| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 生物信息学简介 | 第8-11页 |
| 1.1.1 生物信息学产生的背景及定义 | 第8页 |
| 1.1.2 生物信息学的研究内容 | 第8-10页 |
| 1.1.3 生物信息学的研究现状及未来发展趋势 | 第10-11页 |
| 1.2 P53基因简介 | 第11页 |
| 1.3 DNA序列的图形表示简介 | 第11-12页 |
| 1.4 本论文的主要研究内容 | 第12-14页 |
| 第二章 抑癌基因P53密码子偏好性分析 | 第14-20页 |
| 2.1 理论与方法 | 第14-15页 |
| 2.2 结果与分析 | 第15-19页 |
| 2.2.1 抑癌基因 p53 的有效密码子数及密码子的碱基 GC 含量情况 | 第15页 |
| 2.2.2 抑癌基因 p53 密码子的多重对应性分析 | 第15-16页 |
| 2.2.3 基于 RSCU 下的抑癌基因 p53 密码子使用参数的相关性分析 | 第16-17页 |
| 2.2.4 基于 QRSCU 下的抑癌基因 p53 密码子的偏好性情况分析 | 第17-18页 |
| 2.2.5 抑癌基因 p53 在病变时的密码子偏性分析 | 第18-19页 |
| 2.3 本章小结 | 第19-20页 |
| 第三章 基因签名及遗传多样性聚类分析——以外来入侵物种应用为例 | 第20-28页 |
| 3.1 材料与方法 | 第20-22页 |
| 3.1.1 基于 CGR 方法的基因签名 | 第20-21页 |
| 3.1.2 材料来源 | 第21页 |
| 3.1.3 基于 CGR 的欧式距离 | 第21-22页 |
| 3.2 结果与分析 | 第22-26页 |
| 3.2.1 碱基含量分析 | 第22页 |
| 3.2.2 CGR 方法的基因签名图 | 第22-25页 |
| 3.2.3 遗传多样性聚类分析 | 第25-26页 |
| 3.3 本章小结 | 第26-28页 |
| 第四章 基于结构聚类的 P53 多指标相似性研究 | 第28-36页 |
| 4.1 材料与方法 | 第28-32页 |
| 4.1.1 材料来源 | 第28页 |
| 4.1.2 平均功率谱 | 第28-29页 |
| 4.1.3 数字化序列 | 第29-31页 |
| 4.1.4 约束因子：海明距离 | 第31页 |
| 4.1.5 归一化距离的结构聚类 | 第31-32页 |
| 4.1.6 序列最优聚类的确定 | 第32页 |
| 4.2 结果与分析 | 第32-35页 |
| 4.3 本章小结 | 第35-36页 |
| 第五章 DNA 序列 4D 图形表示的研究与应用 | 第36-42页 |
| 5.1 材料与方法 | 第37-38页 |
| 5.1.1 材料来源 | 第37页 |
| 5.1.2 一种新的 DNA 序列 4D 图形表示方法 | 第37-38页 |
| 5.2 DNA序列的特征数值 | 第38页 |
| 5.3 物种相似性分析 | 第38-40页 |
| 5.4 本章小结 | 第40-42页 |
| 第六章 总结与展望 | 第42-44页 |
| 6.1 总结 | 第42页 |
| 6.2 展望 | 第42-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第49页 |
