链取代度半乳甘露寡糖的不容性 | 第53-59页 |
3.2.4 GH5_2纤维素酶与GH5_8甘露聚糖酶底物特异性差异分析 | 第59-67页 |
3.3 本章小结 | 第67-69页 |
第四章 GH5_2活性架构关键残基功能探究 | 第69-89页 |
4.1 材料与方法 | 第69-73页 |
4.1.1 菌株和质粒 | 第69页 |
4.1.2 主要药品和试剂 | 第69-70页 |
4.1.3 主要缓冲液 | 第70页 |
4.1.4 培养基 | 第70页 |
4.1.5 主要仪器设备 | 第70页 |
4.1.6 TfCel5A活性中心残基的选取与GH5_2活性中心序列谱的绘制 | 第70页 |
4.1.7 TfCel5A活性中心残基的丙氨酸筛选 | 第70-72页 |
4.1.8 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体的底物结合力测定 | 第72页 |
4.1.9 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体的酶活测定 | 第72-73页 |
4.1.10 GH5_2亚家族酶底物结合前后活性架构构象动态比较 | 第73页 |
4.2 结果与讨论 | 第73-86页 |
4.2.1 TfCel5A活性中心残基统计分析 | 第73-74页 |
4.2.2 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体底物结合力测定 | 第74-81页 |
4.2.3 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体酶活测定 | 第81-85页 |
4.2.4 GH5_2亚家族底物结合前后活性架构构象动态比较 | 第85-86页 |
4.2.5 GH5家族酶分子催化循环 | 第86页 |
4.3 本章小结 | 第86-89页 |
全文总结与展望 | 第89-93页 |
参考文献 | 第93-101页 |
致谢 | 第101-103页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第103-104页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第104页 |