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哈茨木霉Th-33 GαⅢ基因thga3的功能研究

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-24页
    1.1 异源三聚体G蛋白信号传递系统第14-15页
    1.2 异源三聚体G蛋白α亚基第15-18页
    1.3 木霉菌的生防特性第18-19页
        1.3.1 诱导植物产生抗性第18页
        1.3.2 竞争作用第18-19页
        1.3.3 重寄生作用第19页
        1.3.4 抗生作用第19页
    1.4 木霉菌分生孢子的产生及影响产孢的因素第19-21页
        1.4.1 影响产孢的环境因素第19-20页
        1.4.2 木霉菌产孢相关基因第20-21页
    1.5 木霉菌基因功能研究技术进展第21-23页
        1.5.1 木霉菌遗传转化技术第21-22页
        1.5.2 生物信息学技术第22-23页
    1.6 本研究的目的意义及技术路线第23-24页
        1.6.1 本研究的目的意义第23页
        1.6.2 本研究的技术路线第23-24页
第二章 哈茨木霉菌TH-33 THGA3基因的克隆分析第24-34页
    2.1 材料和方法第24-29页
        2.1.1 供试菌株和试剂第24页
        2.1.2 引物第24页
        2.1.3 哈茨木霉Th-33 基因组DNA的提取第24-25页
        2.1.4 thga3基因片段的克隆第25页
        2.1.5 thga3基因cDNA序列克隆第25页
        2.1.6 thga3基因的拷贝数的验证第25-29页
        2.1.7 thga3基因生物信息学分析第29页
    2.2 结果与分析第29-32页
        2.2.1 thga3基因片段的克隆第29页
        2.2.2 thga3基因拷贝数的验证第29-30页
        2.2.3 thga3基因ORF分析和Blast比对第30页
        2.2.4 Thga3氨基酸理化性质的分析第30-31页
        2.2.5 Thga3系统进化分析第31-32页
    2.3 讨论第32-34页
第三章 哈茨木霉菌THGA3基因的敲除第34-44页
    3.1 材料第34-35页
        3.1.1 供试菌株和质体第34页
        3.1.2 主要试剂第34页
        3.1.3 培养基第34页
        3.1.4 引物第34-35页
    3.2 方法第35-38页
        3.2.1 敲除载体pkh-koΔthga3的构建(含构建策略)第35-37页
        3.2.2 pkh-koΔthga3原生质体转化哈茨木霉菌Th-33第37页
        3.2.3 thga3基因敲除突变株转化子的筛选和分子验证第37-38页
    3.3 结果与分析第38-42页
        3.3.1 pkh-koΔthga3构建与验证第38-39页
        3.3.2 thga3基因敲除突变株的获得第39-40页
        3.3.3 thga3基因敲除突变株的筛选和验证第40-42页
    3.4 讨论第42-44页
第四章 哈茨木霉THGA3基因的回复第44-57页
    4.1 材料第44-45页
        4.1.1 供试菌株和质粒第44页
        4.1.2 主要试剂第44页
        4.1.3 培养基第44页
        4.1.4 引物第44-45页
    4.2 方法第45-49页
        4.2.1 pkh-ko-G418载体改造第45-46页
        4.2.2 thga3基因回复载体pkh-ko-G418-thga3的构建第46-48页
        4.2.3 pkh-ko-G418-thga3原生质体转化敲除突变株△thga3第48-49页
        4.2.4 thga3基因回复突变株转化子的筛选和分子验证第49页
    4.3 结果与分析第49-56页
        4.3.1 pkh-ko-G418载体构建和验证第49-51页
        4.3.2 thga3基因回复载体pkh-ko-G418-thga3的构建和验证第51-54页
        4.3.3 thga3回复突变株转化子的筛选和分子验证第54-56页
    4.4 讨论第56-57页
第五章 突变株基础生物学性状分析第57-73页
    5.1 材料第57页
        5.1.1 供试菌株第57页
        5.1.2 所用仪器和试剂第57页
    5.2 方法第57-60页
        5.2.1 生长和产孢第57页
        5.2.2 拮抗活性第57-58页
        5.2.3 对立枯丝核菌重寄生能力的测定第58页
        5.2.4 几丁质酶活测定方法第58页
        5.2.5 疏水性测定第58-59页
        5.2.6 qRT-PCR鉴定相关疏水蛋白基因的表达第59页
        5.2.7 统计分析第59-60页
    5.3 结果第60-72页
        5.3.1 形态,生长和产孢比较第60-61页
        5.3.2 拮抗活性第61-64页
        5.3.3 对立枯丝核菌重寄生性第64-65页
        5.3.4 几丁质酶活测定第65-66页
        5.3.5 疏水性测定第66-67页
        5.3.6 疏水蛋白的基因表达第67-72页
    5.4 讨论第72-73页
第六章 野生型TH-33 及 ΔTHGA3的转录组测序和分析第73-89页
    6.1 材料第73页
        6.1.1 供试菌株第73页
    6.2 方法第73-74页
        6.2.1 取样时间的确定第73页
        6.2.2 总RNA的提取第73页
        6.2.3 cDNA文库的构建和测序第73-74页
        6.2.4 差异表达基因的分析第74页
    6.3 结果和分析第74-87页
        6.3.1 取样时间的确定第74页
        6.3.2 RNA提取及测序文库的构建第74-75页
        6.3.3 原始测序数据质量分析第75-79页
        6.3.4 基因注释和表达定量分析第79-80页
        6.3.5 差异表达基因的分析第80页
        6.3.6 差异基因聚类分析(Exp-cluster)第80-81页
        6.3.7 差异表达基因的GO富集分析第81-82页
        6.3.8 差异表达基因的KEGG代谢途径的富集分析第82-83页
        6.3.9 G蛋白信号途径相关基因的分析第83-85页
        6.3.10 细胞壁相关酶基因的差异表达第85-86页
        6.3.11 产孢调控因子第86页
        6.3.12 疏水蛋白基因第86-87页
    6.4 讨论第87-89页
第七章 全文总结第89-90页
参考文献第90-102页
致谢第102-103页
作者简历第103页

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