| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 原核生物分类系统简介 | 第10-11页 |
| 1.2 系统发育基因组学简介 | 第11-12页 |
| 1.3 系统发育分析方法 | 第12-13页 |
| 1.4 高等级分类单元特征序列 | 第13-14页 |
| 1.5 本课题研究内容和意义 | 第14-16页 |
| 第2章 可用于系统发育分析的核心基因的筛选 | 第16-22页 |
| 2.1 研究方法 | 第16-17页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第17页 |
| 2.3 小结 | 第17-22页 |
| 第3章 放线菌门高等级分类阶元关系评价 | 第22-30页 |
| 3.1 研究方法 | 第22-23页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第23-29页 |
| 3.3 小结 | 第29-30页 |
| 第4章 变形杆菌门高等级分类阶元关系评价 | 第30-41页 |
| 4.1 研究方法 | 第30-31页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第31-39页 |
| 4.2.1 Alpha-变形杆菌纲系统发育分析 | 第31-36页 |
| 4.2.2 Beta，Gamma-变形杆菌纲系统发育分析 | 第36-38页 |
| 4.2.3 Delta，Epsilon-变形杆菌纲系统发育分析 | 第38-39页 |
| 4.3 小结 | 第39-41页 |
| 第5章 厚壁菌门高等级分类阶元关系评价 | 第41-48页 |
| 5.1 研究方法 | 第41-42页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第42-47页 |
| 5.3 小结 | 第47-48页 |
| 第6章 细菌域高等级分类单元特征序列鉴别 | 第48-58页 |
| 6.1 研究方法 | 第48页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第48-56页 |
| 6.3 小结 | 第56-58页 |
| 第7章 细菌域系统发育组学研究 | 第58-63页 |
| 7.1 研究方法 | 第58页 |
| 7.2 结果与讨论 | 第58-63页 |
| 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-72页 |
| 附录 | 第72-82页 |
| 附录 1 本研究所用菌株及基因组序列注册号 | 第72-81页 |
| 附录 2 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果 | 第83页 |