摘要 | 第4-7页 |
Abstract | 第7-10页 |
英文缩略词表 | 第17-18页 |
1 引言 | 第18-21页 |
2 材料与方法 | 第21-35页 |
2.1 实验材料 | 第21-29页 |
2.1.1 菌株来源 | 第21页 |
2.1.2 生物信息分析软件及网络数据库 | 第21页 |
2.1.3 实验器材 | 第21-22页 |
2.1.4 实验试剂 | 第22-24页 |
2.1.5 主要试剂配方 | 第24-25页 |
2.1.6 引物序列的合成 | 第25-29页 |
2.2 实验方法 | 第29-34页 |
2.2.1 细菌的复苏、鉴定与培养 | 第29页 |
2.2.2 分光光度法对细菌浓度的测定 | 第29-30页 |
2.2.3 细菌浊度测定 | 第30页 |
2.2.4 细菌耐药表型的测定 | 第30页 |
2.2.5 产超广谱β-内酰胺酶的检测 | 第30-31页 |
2.2.6 核酸的提取及浓度和纯度检测 | 第31页 |
2.2.7 质粒DNA的纯化 | 第31页 |
2.2.8 PCR扩增与凝胶电泳 | 第31-32页 |
2.2.9 耐药质粒电转化入感受态细胞 | 第32页 |
2.2.10 肉汤稀释法测定转化子对抗生素最低抑菌浓度(MIC) | 第32页 |
2.2.11 头孢菌素诱导转化子中CTX-M-55基因的表达 | 第32页 |
2.2.12 测序结果的比对 | 第32-33页 |
2.2.13 GenBank 据库中CTX-M-15阳性大肠杆菌全基因组序列的获得及耐药信息和质粒分型 | 第33页 |
2.2.14 质粒测序 | 第33页 |
2.2.15 RNA逆转录成cDNA | 第33页 |
2.2.16 RT-PCR | 第33页 |
2.2.17 统计分析 | 第33-34页 |
2.3 技术路线图 | 第34-35页 |
3 结果 | 第35-57页 |
3.1 临床细菌分离、鉴定及分型 | 第35-36页 |
3.1.1 大肠杆菌鉴定及ESBLs阳性菌株筛选 | 第35页 |
3.1.2 大肠杆菌ESBLs阳性菌株种系分类 | 第35-36页 |
3.2 临床分离大肠杆菌的耐药分布情况 | 第36-42页 |
3.2.1 大肠杆菌耐药表型结果 | 第36-37页 |
3.2.2 ESBLs阳性大肠杆菌与阴性大肠杆菌耐药情况比较 | 第37-38页 |
3.2.3 耐药基因的检测 | 第38页 |
3.2.4 ESBLs阳性菌株耐药基因分布情况 | 第38-39页 |
3.2.5 ESBLs阳性株CTX-M基因亚型分布及菌株种系分类 | 第39-42页 |
3.3 CTX-M阳性菌株中I型整合子的检测 | 第42页 |
3.4 GenBank中大肠杆菌中CTX-M-15基因所在的质粒特征 | 第42-47页 |
3.4.1 CTX-M-15阳性大肠杆菌的MLST分型 | 第42-43页 |
3.4.2 232株大肠杆菌MLST型别聚类结果 | 第43-44页 |
3.4.3 大肠杆菌中耐药基因的分布 | 第44页 |
3.4.4 耐药基因在非ST131和ST131菌株中的分布 | 第44-45页 |
3.4.5 大肠杆菌中质粒的检测 | 第45页 |
3.4.6 菌株MLST型别与质粒pMLST之间的关系 | 第45-47页 |
3.5 临床分离株中CTX-M-55基因所在质粒及其分型 | 第47-51页 |
3.5.1 CTX-M-55质粒的提取及电转化结果 | 第47页 |
3.5.2 转化子药敏结果 | 第47-48页 |
3.5.3 CTX-M-55基因所在质粒分型结果 | 第48-50页 |
3.5.4 CTX-M-55阳性菌株MLST型别及其中含有的质粒类型 | 第50-51页 |
3.5.5 CTX-M-55阳性菌株中其他β-内酰胺类基因的分布情况 | 第51页 |
3.6 CTX-M-55基因所在质粒全基因组测序 | 第51-54页 |
3.6.1 质粒DNA的质检结果 | 第51页 |
3.6.2 质粒DNA的大小及所含的基因情况 | 第51-52页 |
3.6.3 质粒全序列BLAST结果 | 第52-54页 |
3.7 头孢类抗生素对CTX-M-55基因的作用 | 第54-57页 |
3.7.1 转化子MIC的测定 | 第54-55页 |
3.7.2 RNA完整性检测 | 第55页 |
3.7.3 逆转录结果 | 第55页 |
3.7.4 转化子中CTX-M-55基因表达情况 | 第55-57页 |
4 讨论 | 第57-63页 |
4.1 大肠杆菌中CTX-M型ESBLs流行特征及耐药表型分析 | 第57-58页 |
4.2 CTX-M大肠杆菌的遗传特征 | 第58-59页 |
4.3 大肠杆菌中整合子的分布 | 第59-60页 |
4.4 质粒特性分析 | 第60-61页 |
4.5 头孢菌素对CTX-M-55基因作用 | 第61-62页 |
4.6 创新性与局限性 | 第62-63页 |
5 结论 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-67页 |
综述 肠杆菌科中产CTX-M型超广谱β-内酰胺酶的研究概况 | 第67-81页 |
参考文献 | 第76-81页 |
附录 | 第81-85页 |
个人简历 | 第85-86页 |
致谢 | 第86页 |