中文摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第1章 引言 | 第10-14页 |
1.1 酶的概述 | 第10-13页 |
1.1.1 纤维素简介 | 第10页 |
1.1.2 纤维素酶 | 第10-11页 |
1.1.3 里氏木霉TrCel6A | 第11-13页 |
1.2 研究的目的及内容 | 第13-14页 |
第2章 理论基础与计算方法 | 第14-17页 |
2.1 分子动力学简介 | 第14-15页 |
2.2 主成分分析 | 第15-16页 |
2.3 拉伸分子动力学 | 第16-17页 |
第3章 水解前后TrCel6A与底物的结合模式研究 | 第17-25页 |
3.1 引言 | 第17页 |
3.2 计算方法和计算细节 | 第17-19页 |
3.2.1 初始模型的建立 | 第17-18页 |
3.2.2 常规分子动力学参数设置 | 第18-19页 |
3.3 结果与讨论 | 第19-25页 |
3.3.1 TrCel6A水解底物前的结合模型研究 | 第19-21页 |
3.3.2 TrCel6A水解纤维六糖后的结合模型研究 | 第21-22页 |
3.3.3 酪氨酸Tyr103旋转原因的研究 | 第22-23页 |
3.3.4 本章小结 | 第23-25页 |
第4章 TrCel6A产物排出过程的分子动力学研究 | 第25-39页 |
4.1 引言 | 第25页 |
4.2 计算方法和计算细节 | 第25-28页 |
4.2.1 初始模型的建立和方法 | 第25-26页 |
4.2.2 拉伸分子动力学的参数设置 | 第26-28页 |
4.3 结果和讨论 | 第28-39页 |
4.3.1 沿着方向一的产物排出过程研究 | 第30-33页 |
4.3.2 沿着方向二的产物排出过程研究 | 第33-35页 |
4.3.3 沿着方向三的产物排出过程研究 | 第35-37页 |
4.3.4 本章小结 | 第37-39页 |
参考文献 | 第39-43页 |
个人简介及攻读学位期间发表论文 | 第43-44页 |
致谢 | 第44页 |