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糖苷水解酶GH5主要亚家族活性架构功能探究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表第12-13页
第一章 绪论第13-29页
    1.1 植物细胞壁多糖的结构及合成酶系第13-17页
        1.1.1 纤维素的结构及合成酶系第14-15页
        1.1.2 半纤维素的结构及合成酶系第15-16页
        1.1.3 果胶的结构及合成酶系第16-17页
    1.2 植物细胞壁多糖的降解酶系第17-20页
        1.2.1 纤维素降解酶系第17页
        1.2.2 半纤维素降解酶系第17-19页
        1.2.3 果胶降解酶系第19-20页
    1.3 糖苷水解酶活性架构第20-22页
        1.3.1 活性架构对底物特异性的影响第20-21页
        1.3.2 活性架构对酶活力的影响第21-22页
    1.4 糖苷水解酶GH5家族结构及亚家族分类第22-27页
        1.4.1 GH5家族(β/α)_8结构第23-24页
        1.4.2 GH5家族催化机制第24-26页
        1.4.3 GH5家族亚家族分类与底物特异性第26-27页
    1.5 立题依据第27-29页
第二章 GH5主要亚家族结构生物信息学分析第29-43页
    2.1 材料与方法第29-32页
        2.1.1 主要软件第29页
        2.1.2 主要仪器设备第29页
        2.1.3 GH5主要亚家族分子进化树的构建第29页
        2.1.4 GH5主要亚家族蛋白序列比对图谱的构建第29-30页
        2.1.5 GH5主要亚家族的结构比对第30页
        2.1.6 GH5主要亚家族构象动态分析第30-31页
        2.1.7 GH5主要亚家族活性中心序列谱的绘制第31-32页
    2.2 结果与讨论第32-40页
        2.2.1 GH5主要亚家族分子进化分析第32-33页
        2.2.2 GH5主要亚家族蛋白序列比对第33-35页
        2.2.3 GH5主要亚家族结构分析第35-36页
        2.2.4 GH5主要亚家族构象动态分析第36-39页
        2.2.5 GH5主要亚家族活性中心序列谱分析第39-40页
    2.3 本章小结第40-43页
第三章 GH5_2与GH5_8底物特异性差异分析第43-69页
    3.1 材料与方法第43-49页
        3.1.1 菌株和质粒第43页
        3.1.2 主要药品和试剂第43-44页
        3.1.3 主要缓冲液第44-45页
        3.1.4 培养基第45页
        3.1.5 主要仪器设备第45页
        3.1.6 TfCel5A和TfMan5A的异源表达与纯化第45-47页
        3.1.7 TfCel5A和TfMan5A最适pH与最适温度的测定第47页
        3.1.8 TfCel5A和TfMan5A酶活与催化动力学常数的测定第47-48页
        3.1.9 不同多糖降解产物谱测定与分析第48页
        3.1.10 高侧链取代度半乳甘露寡糖的鉴定第48页
        3.1.11 GH5_2和GH5_8亚家族酶底物特异性差异分析第48-49页
    3.2 结果与讨论第49-67页
        3.2.1 TfCel5A和TfMan5A的异源表达及生化性质测定第49-50页
        3.2.2 TfCel5A和TfMan5A的酶活和底物特异性测定第50-53页
        3.2.3 TfMan5A活性架构对高侧链取代度半乳甘露寡糖的不容性第53-59页
        3.2.4 GH5_2纤维素酶与GH5_8甘露聚糖酶底物特异性差异分析第59-67页
    3.3 本章小结第67-69页
第四章 GH5_2活性架构关键残基功能探究第69-89页
    4.1 材料与方法第69-73页
        4.1.1 菌株和质粒第69页
        4.1.2 主要药品和试剂第69-70页
        4.1.3 主要缓冲液第70页
        4.1.4 培养基第70页
        4.1.5 主要仪器设备第70页
        4.1.6 TfCel5A活性中心残基的选取与GH5_2活性中心序列谱的绘制第70页
        4.1.7 TfCel5A活性中心残基的丙氨酸筛选第70-72页
        4.1.8 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体的底物结合力测定第72页
        4.1.9 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体的酶活测定第72-73页
        4.1.10 GH5_2亚家族酶底物结合前后活性架构构象动态比较第73页
    4.2 结果与讨论第73-86页
        4.2.1 TfCel5A活性中心残基统计分析第73-74页
        4.2.2 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体底物结合力测定第74-81页
        4.2.3 TfCel5A活性中心残基丙氨酸突变体酶活测定第81-85页
        4.2.4 GH5_2亚家族底物结合前后活性架构构象动态比较第85-86页
        4.2.5 GH5家族酶分子催化循环第86页
    4.3 本章小结第86-89页
全文总结与展望第89-93页
参考文献第93-101页
致谢第101-103页
攻读学位期间发表的论文第103-104页
学位论文评阅及答辩情况表第104页

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