缩略语表 | 第5-6页 |
中文摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
前言 | 第11-12页 |
文献回顾 | 第12-33页 |
第一部分 乙肝个体化治疗分析系统(HBVDRUGGUIDE)的设计 | 第33-44页 |
1 HBV drug guide 开发背景 | 第33-35页 |
2 HBV drug guide 开发理论 | 第35-37页 |
2.1 分子生物学和生物信息学提供理论 | 第35-37页 |
2.2 软件结构化程序与面向对象 | 第37页 |
3 HBV Drug Guide 相关技术研究 | 第37-44页 |
3.1 中国人群特异性高保真标准参考序列的设计 | 第38-39页 |
3.2 混合 Blast 算法和 Clustal 算法的序列对齐算法 | 第39-42页 |
3.3 基因区域分类与基因突变位点的自适应定位方法 | 第42页 |
3.4 QV 体系单碱基突变概率预测模型 | 第42-44页 |
第二部分 乙肝个体化治疗分析系统(HBVDRUGGUIDE)的开发 | 第44-81页 |
1 系统设计 | 第44-46页 |
1.1 系统目标 | 第44页 |
1.2 系统总体设计 | 第44-46页 |
2 系统开发 | 第46-77页 |
2.1 主程序模块开发 | 第46-61页 |
2.2 数据输入模块开发 | 第61-63页 |
2.3 QV 值计算模块开发 | 第63-66页 |
2.4 耐药点检测模块开发 | 第66-74页 |
2.5 QV 值分析模块开发 | 第74-77页 |
3 系统应用 | 第77-81页 |
3.1 系统环境配置 | 第77页 |
3.2 测序峰图查看 | 第77-78页 |
3.3 序列耐药性突变分析 | 第78-79页 |
3.4 测序结果分析 | 第79-81页 |
第三部分 基于 HBVDRUGGUIDE 软件测试临床乙型肝炎患者 | 第81-102页 |
1 材料 | 第82-83页 |
1.1 样本收集 | 第82页 |
1.2 所用的主要软件 | 第82页 |
1.3 所用的主要仪器 | 第82页 |
1.4 所用的主要试剂 | 第82-83页 |
1.5 溶液配方及配法 | 第83页 |
2 方法 | 第83-87页 |
2.1 引物设计 | 第83-84页 |
2.2 HBV 基因组 DNA 提取 | 第84-85页 |
2.3 DNA 标本浓度和质量测定 | 第85页 |
2.4 PCR 基因扩增 | 第85-86页 |
2.5 电泳 | 第86-87页 |
2.6 测序结果分析 | 第87页 |
2.7 统计分析 | 第87页 |
3 结果 | 第87-100页 |
3.1 HBV P 基因和 BCP-PreC/C 基因区扩增引物设计结果 | 第87-88页 |
3.2 HBV P 基因和 BCP-PreC/C 基因区扩增结果 | 第88-89页 |
3.3 HBV 基因分型结果 | 第89-92页 |
3.4 HBV drug guide 软件测试 | 第92-98页 |
3.5 HBV P 基因和 BCP-PreC/C 基因区突变检测统计分析 | 第98-100页 |
4 讨论 | 第100-101页 |
5 结论 | 第101-102页 |
小结 | 第102-104页 |
参考文献 | 第104-110页 |
个人简历和研究成果 | 第110-111页 |
致谢 | 第111-112页 |