| 致谢 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| 第1章 绪论 | 第13-20页 |
| 1 长牡蛎及其适应性 | 第13-15页 |
| 1.1 牡蛎与长牡蛎 | 第13-14页 |
| 1.2 长牡蛎的分布与抗逆性 | 第14-15页 |
| 2 牡蛎温度适应的研究现状 | 第15-19页 |
| 2.1 牡蛎的温度适应研究 | 第15-17页 |
| 2.2 长牡蛎基因组与其耐受性 | 第17-19页 |
| 3 本研究的目的意义 | 第19-20页 |
| 第2章 长牡蛎温度应激下的转录组表达谱分析 | 第20-38页 |
| 1 引言 | 第20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-23页 |
| 2.1 温度应激转录组表达谱的分析 | 第20-22页 |
| 2.2 不同物种间应激相关基因的分析 | 第22-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-36页 |
| 3.1 温度应激表达谱分析 | 第23-30页 |
| 3.2 不同物种间应激相关基因的分析比较 | 第30-36页 |
| 4 小结 | 第36-38页 |
| 第3章 长牡蛎温度应激相关基因的表达验证 | 第38-66页 |
| 1 引言 | 第38页 |
| 2 材料与方法 | 第38-41页 |
| 2.1 牡蛎材料 | 第38页 |
| 2.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 3 结果与讨论 | 第41-65页 |
| 3.1 内参基因的筛选 | 第41-43页 |
| 3.2 温度应激相关基因的表达分析 | 第43-65页 |
| 4 小结 | 第65-66页 |
| 第4章 长牡蛎热激因子HSF1的ChIP-seq研究 | 第66-84页 |
| 1 引言 | 第66-68页 |
| 2 材料与方法 | 第68-73页 |
| 2.1 HSF1蛋白抗体的蛋白印记法检测 | 第68-70页 |
| 2.2 HSF1的ChIP实验 | 第70-72页 |
| 2.3 HSF1的ChIP-seq测序与分析 | 第72-73页 |
| 3 HSF1的ChIP-seq结果与讨论 | 第73-83页 |
| 3.1 ChIP-seq测序原始数据的整理 | 第73-78页 |
| 3.2 ChIP-seq测序数据的生物信息学分析 | 第78-83页 |
| 4 小结 | 第83-84页 |
| 第5章 长牡蛎热激蛋白70家族的基因克隆 | 第84-100页 |
| 1 引言 | 第84页 |
| 2 材料与设备 | 第84-86页 |
| 2.1 牡蛎材料 | 第84页 |
| 2.2 主要化学试剂及试剂配制 | 第84-85页 |
| 2.3 仪器设备 | 第85-86页 |
| 3 长牡蛎总RNA的提取以及cDNA第一链的合成 | 第86-87页 |
| 3.1 实验用具预处理 | 第86页 |
| 3.2 总RNA提取及cDNA第一链的合成 | 第86-87页 |
| 4 HSP70家族基因的克隆与序列分析 | 第87-95页 |
| 4.1 基因片段的克隆 | 第87-90页 |
| 4.2 基因 3’端序列的RACE克隆 | 第90-91页 |
| 4.3 基因 5’端序列的RACE克隆 | 第91-94页 |
| 4.4 基因序列的分析 | 第94-95页 |
| 5 结果与讨论 | 第95-100页 |
| 5.1 长牡蛎HSP70家族基因序列分析 | 第95-99页 |
| 5.2 讨论 | 第99-100页 |
| 参考文献 | 第100-108页 |
| 附录 ChIP-seq结果中找到对应长牡蛎基因ID的785个peak信息 | 第108-119页 |
| 作者简介 | 第119-120页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第120页 |