| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第1章 前言 | 第14-20页 |
| 1.1 土壤盐渍化现状 | 第14页 |
| 1.2 盐胁迫对植物的影响 | 第14-15页 |
| 1.3 植物的耐盐机制 | 第15-18页 |
| 1.3.1 渗透调节物质的积累 | 第15-16页 |
| 1.3.2 离子选择性吸收和区隔化 | 第16页 |
| 1.3.3 活性氧清除 | 第16-17页 |
| 1.3.4 植物耐盐基因及蛋白 | 第17-18页 |
| 1.4 转录组学研究 | 第18-19页 |
| 1.5 滨麦的研究背景 | 第19页 |
| 1.6 研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第2章 材料与方法 | 第20-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-25页 |
| 2.2.1 RNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 RNA完整性及纯度检测 | 第21页 |
| 2.2.3 cDNA文库构建 | 第21-22页 |
| 2.2.4 滨麦叶片转录组测序 | 第22页 |
| 2.2.5 转录组数据的组装 | 第22页 |
| 2.2.5.1 数据过滤 | 第22页 |
| 2.2.5.2 数据组装 | 第22页 |
| 2.2.6 转录组数据的分析 | 第22-24页 |
| 2.2.6.1 Unigene功能注释 | 第23页 |
| 2.2.6.2 GO分类 | 第23页 |
| 2.2.6.3 KEGG代谢通路分析 | 第23页 |
| 2.2.6.4 Unigene差异表达分析 | 第23-24页 |
| 2.2.7 滨麦LmNHX2基因分析 | 第24-25页 |
| 2.2.7.1 LmNHX2的生物信息学分析 | 第24页 |
| 2.2.7.2 LmNHX2响应盐分胁迫的表达水平分析 | 第24-25页 |
| 第3章 结果与分析 | 第25-42页 |
| 3.1 RNA提取及质量检测 | 第25页 |
| 3.2 转录组测序与组装 | 第25-26页 |
| 3.3 组装结果分析 | 第26-28页 |
| 3.3.1 组装质量统计 | 第26页 |
| 3.3.2 Contig的长度分布统计 | 第26-27页 |
| 3.3.3 Unigene的长度分布统计 | 第27-28页 |
| 3.4 转录组序列的功能注释 | 第28-32页 |
| 3.4.1 COG分类 | 第28-29页 |
| 3.4.2 GO分类 | 第29-31页 |
| 3.4.3 KEGG代谢通路分析 | 第31-32页 |
| 3.5 Unigene差异表达分析 | 第32-37页 |
| 3.5.1 差异Unigene的GO功能分析 | 第33-35页 |
| 3.5.2 差异Unigene的Pathway富集分析 | 第35-37页 |
| 3.6 耐盐基因的挖掘 | 第37-38页 |
| 3.7 滨麦LmNHX2基因分析 | 第38-42页 |
| 3.7.1 LmNHX2cDNA序列分析 | 第38页 |
| 3.7.2 LmNHX2蛋白的序列特征分析 | 第38-39页 |
| 3.7.3 LmNHX2蛋白的系统进化分析 | 第39-41页 |
| 3.7.4 盐胁迫下LmNHX2的表达分析 | 第41-42页 |
| 第4章 讨论与结论 | 第42-46页 |
| 4.1 测序结果的评价 | 第42页 |
| 4.1.1 转录组测序 | 第42页 |
| 4.1.2 组装和注释 | 第42页 |
| 4.2 差异表达Unigene分析 | 第42-44页 |
| 4.2.1 差异表达Unigene筛选结果 | 第43页 |
| 4.2.2 差异表达Unigene的GO富集结果 | 第43页 |
| 4.2.3 差异表达Unigene的KEGG富集结果 | 第43页 |
| 4.2.4 耐盐基因分析结果 | 第43-44页 |
| 4.3 滨麦LmNHX2基因分析 | 第44-45页 |
| 4.4 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 作者简历 | 第53页 |
