| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-23页 |
| 1.1 转录组学 | 第11-12页 |
| 1.1.1 转录组 | 第11页 |
| 1.1.2 转录组学 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组研究技术 | 第12-13页 |
| 1.3 转录组研究现状 | 第13-14页 |
| 1.4 转录组分析 | 第14-15页 |
| 1.5 水蛭研究概况 | 第15-18页 |
| 1.5.1 蛭纲研究概述 | 第15-17页 |
| 1.5.2 菲牛蛭及其研究进展 | 第17-18页 |
| 1.6 抗凝血相关因子研究进展 | 第18-21页 |
| 1.7 研究内容及研究意义 | 第21-23页 |
| 1.7.1 研究内容 | 第21页 |
| 1.7.2 研究意义 | 第21-23页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第23-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验动物采集、物种鉴定及处理 | 第23页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.3 相关试剂配制 | 第24页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-29页 |
| 2.2.1 实验准备及注意事项 | 第25-26页 |
| 2.2.2 样本总RNA提取 | 第26-27页 |
| 2.2.3 总RNA样品质量检测 | 第27-28页 |
| 2.2.4 转录组文库的构建及测序 | 第28-29页 |
| 2.3 分析流程 | 第29-36页 |
| 2.3.1 原始数据的存储 | 第29-30页 |
| 2.3.2 Clean reads的获取 | 第30-31页 |
| 2.3.3 菲牛蛭Unigene的拼接组装 | 第31页 |
| 2.3.4 菲牛蛭Unigene的功能注释 | 第31-32页 |
| 2.3.5 编码区序列(CDS)预测 | 第32-33页 |
| 2.3.6 吸血前后菲牛蛭的差异表达分析 | 第33页 |
| 2.3.7 qRT-PCR验证 | 第33-36页 |
| 第3章 结果与讨论 | 第36-63页 |
| 3.1 总RNA质量检测结果 | 第36-38页 |
| 3.1.1 菲牛蛭总RNA的凝胶电泳检测结果 | 第36页 |
| 3.1.2 菲牛蛭总RNA的Nanodrop核酸定量仪检测结果 | 第36-37页 |
| 3.1.3 菲牛虫至总RNA的Agilent 2100 Bioanazlyer检测结果 | 第37-38页 |
| 3.2 测序数据的质量评估以及产出情况 | 第38-39页 |
| 3.2.1 测序碱基质量值 | 第38页 |
| 3.2.2 测序碱基含量分布检查 | 第38-39页 |
| 3.2.3 测序数据产出情况汇总 | 第39页 |
| 3.3 菲牛蛭转录组组装结果 | 第39-41页 |
| 3.4 菲牛蛭Unigene的功能注释结果 | 第41-44页 |
| 3.4.1 NR数据库注释 | 第41-42页 |
| 3.4.2 COG功能分类 | 第42-43页 |
| 3.4.3 GO功能分类 | 第43-44页 |
| 3.4.4 KEGG通路富集分析 | 第44页 |
| 3.5 菲牛蛭Unigene的CDS预测 | 第44-45页 |
| 3.6 吸血前后菲牛蛭的差异表达基因分析 | 第45-51页 |
| 3.6.1 差异基因筛选 | 第45-46页 |
| 3.6.2 DEGs的GO功能分析 | 第46-47页 |
| 3.6.3 DEGs的KEGG pathway功能分析 | 第47-51页 |
| 3.7 菲牛蛭吸血特性相关的功能基因挖掘 | 第51-60页 |
| 3.7.1 抗凝血相关基因 | 第51-56页 |
| 3.7.2 涉及免疫反应的基因 | 第56-57页 |
| 3.7.3 涉及氧化应激反应的基因 | 第57-60页 |
| 3.8 qRT验证 | 第60-63页 |
| 第4章 结论 | 第63-67页 |
| 参考文献 | 第67-79页 |
| 附表 | 第79-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第93页 |
