| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-19页 |
| 1.1 鸡肠炎沙门氏菌 | 第12-14页 |
| 1.1.1 肠炎沙门氏菌概述 | 第12页 |
| 1.1.2 肠炎沙门氏菌的致病机制 | 第12-13页 |
| 1.1.3 肠炎沙门氏菌毒力基因 | 第13-14页 |
| 1.1.4 肠炎沙门氏菌感染对肠道菌群的影响 | 第14页 |
| 1.2 家禽对肠炎沙门氏菌感染的遗传调控 | 第14-18页 |
| 1.2.1 抗病基因 | 第14-17页 |
| 1.2.2 肠道菌群与宿主免疫 | 第17页 |
| 1.2.3 宿主能量与免疫的平衡研究 | 第17-18页 |
| 1.3 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-32页 |
| 2.1 试验试剂与主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.1 试验试剂 | 第19页 |
| 2.1.2 常用试剂的配制 | 第19-20页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-29页 |
| 2.2.1 试验动物及样品采集 | 第20-21页 |
| 2.2.2 盲肠内容物中细菌含量测定 | 第21-22页 |
| 2.2.3 血清中细胞因子含量检测 | 第22页 |
| 2.2.4 空肠和肝脏的组织切片 | 第22-23页 |
| 2.2.5 肝脏线粒体的分离及活性检测 | 第23-24页 |
| 2.2.6 盲肠内容物中细菌基因组DNA的提取及检测 | 第24-25页 |
| 2.2.7 盲肠组织样品RNA的提取及反转录 | 第25-27页 |
| 2.2.8 荧光定量PCR | 第27-28页 |
| 2.2.9 标准曲线的绘制 | 第28-29页 |
| 2.3 数据处理 | 第29-32页 |
| 2.3.1 免疫器官指数 | 第29-30页 |
| 2.3.2 盲肠内容物细菌的 16Sr DNA测序结果分析 | 第30-31页 |
| 2.3.3 荧光定量结果分析 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-51页 |
| 3.1 肠炎沙门氏菌感染对鸡免疫指标的影响 | 第32-36页 |
| 3.1.1 肠炎沙门氏感染对鸡体重的影响 | 第32页 |
| 3.1.2 肠炎沙门氏菌感染对鸡胸腺器官指数的影响 | 第32-33页 |
| 3.1.3 肠炎沙门氏菌感染对鸡脾脏器官指数的影响 | 第33-34页 |
| 3.1.4 肠炎沙门氏菌感染对鸡法氏囊器官指数的影响 | 第34页 |
| 3.1.5 肠炎沙门氏菌感染对血液常规指标的影响 | 第34-36页 |
| 3.2 血清中IL-18、IL-1β和IFN-γ水平变化 | 第36-37页 |
| 3.2.1 感染肠炎沙门氏菌后血清中细胞因子水平 | 第36-37页 |
| 3.3 空肠组织形态结构变化 | 第37-39页 |
| 3.3.1 肠炎沙门氏菌感染后空肠绒毛长度变化 | 第37-38页 |
| 3.3.2 肠炎沙门氏菌感染后空肠隐窝深度变化 | 第38页 |
| 3.3.3 肠炎沙门氏菌感染后空肠绒毛长度/隐窝深度比值变化 | 第38-39页 |
| 3.4 肝脏组织切片 | 第39页 |
| 3.5 肝脏组织线粒体含量变化 | 第39-40页 |
| 3.6 肠道菌群动态变化 | 第40-46页 |
| 3.6.1 盲肠内容物中肠炎沙门氏菌含量的变化 | 第40页 |
| 3.6.2 盲肠内容物DNA提取结果 | 第40-41页 |
| 3.6.3 盲肠微生物群落结构比较 | 第41页 |
| 3.6.4 盲肠微生物群落在门和属分类水平的丰度比较 | 第41-43页 |
| 3.6.5 Alpha-多样性比较 | 第43-44页 |
| 3.6.6 Beta-多样性比较 | 第44-45页 |
| 3.6.7 组间差异显著性分析 | 第45-46页 |
| 3.7 宿主免疫相关基因的表达 | 第46-51页 |
| 3.7.0 盲肠组织总RNA提取结果 | 第46-47页 |
| 3.7.1 细胞因子mRNA表达 | 第47页 |
| 3.7.2 盲肠组织中TLR2、TLR4基因的表达 | 第47-49页 |
| 3.7.3 盲肠组织中NOD1、NALP3基因的表达 | 第49-51页 |
| 4 讨论 | 第51-56页 |
| 4.1 肠炎沙门氏菌感染对济宁百日鸡免疫指标的影响 | 第51-52页 |
| 4.2 肠炎沙门氏菌对空肠形态结构的影响 | 第52页 |
| 4.3 肠炎沙门氏菌感染与机体能量平衡 | 第52-53页 |
| 4.4 肠炎沙门氏菌感染对肠道菌群的影响 | 第53-54页 |
| 4.5 肠炎沙门氏菌感染的基因表达调控 | 第54-56页 |
| 4.5.1 细胞因子的表达调控 | 第54页 |
| 4.5.2 TLRs与NLRs的表达调控 | 第54-56页 |
| 5 结论与展望 | 第56-57页 |
| 5.1 结论 | 第56页 |
| 5.2 创新与展望 | 第56-57页 |
| 5.2.1 课题创新 | 第56页 |
| 5.2.2 研究展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
