摘要 | 第5-7页 |
abstract | 第7-9页 |
第一章 文献综述 | 第13-25页 |
1.1 microRNA的形成及其作用机制 | 第13-14页 |
1.1.1 microRNA的发现 | 第13页 |
1.1.2 植物体中miRNA的生物合成 | 第13-14页 |
1.1.3 植物体中miRNA的作用机制 | 第14页 |
1.2 植物miRNA的研究方法进展 | 第14-19页 |
1.2.1 miRNA的鉴定标准 | 第14-15页 |
1.2.2 miRNA的鉴定方法进展 | 第15-17页 |
1.2.3 miRNA靶基因的预测和鉴定方法 | 第17-18页 |
1.2.4 miRNA功能研究方法进展 | 第18-19页 |
1.3 植物miRNA功能研究现状与进展 | 第19-22页 |
1.3.1 miRNA参与调控植物生长发育 | 第19-20页 |
1.3.2 miRNA参与植物逆境胁迫响应 | 第20-22页 |
1.4 小麦miRNA研究现状与进展 | 第22-23页 |
1.4.1 小麦miRNA的鉴定 | 第22-23页 |
1.4.2 小麦miRNA的功能研究现状 | 第23页 |
1.5 本研究的目的意义 | 第23-25页 |
第二章 基于全基因组的小麦高可信度miRNA的鉴定和表达谱分析以及miRNA调控网络构建 | 第25-54页 |
2.1 前言 | 第25页 |
2.2 实验材料 | 第25-32页 |
2.2.1 数据来源 | 第25-27页 |
2.2.2 基于Linux环境下的miRDeep-P分析鉴定miRNA | 第27-29页 |
2.2.3 基于linux系统的小麦miRNA特征分析 | 第29-30页 |
2.2.4 小麦12个不同发育时期/器官样品中miRNA丰度分析方法 | 第30页 |
2.2.5 总RNA提取及miRNA加尾反转录 | 第30-31页 |
2.2.6 miRNA表达量的实时定量PCR检测 | 第31页 |
2.2.7 miRNA靶基因预测 | 第31页 |
2.2.8 miRNA靶基因的GO分析 | 第31页 |
2.2.9 miRNA靶基因的代谢网络分析 | 第31-32页 |
2.3 结果与分析 | 第32-50页 |
2.3.1 12 个sRNA测序数据总体分析 | 第32-35页 |
2.3.2 小麦miRNA的鉴定 | 第35-39页 |
2.3.3 miRNA基因染色体定位 | 第39-40页 |
2.3.4 已知miRNA的保守性分析 | 第40页 |
2.3.5 miRNA测序丰度的定量验证及小麦组织中时空表达谱分析 | 第40-43页 |
2.3.6 营养器官和生殖器官特异表达miRNA分析 | 第43-45页 |
2.3.7 miRNA靶基因预测及功能分析 | 第45-46页 |
2.3.8 miRNA在籽粒发育过程中的表达趋势分析 | 第46-47页 |
2.3.9 miRNA及其靶基因调控网络分析 | 第47-50页 |
2.4 讨论与结论 | 第50-54页 |
2.4.1 讨论 | 第50-52页 |
2.4.2 结论 | 第52-54页 |
第三章 BSMV介导的小麦内源靶miRNA沉默体系的建立 | 第54-68页 |
3.1 前言 | 第54页 |
3.2 材料方法 | 第54-60页 |
3.2.1 试验材料 | 第54页 |
3.2.2 主要试剂 | 第54-55页 |
3.2.3 BSMV介导的载体构建 | 第55-56页 |
3.2.4 体外转录与病毒接种 | 第56-58页 |
3.2.5 总RNA提取和第一链cDNA合成 | 第58-59页 |
3.2.6 半定量及实时定量检测转录本 | 第59-60页 |
3.3 结果与分析 | 第60-65页 |
3.3.1 重组BSMV介导的插入片段在小麦叶片过表达 | 第60-61页 |
3.3.2 重组BSMV可以介导小麦内源miR156沉默 | 第61-64页 |
3.3.3 重组BSMV可以介导小麦内源miR166沉默 | 第64-65页 |
3.4 讨论与结论 | 第65-68页 |
3.4.1 讨论 | 第65-67页 |
3.4.2 结论 | 第67-68页 |
第四章 小麦中tae-miR319和tae-miR9677功能初步研究 | 第68-82页 |
4.1 前言 | 第68页 |
4.2 材料方法 | 第68-71页 |
4.2.1 试验材料 | 第68页 |
4.2.2 miRNA靶基因鉴定 | 第68-69页 |
4.2.3 病毒载体构建 | 第69页 |
4.2.4 病毒的体外转录与接种 | 第69-70页 |
4.2.5 总RNA提取和cDNA合成 | 第70-71页 |
4.2.6 目标miRNA及目标基因表达水平的实时定量PCR检测 | 第71页 |
4.3 结果分析 | 第71-79页 |
4.3.1 tae-miR319功能初步研究 | 第71-77页 |
4.3.2 tae-miR9677功能的初步研究 | 第77-79页 |
4.4 讨论与结论 | 第79-82页 |
4.4.1 讨论 | 第79-81页 |
4.4.2 结论 | 第81-82页 |
第五章 结论与展望 | 第82-84页 |
5.1 结论 | 第82页 |
5.2 展望 | 第82-84页 |
参考文献 | 第84-94页 |
附录 | 第94-136页 |
致谢 | 第136-138页 |
作者简介 | 第138页 |