| 中文摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-16页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 研究背景 | 第13-15页 |
| 1.2.1 同义密码子使用偏性 | 第13页 |
| 1.2.2 mRNA二级结构 | 第13-14页 |
| 1.2.3 蛋白质折叠速率 | 第14-15页 |
| 1.3 论文结构 | 第15-16页 |
| 第二章 研究方法 | 第16-22页 |
| 2.1 mRNA二级结构 | 第16-18页 |
| 2.1.1 RNA二级结构的预测算法 | 第17页 |
| 2.1.2 动态规划算法 | 第17页 |
| 2.1.3 RNA二级结构的图示 | 第17-18页 |
| 2.2 mRNA二级结构的特征量 | 第18-20页 |
| 2.2.1 茎结构与环结构 | 第18-19页 |
| 2.2.2 mRNA单位平均折叠自由能 | 第19页 |
| 2.2.3 mRNA柔性SF | 第19-20页 |
| 2.3 蛋白质序列的获得 | 第20页 |
| 2.4 蛋白质折叠速率的获得 | 第20-21页 |
| 2.4.1 理论值的计算 | 第20-21页 |
| 2.4.2 实验值的获取 | 第21页 |
| 2.5 同义密码子使用偏性 | 第21-22页 |
| 第三章 冠状病毒同义密码子使用偏性对mRNA二级结构的影响 | 第22-33页 |
| 3.1 材料 | 第22-24页 |
| 3.2 统计分析 | 第24页 |
| 3.3 结果 | 第24-31页 |
| 3.3.1 冠状病毒同义密码子使用偏性对mRNA茎结构和环结构的影响 | 第24-27页 |
| 3.3.2 冠状病毒同义密码子使用偏性对mRNA单位平均折叠自由能的影响 | 第27-28页 |
| 3.3.3 冠状病毒同义密码子使用偏性对mRNA柔性的影响 | 第28-29页 |
| 3.3.4 mRNA二级结构随同义密码子使用度变化的关系图 | 第29-31页 |
| 3.4 讨论 | 第31-33页 |
| 第四章 大肠杆菌的同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响 | 第33-40页 |
| 4.1 材料 | 第33-35页 |
| 4.2 统计分析 | 第35-36页 |
| 4.3 结果 | 第36-38页 |
| 4.4 讨论 | 第38-40页 |
| 第五章 总结与展望 | 第40-42页 |
| 5.1 工作总结 | 第40-41页 |
| 5.2 工作展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 攻读硕士期间科研情况 | 第48页 |
