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小麦不同生长发育时期miRNA的鉴定及2个穗/籽粒高表达miRNA功能的初步研究

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第一章 文献综述第13-25页
    1.1 microRNA的形成及其作用机制第13-14页
        1.1.1 microRNA的发现第13页
        1.1.2 植物体中miRNA的生物合成第13-14页
        1.1.3 植物体中miRNA的作用机制第14页
    1.2 植物miRNA的研究方法进展第14-19页
        1.2.1 miRNA的鉴定标准第14-15页
        1.2.2 miRNA的鉴定方法进展第15-17页
        1.2.3 miRNA靶基因的预测和鉴定方法第17-18页
        1.2.4 miRNA功能研究方法进展第18-19页
    1.3 植物miRNA功能研究现状与进展第19-22页
        1.3.1 miRNA参与调控植物生长发育第19-20页
        1.3.2 miRNA参与植物逆境胁迫响应第20-22页
    1.4 小麦miRNA研究现状与进展第22-23页
        1.4.1 小麦miRNA的鉴定第22-23页
        1.4.2 小麦miRNA的功能研究现状第23页
    1.5 本研究的目的意义第23-25页
第二章 基于全基因组的小麦高可信度miRNA的鉴定和表达谱分析以及miRNA调控网络构建第25-54页
    2.1 前言第25页
    2.2 实验材料第25-32页
        2.2.1 数据来源第25-27页
        2.2.2 基于Linux环境下的miRDeep-P分析鉴定miRNA第27-29页
        2.2.3 基于linux系统的小麦miRNA特征分析第29-30页
        2.2.4 小麦12个不同发育时期/器官样品中miRNA丰度分析方法第30页
        2.2.5 总RNA提取及miRNA加尾反转录第30-31页
        2.2.6 miRNA表达量的实时定量PCR检测第31页
        2.2.7 miRNA靶基因预测第31页
        2.2.8 miRNA靶基因的GO分析第31页
        2.2.9 miRNA靶基因的代谢网络分析第31-32页
    2.3 结果与分析第32-50页
        2.3.1 12 个sRNA测序数据总体分析第32-35页
        2.3.2 小麦miRNA的鉴定第35-39页
        2.3.3 miRNA基因染色体定位第39-40页
        2.3.4 已知miRNA的保守性分析第40页
        2.3.5 miRNA测序丰度的定量验证及小麦组织中时空表达谱分析第40-43页
        2.3.6 营养器官和生殖器官特异表达miRNA分析第43-45页
        2.3.7 miRNA靶基因预测及功能分析第45-46页
        2.3.8 miRNA在籽粒发育过程中的表达趋势分析第46-47页
        2.3.9 miRNA及其靶基因调控网络分析第47-50页
    2.4 讨论与结论第50-54页
        2.4.1 讨论第50-52页
        2.4.2 结论第52-54页
第三章 BSMV介导的小麦内源靶miRNA沉默体系的建立第54-68页
    3.1 前言第54页
    3.2 材料方法第54-60页
        3.2.1 试验材料第54页
        3.2.2 主要试剂第54-55页
        3.2.3 BSMV介导的载体构建第55-56页
        3.2.4 体外转录与病毒接种第56-58页
        3.2.5 总RNA提取和第一链cDNA合成第58-59页
        3.2.6 半定量及实时定量检测转录本第59-60页
    3.3 结果与分析第60-65页
        3.3.1 重组BSMV介导的插入片段在小麦叶片过表达第60-61页
        3.3.2 重组BSMV可以介导小麦内源miR156沉默第61-64页
        3.3.3 重组BSMV可以介导小麦内源miR166沉默第64-65页
    3.4 讨论与结论第65-68页
        3.4.1 讨论第65-67页
        3.4.2 结论第67-68页
第四章 小麦中tae-miR319和tae-miR9677功能初步研究第68-82页
    4.1 前言第68页
    4.2 材料方法第68-71页
        4.2.1 试验材料第68页
        4.2.2 miRNA靶基因鉴定第68-69页
        4.2.3 病毒载体构建第69页
        4.2.4 病毒的体外转录与接种第69-70页
        4.2.5 总RNA提取和cDNA合成第70-71页
        4.2.6 目标miRNA及目标基因表达水平的实时定量PCR检测第71页
    4.3 结果分析第71-79页
        4.3.1 tae-miR319功能初步研究第71-77页
        4.3.2 tae-miR9677功能的初步研究第77-79页
    4.4 讨论与结论第79-82页
        4.4.1 讨论第79-81页
        4.4.2 结论第81-82页
第五章 结论与展望第82-84页
    5.1 结论第82页
    5.2 展望第82-84页
参考文献第84-94页
附录第94-136页
致谢第136-138页
作者简介第138页

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