癌症精准用药知识搜索系统
| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词表(Abbreviations) | 第8-11页 |
| 1 绪论 | 第11-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-17页 |
| 1.1.1 癌症治疗 | 第11-14页 |
| 1.1.2 靶向治疗 | 第14-15页 |
| 1.1.3 精准医疗与转录组 | 第15-17页 |
| 1.2 研究内容 | 第17-20页 |
| 2 病例组学特征数据库 | 第20-29页 |
| 2.1 数据来源 | 第20-24页 |
| 2.2 数据库结构 | 第24-26页 |
| 2.3 数据库构建 | 第26-27页 |
| 2.4 结果小结 | 第27-29页 |
| 3 精准用药知识库 | 第29-43页 |
| 3.1 数据来源 | 第29-33页 |
| 3.1.1 My Cancer Genome资源 | 第29-30页 |
| 3.1.2 GDSC精准用药预测资源 | 第30-32页 |
| 3.1.3 FDA伴随诊断指南 | 第32页 |
| 3.1.4 NCCN临床实践指南 | 第32-33页 |
| 3.2 数据库结构 | 第33-40页 |
| 3.3 数据库构建 | 第40页 |
| 3.4 结果小结 | 第40-43页 |
| 4 生物医学基础参考数据库 | 第43-47页 |
| 4.1 数据库设计 | 第43-44页 |
| 4.2 数据库内容 | 第44-47页 |
| 5 搜索算法 | 第47-78页 |
| 5.1 搜索算法总体框架 | 第47-50页 |
| 5.2 数据库映射 | 第50-53页 |
| 5.3 数据库信息读取 | 第53-62页 |
| 5.4 搜索工具包 | 第62页 |
| 5.5 生物医学基础参考信息 | 第62-66页 |
| 5.6 参考信息搜索规则 | 第66-71页 |
| 5.6.1 癌症驱动基因突变搜索 | 第66-67页 |
| 5.6.2 拷贝数变异RACS搜索 | 第67-68页 |
| 5.6.3 高甲基化搜索 | 第68-69页 |
| 5.6.4 信号通路活动搜索 | 第69-71页 |
| 5.7 搜索用药指南 | 第71-74页 |
| 5.8 精准用药搜索规则 | 第74-77页 |
| 5.9 搜索结果报告 | 第77-78页 |
| 6 应用实例 | 第78-91页 |
| 6.1 组学特征提取 | 第80-84页 |
| 6.1.1 质量控制 | 第80-82页 |
| 6.1.2 特征提取 | 第82-84页 |
| 6.2 参考信息特征 | 第84-85页 |
| 6.3 用药指南推荐 | 第85-89页 |
| 6.4 结果小结 | 第89-91页 |
| 7 总结与展望 | 第91-94页 |
| 7.1 总结 | 第91-92页 |
| 7.2 展望 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-98页 |
| 作者简历 | 第98页 |
