| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略语/符号说明 | 第13-14页 |
| 前言 | 第14-26页 |
| 研究现状、成果 | 第14-24页 |
| 研究目的、方法 | 第24-26页 |
| 一、肝癌干细胞的拷贝数变化特征 | 第26-55页 |
| 1.1 对象和方法 | 第26-40页 |
| 1.1.1 临床样本 | 第26页 |
| 1.1.2 主要仪器和试剂 | 第26-29页 |
| 1.1.3 主要溶液配制 | 第29-30页 |
| 1.1.4 主要引物序列 | 第30页 |
| 1.1.5 实验方法 | 第30-40页 |
| 1.2 结果 | 第40-51页 |
| 1.2.1 流式细胞仪分选人新鲜肝癌组织中的CD44+CD90+干细胞 | 第40-42页 |
| 1.2.2 单个肿瘤干细胞挑选 | 第42-43页 |
| 1.2.3 MALBAC扩增后样品质检以及全基因组文库质检 | 第43-44页 |
| 1.2.4 肝癌干细胞球拷贝数变化模式具有异质性 | 第44-46页 |
| 1.2.5 肝癌干细胞及肝癌细胞大部分拷贝数变化模式高度一致 | 第46-47页 |
| 1.2.6 肝癌中细胞拷贝数变化遵循渐进化演变模式 | 第47-48页 |
| 1.2.7 肝癌中存在正常肝干细胞 | 第48-51页 |
| 1.3 讨论 | 第51-54页 |
| 1.3.1 利用表面标记物CD44和CD90筛选肝癌干细胞 | 第51-52页 |
| 1.3.2 肝癌干细胞存在异质性且肝癌细胞进化遵循渐进进化模式 | 第52-53页 |
| 1.3.3 肝癌中存在正常干细胞 | 第53-54页 |
| 1.4 小结 | 第54-55页 |
| 二、肝细胞癌肝内转移的基因组研究 | 第55-80页 |
| 2.1 对象和方法 | 第55-63页 |
| 2.1.1 临床样本 | 第55页 |
| 2.1.2 主要仪器和试剂 | 第55-57页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第57-63页 |
| 2.2 结果 | 第63-75页 |
| 2.2.1 显微切割收集肿瘤组织和非肿瘤组织 | 第63-64页 |
| 2.2.2 10例肝细胞肝癌患者单核苷酸位点突变（SNP）的特征 | 第64-68页 |
| 2.2.3 10例肝细胞肝癌患者中高频突变 | 第68-69页 |
| 2.2.4 不同患者病灶间全基因组拷贝数变化分析 | 第69-75页 |
| 2.3 讨论 | 第75-78页 |
| 2.3.1 采用显微切割技术精确分离肝内转移多个病灶，结合高通量测序进行分析 | 第75-76页 |
| 2.3.2 肝细胞肝癌患者基因组单核苷酸突变特征 | 第76-78页 |
| 2.3.3 肝细胞肝癌患者基因组拷贝数变化特征 | 第78页 |
| 2.4 小结 | 第78-80页 |
| 三、循环肿瘤细胞基因组变化揭示肿瘤进化及转移方式 | 第80-103页 |
| 3.1 对象和方法 | 第80-84页 |
| 3.1.1 临床样本 | 第80页 |
| 3.1.2 主要仪器和试剂 | 第80-82页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第82-84页 |
| 3.2 结果 | 第84-95页 |
| 3.2.1 单个CTC和原位肿瘤细胞分离 | 第84-86页 |
| 3.2.2 结肠癌原位肿瘤细胞与循环肿瘤细胞单核苷酸变异分析 | 第86页 |
| 3.2.3 结肠癌原位肿瘤细胞与循环肿瘤细胞拷贝数变化分析 | 第86-87页 |
| 3.2.4 不同肿瘤类型循环肿瘤细胞拷贝数变异分析 | 第87-90页 |
| 3.2.5 前列腺癌循环肿瘤细胞单核苷酸变异分析 | 第90-91页 |
| 3.2.6 不同肿瘤类型循环肿瘤细胞单核苷酸变异分析 | 第91-95页 |
| 3.3 讨论 | 第95-102页 |
| 3.3.1 循环肿瘤细胞的分离方法 | 第95-96页 |
| 3.3.2 原位肿瘤细胞与CTCs中拷贝数变化模式为有选择的连续进化 | 第96-97页 |
| 3.3.3 结肠癌原位肿瘤细胞与CTCs中单核苷酸变化模式为随机分散模式 | 第97-98页 |
| 3.3.4 不同类型癌症中拷贝数变化模式具有癌种特异性 | 第98-100页 |
| 3.3.5 不同类型癌症中单核苷酸突变分析在循环肿瘤细胞中富集ECM相关基因 | 第100-102页 |
| 3.4 小结 | 第102-103页 |
| 全文结论 | 第103-104页 |
| 论文创新点 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-116页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第116-117页 |
| 综述 单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用 | 第117-141页 |
| 综述参考文献 | 第132-141页 |
| 致谢 | 第141-142页 |
| 个人简历 | 第142页 |
